Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F133 I1 R1
|
102 |
83.9 |
4092546 |
96.1% |
3932936 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,720,828 |
C→T |
intergenic (‑4/‑197) |
slyA ← / → ydhI |
global transcriptional regulator/DUF1656 family putative inner membrane efflux pump associated protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,720,828 | 0 | C | T | 97.9%
| 335.5
/ ‑2.3
| 96 | intergenic (‑4/‑197) | slyA/ydhI | global transcriptional regulator/DUF1656 family putative inner membrane efflux pump associated protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (47/47); total (48/48) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 |
TTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTGGTT > NC_000913/1720731‑1720923
|
tttGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTAt < 1:279475/100‑1 (MQ=255)
ttGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTAtc < 1:1350396/100‑1 (MQ=255)
tgtgTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTAtct < 1:192742/100‑1 (MQ=255)
gtgtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTAtctc > 2:907086/1‑100 (MQ=255)
gtgtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTAtctc > 2:282701/1‑100 (MQ=255)
gtgtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTAtctc > 1:189098/1‑100 (MQ=255)
tgtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTcc > 1:51499/1‑100 (MQ=255)
tgtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTcc > 1:1668683/1‑100 (MQ=255)
tgtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTcc < 1:1809274/100‑1 (MQ=255)
gtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCt > 1:1034869/1‑100 (MQ=255)
gtTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCt > 2:1182756/1‑100 (MQ=255)
aaCTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTtat < 2:1984120/100‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTtata < 2:2006257/100‑1 (MQ=255)
tCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAAt < 2:1278025/100‑1 (MQ=255)
gCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGc < 2:256418/100‑1 (MQ=255)
tttCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGc > 2:1770819/1‑100 (MQ=255)
tttCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGc < 1:1492880/100‑1 (MQ=255)
ttCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCGGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCt > 1:1779201/1‑100 (MQ=255)
tCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTa < 2:1668670/100‑1 (MQ=255)
aGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAg > 2:2000273/1‑100 (MQ=255)
ggCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGa > 2:72345/1‑100 (MQ=255)
ggCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGa > 2:1317837/1‑100 (MQ=255)
ggCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGa > 2:336286/1‑100 (MQ=255)
gCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGat < 1:1502459/100‑1 (MQ=255)
tGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGAtatta < 2:232304/100‑1 (MQ=255)
tGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGAtatta < 2:232497/100‑1 (MQ=255)
tGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGAtatta > 2:1747626/1‑100 (MQ=255)
ggTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGAtattat > 1:300843/1‑100 (MQ=255)
gTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAACTAGCTTGCTAAGAtattacg < 2:582987/100‑3 (MQ=255)
tCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCt > 1:1027923/1‑100 (MQ=255)
cAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCtt < 1:72345/100‑1 (MQ=255)
cAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCtt > 2:274921/1‑100 (MQ=255)
agagCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCttt > 1:1764989/1‑100 (MQ=255)
agagCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCttt > 1:1387169/1‑100 (MQ=255)
gagCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCtttt < 1:2033274/100‑1 (MQ=255)
agCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTa < 1:907090/100‑1 (MQ=255)
gCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAg < 2:1240917/100‑1 (MQ=255)
gCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAg < 1:1140081/100‑1 (MQ=255)
gCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAg < 2:51499/100‑1 (MQ=255)
aCGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAg < 2:758284/98‑1 (MQ=255)
aCGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGaa > 2:1305660/1‑100 (MQ=255)
cGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAAt < 2:201698/100‑1 (MQ=255)
cGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAAt > 2:377664/1‑100 (MQ=255)
ccATATGCGCACCAACTGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAg < 2:1199806/100‑1 (MQ=255)
ccATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAg > 2:1417707/1‑100 (MQ=255)
ccATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAg > 2:574170/1‑100 (MQ=255)
atatGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAgtg < 1:498324/100‑1 (MQ=255)
atGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGtgtg > 1:1898083/1‑100 (MQ=255)
tGCGCACCCACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgc < 1:1452914/100‑1 (MQ=255)
tGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgc < 2:211645/100‑1 (MQ=255)
tGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgc < 1:24690/100‑1 (MQ=255)
tGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgc > 1:662441/1‑100 (MQ=255)
gcgcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgca > 2:2043992/1‑100 (MQ=255)
gcgcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgca > 2:445463/1‑100 (MQ=255)
gcgcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgca < 1:1625285/100‑1 (MQ=255)
ngcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcag > 2:1209790/2‑100 (MQ=255)
cgcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcag > 1:1630235/1‑100 (MQ=255)
cgcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcag < 1:336287/100‑1 (MQ=255)
cgcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcag > 1:1535224/1‑100 (MQ=255)
gcACCAACCGTGCCAGATCGGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcagc < 2:1779186/100‑1 (MQ=255)
gcACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcag < 2:1647054/99‑1 (MQ=255)
cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcagca > 1:1353574/1‑100 (MQ=255)
cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTgcagca > 1:1901754/1‑100 (MQ=255)
aCCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCaa > 1:64854/1‑100 (MQ=255)
aaCCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTg < 1:445464/100‑1 (MQ=255)
aaCCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTg < 2:189097/100‑1 (MQ=255)
aCCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGt > 1:444012/1‑100 (MQ=255)
cGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTAt > 2:1448434/1‑100 (MQ=255)
tGCCAGATTAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTg < 2:1898065/100‑1 (MQ=255)
tGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTg > 1:455244/1‑100 (MQ=255)
gCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGc < 1:1358537/100‑1 (MQ=255)
ccAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCt < 2:1480616/100‑1 (MQ=255)
ccAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCt < 1:270837/100‑1 (MQ=255)
ccAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGAGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCt > 2:1438353/1‑100 (MQ=255)
cAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTa > 1:1569379/1‑100 (MQ=255)
cAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTa < 1:262541/100‑1 (MQ=255)
aTCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTaaaa > 1:265077/1‑100 (MQ=255)
aTCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTaaaa < 1:18220/100‑1 (MQ=255)
aTCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTaaaa > 1:468506/1‑100 (MQ=255)
aTCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTaaaa > 2:1504586/1‑100 (MQ=255)
cAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACa < 1:1770833/100‑1 (MQ=255)
aGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACaa < 2:1366783/100‑1 (MQ=255)
gAACCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACaaa < 2:1357625/100‑1 (MQ=255)
aCCTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATg < 2:150703/100‑1 (MQ=255)
cTAGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATg < 2:1027918/98‑1 (MQ=255)
aGTGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTAtt > 2:62717/1‑100 (MQ=255)
tGGCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATtgc < 1:1747640/100‑1 (MQ=255)
ggCGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATtgct > 2:1555498/1‑100 (MQ=255)
cGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGATTATTGTGCAGCAATTTTATTGCTAAAACAAATGTATttcttc > 2:1971620/1‑98 (MQ=255)
cGATTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATtgctgc < 1:274922/100‑1 (MQ=255)
aTTCCAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCAt < 2:1694347/100‑1 (MQ=255)
ccAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTg > 1:1660178/1‑100 (MQ=255)
ccAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTg > 1:1804247/1‑100 (MQ=255)
cAATTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTgg > 2:1964287/1‑100 (MQ=255)
aaTTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTGGt < 2:1034864/100‑1 (MQ=255)
aTTTTATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTGGtt > 1:250628/1‑100 (MQ=255)
|
TTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCTAAGATATTATGCGGCTTTTAGAATAGTGTGCAGCAATTGTATTGCTAAAACAAATGTATTGCTGCATTTGGTT > NC_000913/1720731‑1720923
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
