Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
157 |
93.7 |
2947622 |
98.1% |
2891617 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,894,752 |
T→C |
intergenic (‑21/‑53) |
yoaH ← / → pabB |
UPF0181 family protein/aminodeoxychorismate synthase, subunit I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,894,752 | 0 | T | C | 99.1%
| 414.8
/ NA
| 111 | intergenic (‑21/‑53) | yoaH/pabB | UPF0181 family protein/aminodeoxychorismate synthase, subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (60/50); minor base A (1/0); total (61/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ACGCAGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGTTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGAT > NC_000913/1894606‑1894899
|
aGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTa < 1:1091861/151‑1 (MQ=255)
tcttctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAatt > 1:890422/1‑151 (MQ=255)
tctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAattat < 2:1012196/150‑1 (MQ=255)
tctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAatta < 1:1395772/149‑1 (MQ=255)
tctGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAatt < 1:575457/148‑1 (MQ=255)
gCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCa < 1:215211/151‑1 (MQ=255)
ccaccaGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCa < 2:600803/150‑1 (MQ=255)
caccaGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCAt > 1:866417/1‑150 (MQ=255)
caccaGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATg > 2:1166213/1‑151 (MQ=255)
caGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTa < 2:1068455/151‑1 (MQ=255)
aGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTAc < 1:1285693/151‑1 (MQ=255)
gcgATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCg > 1:759898/1‑151 (MQ=255)
cgATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCgg < 2:421080/151‑1 (MQ=255)
aTTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGc > 2:357701/1‑150 (MQ=255)
ttGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGcac > 2:348797/1‑151 (MQ=255)
cagCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGca > 2:944621/3‑150 (MQ=255)
tGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGcac > 1:1067616/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGcaca < 2:1135308/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACAt > 2:1264749/1‑151 (MQ=255)
ccTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATa < 1:1349062/151‑1 (MQ=255)
tGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGc > 1:754486/1‑151 (MQ=255)
ggCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGcc < 1:1120556/151‑1 (MQ=255)
gCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCa < 1:1259095/151‑1 (MQ=255)
cGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGt > 1:1362362/1‑151 (MQ=255)
gctCATCCCTTGTGCCTTCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAAGTATTGCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag < 2:798939/149‑1 (MQ=255)
gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTagag < 1:408128/151‑1 (MQ=255)
gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag > 1:685383/1‑149 (MQ=255)
gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag > 1:866587/1‑149 (MQ=255)
gctCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTag > 1:45880/1‑149 (MQ=255)
cATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCa < 1:618750/151‑1 (MQ=255)
aTCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTc > 2:1176106/1‑149 (MQ=255)
tCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAgg > 1:253606/1‑151 (MQ=255)
cccTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGa < 2:1323199/151‑1 (MQ=255)
ccTCGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAACCATTGTTAACCCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCTCATAGCCAGTAGAGTCAgg < 2:117041/149‑1 (MQ=255)
tgtgCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACt < 2:883701/149‑1 (MQ=255)
tgCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCCGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACtgat > 2:447152/1‑150 (MQ=255)
ccATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACGGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGaa < 1:913312/151‑1 (MQ=255)
aTCAGTTCCTGGATTCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATGTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGa < 2:1307417/151‑1 (MQ=255)
cAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACg > 2:296492/1‑151 (MQ=255)
aGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGt > 1:699938/1‑151 (MQ=255)
aGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGt > 1:489377/1‑151 (MQ=255)
gTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCCGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGtt > 1:293665/1‑151 (MQ=255)
ccTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTAtc > 2:158402/1‑151 (MQ=255)
aTCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCg > 1:221976/1‑151 (MQ=255)
ccGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCt < 2:814515/151‑1 (MQ=255)
cGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtg > 2:1186996/1‑151 (MQ=255)
cGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtg < 1:984259/151‑1 (MQ=255)
gCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtgt > 2:1471265/1‑151 (MQ=255)
cTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCtgtg > 1:1410585/1‑151 (MQ=255)
cGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAt < 2:789287/151‑1 (MQ=255)
aGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttact > 1:426864/1‑151 (MQ=255)
gCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttactt > 1:1106350/1‑151 (MQ=255)
tttttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttacttt > 2:653639/1‑150 (MQ=255)
ttttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGACGACGTTATCTCCCGCTGTGAttacttta > 2:331425/1‑150 (MQ=255)
tttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGAttactttact > 1:481271/1‑151 (MQ=255)
ttGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTActc > 1:1213297/1‑151 (MQ=255)
gctgctGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTActct < 1:944710/150‑1 (MQ=255)
gctgctGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTg > 2:287620/1‑151 (MQ=255)
gctgctGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTg < 1:194792/151‑1 (MQ=255)
tgctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGc > 1:53358/1‑151 (MQ=255)
tgctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGc > 1:239742/1‑151 (MQ=255)
gctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTgg < 1:528124/149‑1 (MQ=255)
gctgTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGc < 2:866499/150‑1 (MQ=255)
tCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAgg > 2:1384464/1‑151 (MQ=255)
tCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAgg > 1:1001498/1‑151 (MQ=255)
gggTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGAcg < 1:180573/150‑1 (MQ=255)
gtgagtgaAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGAcgccg > 2:923816/1‑151 (MQ=255)
aaGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAAtt > 1:1100560/1‑151 (MQ=255)
ggTAAACCTGCAAACATAGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTATAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTATCGCTGCTTTACTCTCGCGTCATGACGCCGCTGAGtttt < 2:460122/151‑1 (MQ=255)
tAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAt > 2:1111027/1‑151 (MQ=255)
aaaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAtt > 1:759986/1‑151 (MQ=255)
aaaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAtt > 2:197415/1‑151 (MQ=255)
aaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAttt > 1:596287/1‑151 (MQ=255)
aaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAttt < 2:430711/151‑1 (MQ=255)
aaCCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTAttt > 1:890594/1‑151 (MQ=255)
ccTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTtct > 1:673324/1‑151 (MQ=255)
gCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTtctc < 1:166649/149‑1 (MQ=255)
cAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCg < 1:1314991/151‑1 (MQ=255)
cAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCg > 2:410795/1‑151 (MQ=255)
cAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCg < 1:469912/151‑1 (MQ=255)
aaCATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCt > 2:1275006/1‑151 (MQ=255)
aCATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCtt < 1:331467/151‑1 (MQ=255)
cATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTa < 2:614066/151‑1 (MQ=255)
cATTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTa < 2:890334/151‑1 (MQ=255)
aTTGTTAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTaa < 1:389797/151‑1 (MQ=255)
ttAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGcc > 2:1472444/1‑150 (MQ=255)
ttAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATCATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACGCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGcc < 1:111937/150‑1 (MQ=255)
tAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCAc > 2:1395047/1‑151 (MQ=255)
tAACTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCAc > 1:1082308/1‑151 (MQ=255)
tAACTCCTGCTAAATTGATGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCa > 1:996018/1‑150 (MQ=255)
aaCTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTAACCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCAcc > 2:161337/1‑151 (MQ=255)
aCTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCt < 1:1264850/151‑1 (MQ=255)
cTCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTg > 2:439765/1‑151 (MQ=255)
tCCTGCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGc > 2:1315298/1‑151 (MQ=255)
gCTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCCCCTGCCGTg < 2:1025088/151‑1 (MQ=255)
cTAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTgg > 1:448812/1‑151 (MQ=255)
tAAATTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGt < 2:65803/148‑1 (MQ=255)
aaaTTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGc < 2:1285539/151‑1 (MQ=255)
aaTTGCTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCg < 2:685307/151‑1 (MQ=255)
ttgctgGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGAt > 1:982451/1‑151 (MQ=255)
|
ACGCAGCTCTTCTGCCACCAGCGCGATTGCCTGGCCGCTGCTCATCCCTTGTGCCATCAGTTCCTGGATCCGCTCGACAGCTTTTTGCTGCTGTTCATGGGTGAGTGAAGGTAAACCTGCAAACATTGTTAACTCCTGCTAAATTGTTGGCGCTAATTATTTCATGCTACCCGGCACATAGCCAGTAGAGTCAGGACTGATGAAGACGTTATCTCCCGCTGTGATTACTTTACTCTGGCGTCAGGACGCCGCTGAATTTTATTTCTCCCGCTTAAGCCACCTGCCGTGGGCGAT > NC_000913/1894606‑1894899
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
