Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F56 I0 R1
|
312 |
170.3 |
8276235 |
93.7% |
7754832 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,759,132 |
A→G |
55.5% |
I50V (ATT→GTT) |
yfjI → |
CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,759,132 | 0 | A | G | 55.5%
| 83.1
/ 225.0
| 195 | I50V (ATT→GTT) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/38); new base G (50/58); total (99/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
AGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATAAAC > NC_000913/2759033‑2759228
|
aGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGa > 1:1487043/1‑100 (MQ=255)
gAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGtt < 1:1066403/100‑1 (MQ=255)
gAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGtt < 2:2080484/100‑1 (MQ=255)
aTGCAATTTATGAAGTGGAACAGCCTACGCAGGCCCCTCAAGTTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGa < 2:359178/100‑1 (MQ=255)
aTGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGa > 1:1433199/1‑100 (MQ=255)
tGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGAt > 2:1203410/1‑100 (MQ=255)
gCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATg > 1:461258/1‑100 (MQ=255)
cAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGt > 2:649724/1‑100 (MQ=255)
cAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGt > 1:2228534/1‑100 (MQ=255)
aTTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGttt > 2:2238931/1‑100 (MQ=255)
aTTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGttt < 1:1228269/100‑1 (MQ=255)
tATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGcc < 2:322661/100‑1 (MQ=255)
tATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGcc < 1:3469689/100‑1 (MQ=255)
tATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGcc > 1:2584187/1‑100 (MQ=255)
aTGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCg > 2:551385/1‑100 (MQ=255)
tGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGa < 1:960576/100‑1 (MQ=255)
tGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGa > 2:177506/1‑100 (MQ=255)
gAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGAt > 2:3175530/1‑100 (MQ=255)
aaGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGAtt > 2:3651773/1‑100 (MQ=255)
aaGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGAtt > 1:3328036/1‑100 (MQ=255)
aGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGAtt > 2:2518189/1‑99 (MQ=255)
aGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTg < 2:229306/100‑1 (MQ=255)
gTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTACTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGa > 1:3177403/1‑100 (MQ=255)
gTGGAACAGCATACGCAGGCCCATCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCGCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTg < 2:3337676/99‑1 (MQ=255)
tGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTg < 2:1057822/98‑1 (MQ=255)
tGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaa < 1:3278170/100‑1 (MQ=255)
tGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGaa < 2:892007/100‑1 (MQ=255)
ggAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaat > 1:2190044/1‑100 (MQ=255)
ggAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaat > 2:3919572/1‑100 (MQ=255)
ggAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGaat > 1:850612/1‑100 (MQ=255)
gAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGgata > 1:3428982/1‑100 (MQ=255)
gAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGaata < 1:3121920/100‑1 (MQ=255)
aaCAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaataa > 2:3804663/1‑100 (MQ=255)
ncAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTCTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGaataat > 2:1444090/2‑100 (MQ=255)
aGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCt > 1:4077477/1‑100 (MQ=255)
cATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTAc > 1:3845394/1‑100 (MQ=255)
cATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTAc > 2:1952474/1‑100 (MQ=255)
aTACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACg < 1:53756/100‑1 (MQ=255)
tACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGt > 2:1683094/1‑100 (MQ=255)
aCGCCGGCCAATCAATGTTTGATCGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTCCTCTTGCCTCTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCtg < 2:2462122/96‑2 (MQ=255)
cGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTgg > 1:3561128/1‑100 (MQ=255)
cGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTgg > 1:2263259/1‑100 (MQ=255)
aGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGccc < 2:794080/100‑1 (MQ=255)
gCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCgg > 1:3667309/1‑100 (MQ=255)
ccccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGt > 2:1333513/1‑100 (MQ=255)
cccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTa < 2:2762111/100‑1 (MQ=255)
ccTCAATGTTTGATTGCTGCTTCTGCTATTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCg < 2:2700374/96‑1 (MQ=255)
ccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGt > 2:2029308/1‑98 (MQ=255)
ccTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTAt > 2:1551452/1‑100 (MQ=255)
cTCAACGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGTGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGCTTGCATACTCTACGTGGCTCGCTAt > 2:3893249/1‑99 (MQ=255)
tCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCa > 1:1597830/1‑100 (MQ=255)
aaGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACt > 1:2664170/1‑100 (MQ=255)
ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt > 2:338474/1‑100 (MQ=255)
ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt > 1:1177088/1‑100 (MQ=255)
ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt > 2:3463051/1‑100 (MQ=255)
ggTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCCATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACttt < 1:3919598/100‑1 (MQ=255)
gTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACtttt < 1:3255420/100‑1 (MQ=255)
tttGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTc < 1:2140189/100‑1 (MQ=255)
tGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCtt < 2:2657871/100‑1 (MQ=255)
gATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTTCTGTCTCTTGCCTGTAAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGCTTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTa < 2:973396/100‑1 (MQ=255)
gATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGTCCCGGTATCACTTTTCTTa < 2:469118/100‑1 (MQ=255)
aTTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTaa < 1:3463073/100‑1 (MQ=255)
aTTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTaa > 1:3568920/1‑100 (MQ=255)
tgctgcTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATg < 2:1900668/100‑1 (MQ=255)
tgctgcTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATg < 1:2317027/100‑1 (MQ=255)
gctTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGActc < 2:864059/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCt < 1:819738/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCt < 1:2063820/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCt < 2:314718/100‑1 (MQ=255)
tGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTCCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTAAATCATCTACGTGGCCCGCTATCACTTTTCTTAATAACTCTgc > 2:800610/1‑97 (MQ=255)
gCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTg < 2:1177080/100‑1 (MQ=255)
ctctTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTg > 2:3664426/1‑99 (MQ=255)
tGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCATAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCa < 2:628010/100‑1 (MQ=255)
tGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCa < 1:2547912/100‑1 (MQ=255)
tGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCa < 1:976180/100‑1 (MQ=255)
tGGGGTAATTTCTCTTGACTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCACGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGTTGAATCa > 2:2183860/1‑100 (MQ=255)
ggggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAg < 2:1057478/100‑1 (MQ=255)
ggggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAg < 2:3742590/100‑1 (MQ=255)
ggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGt > 1:2004455/1‑100 (MQ=255)
ggTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGt < 1:2483006/100‑1 (MQ=255)
aTTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAAc > 2:1641556/1‑100 (MQ=255)
tttCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACg > 1:3947663/1‑100 (MQ=255)
tttCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACg > 2:2431406/1‑100 (MQ=255)
tttCTCTTGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACg < 1:2408500/100‑1 (MQ=255)
tctTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAag < 1:2996293/100‑1 (MQ=255)
tGCCTGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTTGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGt > 2:67787/1‑100 (MQ=255)
tGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATACTCTACGTGGCCCGGTATCAATTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTaa > 2:4050418/1‑96 (MQ=255)
tGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGt > 1:717026/1‑100 (MQ=255)
tGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGt > 1:1522108/1‑100 (MQ=255)
tGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATGATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACgg > 2:2734020/1‑100 (MQ=255)
tGTCAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACgg < 1:1369666/100‑1 (MQ=255)
cAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTg > 1:1056560/1‑100 (MQ=255)
cAGAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTg < 1:605074/100‑1 (MQ=255)
cAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTg > 1:3192360/1‑100 (MQ=255)
gAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGa > 2:1616276/1‑99 (MQ=255)
gAACCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGAt > 2:376718/1‑100 (MQ=255)
aaCCGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATa < 1:1752836/100‑1 (MQ=255)
ccGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATaaa > 1:1864374/1‑100 (MQ=255)
ccGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATaaa > 1:3538516/1‑100 (MQ=255)
cGGGTTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATAAAc < 1:659095/100‑1 (MQ=255)
|
AGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAGTACGGTTGATAAAC > NC_000913/2759033‑2759228
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
