Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F56 I0 R1
|
312 |
170.3 |
8276235 |
93.7% |
7754832 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,727,880 |
T→C |
54.7% |
intergenic (‑132/+37) |
yiaB ← / ← xylB |
YiaAB family inner membrane protein/xylulokinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,727,880 | 0 | T | C | 54.7%
| 44.9
/ 187.5
| 155 | intergenic (‑132/+37) | yiaB/xylB | YiaAB family inner membrane protein/xylulokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/36); new base C (36/48); total (71/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.88e-01 |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGA > NC_000913/3727781‑3727977
|
gAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGAtgt > 2:3076429/1‑100 (MQ=255)
tAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGaa < 1:1686544/100‑1 (MQ=255)
aaCCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAAt < 2:232465/100‑1 (MQ=255)
aaCCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTAAGATATATAGATGTGa > 2:3687964/1‑98 (MQ=255)
ccAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTa > 1:2711903/1‑100 (MQ=255)
aaCGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCCTTAACAAAAGATTTTCCGAATAAATGCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATc > 1:3196283/1‑100 (MQ=255)
aaCGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATc > 1:32120/1‑100 (MQ=255)
aCGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATcc > 1:2071722/1‑100 (MQ=255)
cGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATctc < 1:2809909/100‑3 (MQ=255)
aaGACAAAACTAAAAAATTCCAATAACAAATAATTTTCAGAATAAATTCACACTATATAATAAGTAATTACTGTGATTTATATAGGCGAATTAGcccc < 2:2459742/98‑1 (MQ=255)
aGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCAc < 1:2216605/100‑1 (MQ=255)
aCAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCAccc > 1:1547981/1‑100 (MQ=255)
aaaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCgg < 2:503390/100‑1 (MQ=255)
aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATGTTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGt > 1:3549511/1‑100 (MQ=255)
aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGt > 2:4090898/1‑100 (MQ=255)
aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGt > 2:534506/1‑100 (MQ=255)
aaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTc > 2:1682542/1‑100 (MQ=255)
aCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTca < 1:593926/100‑1 (MQ=255)
cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcag > 1:3927071/1‑100 (MQ=255)
cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcag < 1:7634/100‑1 (MQ=255)
cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcag > 1:3719442/1‑100 (MQ=255)
cTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGAGAATTATCCCCCACACGGTcag > 1:3867064/1‑100 (MQ=255)
tGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTcagg > 1:867368/1‑100 (MQ=255)
tGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTcagg < 1:1158694/100‑1 (MQ=255)
tGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTcagg > 1:615504/1‑100 (MQ=255)
gAAAAATGCCATTAAAAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATATATGCGAATTATCCACCACACGGTcag > 2:1610539/1‑98 (MQ=255)
aaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAggg < 1:3021631/100‑1 (MQ=255)
aaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAggg < 2:1046516/100‑1 (MQ=255)
aaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAggg < 1:482669/100‑1 (MQ=255)
aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAgggg < 2:2184177/100‑1 (MQ=255)
aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAgggg > 1:1133106/1‑100 (MQ=255)
aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAgggg > 1:1852515/1‑100 (MQ=255)
tGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGa < 2:2035743/100‑1 (MQ=255)
ccATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTTAATATTAATTAATTCCTGAGAAATATAGATTTAATTTATCCCCCACCCTGTCAGCCATGGGAt > 2:1591654/1‑99 (MQ=255)
aaCAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGtt > 2:1488805/1‑100 (MQ=255)
aaCAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGtt > 2:1078072/1‑100 (MQ=255)
cAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGTAGGGGATAACGTTTa > 1:3516415/1‑100 (MQ=255)
cAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTa > 1:1754236/1‑100 (MQ=255)
cAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTa > 1:806412/1‑100 (MQ=255)
aaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATAATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACg > 1:2905457/1‑100 (MQ=255)
aTGATTTTCAGAATAAATTCATACTACATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCACCCACCCGGTCAGTCAGGGGATAACGTTTACGc > 2:3035819/1‑100 (MQ=255)
aTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTAcn < 2:1520234/99‑2 (MQ=255)
aTTTTCAGAATAAGTTCATACTAATTATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCAt < 1:3261470/100‑1 (MQ=255)
aTTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCAt < 2:2854514/100‑1 (MQ=255)
ttCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTTCGCCAtt > 2:309504/1‑98 (MQ=255)
tCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCAACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAAt > 2:1550480/1‑100 (MQ=255)
tCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAAt > 1:2918892/1‑100 (MQ=255)
cAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATg < 2:70638/100‑1 (MQ=255)
aGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATATATTTGAATTATAACCCACACTGTTAAGCAGAGGATAACGTTTAAGCCATTAAtag > 2:3806122/1‑98 (MQ=255)
gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc > 2:2069154/1‑100 (MQ=255)
gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc > 1:798354/1‑100 (MQ=255)
gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACGGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTGTACGCCATTAATGGc < 2:393706/100‑1 (MQ=255)
aaTCAATTCATACTACATATTAATTAATTACTGAGATATTTAGATACGAATTATACACCAGCCTGTTAGGCAGCGGATGAATTTTACGCCATTaa > 2:1959245/1‑95 (MQ=255)
aaTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc > 1:1362898/1‑99 (MQ=255)
aaTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGc < 2:2624499/99‑1 (MQ=255)
aaTAAATTCATACTAAATATAAATTAATTACTGACATATATAGATGTGATTTATCCCCCACCCGGTAAGGCAGGGGATAACGTATACGTCATTAATgg < 2:1906608/98‑1 (MQ=255)
aTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAg < 2:1329459/100‑1 (MQ=255)
aTAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAg < 2:1054436/100‑1 (MQ=255)
aaaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGaa < 2:186351/100‑1 (MQ=255)
aaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGGAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAg > 2:2667383/1‑100 (MQ=255)
tCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTg < 2:690799/100‑1 (MQ=255)
cATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGc < 2:4049009/100‑1 (MQ=255)
aTACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGc < 1:4109204/99‑1 (MQ=255)
aTACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATGATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCt < 1:346275/100‑1 (MQ=255)
aCTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGa < 1:513742/100‑1 (MQ=255)
aCTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGa < 1:1259277/100‑1 (MQ=255)
tAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATa > 2:1547766/1‑100 (MQ=255)
tAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGAGGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGTGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGAt < 2:814916/99‑1 (MQ=255)
aaTATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATaga < 1:3584097/100‑1 (MQ=255)
atatTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATagag < 1:2814456/100‑1 (MQ=255)
tatTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAgg > 2:3982254/1‑100 (MQ=255)
attaattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGc < 1:3767592/100‑1 (MQ=255)
atgaattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGc < 2:1152848/97‑1 (MQ=255)
ttaattaattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCg < 1:3275805/100‑1 (MQ=255)
aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGGAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 1:2667399/100‑1 (MQ=255)
aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 1:2386763/100‑1 (MQ=255)
aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 2:1670045/100‑1 (MQ=255)
aattaattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGAc < 2:65260/100‑1 (MQ=255)
attaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg > 2:3640253/1‑100 (MQ=255)
attaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGAGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg < 2:3391182/100‑1 (MQ=255)
attaattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg > 1:496314/1‑100 (MQ=255)
taattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGa < 1:1093591/100‑1 (MQ=255)
taattaCTGAGATATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGa > 1:4047081/1‑100 (MQ=255)
cTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGttt > 1:842297/1‑100 (MQ=255)
tGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtc < 2:1161495/100‑1 (MQ=255)
gagaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtct > 1:1794830/1‑100 (MQ=255)
gagaTATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtct < 1:2069167/100‑1 (MQ=255)
gaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcg < 2:32120/100‑1 (MQ=255)
gaTATATAGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcg < 2:798348/100‑1 (MQ=255)
tatataGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcgtc > 1:1441578/1‑100 (MQ=255)
tatataGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcgtc > 1:2351358/1‑100 (MQ=255)
atataGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGTATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCtcgtcg < 2:3477152/100‑1 (MQ=255)
tataGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt < 2:3253024/100‑1 (MQ=255)
tataGATGCGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt < 1:1894145/100‑1 (MQ=255)
ctaGATGTGAATTATCCCCCACACGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCCTTAATGGCAGAAGTTGCCGAAAGAGGCGACGAAACGTTCCtcgcagtg > 2:1422389/2‑95 (MQ=255)
taGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTgg < 2:1309442/100‑1 (MQ=255)
taGATGTGAATTATCCCCCACCCCGTCAGGCAGGGGATAACGTCTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACCGAACGTTTCTCGTCGTgg < 2:2770286/100‑1 (MQ=255)
aGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGc > 2:4133072/1‑100 (MQ=255)
gATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGc < 2:1582984/99‑1 (MQ=255)
tgtgAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGa > 2:953852/1‑100 (MQ=255)
|
GAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGA > NC_000913/3727781‑3727977
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
