Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
157 |
93.7 |
2947622 |
98.1% |
2891617 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,922,198 |
A→G |
E26E (GAA→GAG) |
yebW → |
uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,922,198 | 0 | A | G | 100.0%
| 323.6
/ NA
| 86 | E26E (GAA→GAG) | yebW | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/44); total (42/44) |
GGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAACAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCC > NC_000913/1922056‑1922343
|
ggTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAgt < 1:815599/150‑1 (MQ=255)
ggTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAgt < 2:573186/150‑1 (MQ=255)
ttATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTc > 1:663491/1‑151 (MQ=255)
aTTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCtt < 1:745009/151‑1 (MQ=255)
tCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCttt < 1:312807/150‑1 (MQ=255)
cccccGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTAt < 2:95207/151‑1 (MQ=255)
cGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCt > 2:25814/1‑150 (MQ=255)
cGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTa < 1:1225726/151‑1 (MQ=255)
ttGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATg > 2:1386888/1‑151 (MQ=255)
ttGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATg > 2:1453753/1‑151 (MQ=255)
tGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATg < 1:681357/150‑1 (MQ=255)
gTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATg > 1:1118380/1‑149 (MQ=255)
aaTCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGAt < 2:736952/151‑1 (MQ=255)
ctctcCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCa > 1:470470/1‑150 (MQ=255)
ctcCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCa < 1:125006/148‑1 (MQ=255)
tAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATc > 2:1273315/1‑151 (MQ=255)
aaaCTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGAt < 2:933866/149‑1 (MQ=255)
aaaCTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATcc < 2:550994/151‑1 (MQ=255)
aaaCTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATcc < 2:1006353/151‑1 (MQ=255)
tAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGACGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGcc > 2:283780/1‑149 (MQ=255)
aaCGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAgg > 1:349834/1‑151 (MQ=255)
aaCGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAgg < 1:1008578/151‑1 (MQ=255)
cGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGc < 1:1225405/151‑1 (MQ=255)
ggTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCg < 2:121328/151‑1 (MQ=255)
cGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGgttg > 2:280945/1‑151 (MQ=255)
caccacACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGttt > 1:44542/1‑151 (MQ=255)
accacACTTCGGGGCTGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGtttt > 1:48298/1‑151 (MQ=255)
accacACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGtttt > 1:658877/1‑151 (MQ=255)
accacACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGtttt < 1:957922/151‑1 (MQ=255)
accacACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGtttt < 1:1421788/151‑1 (MQ=255)
acacTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCg > 1:228992/1‑151 (MQ=255)
cacTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCg > 1:1463469/1‑150 (MQ=255)
acTTCGGGGATGAAATGTTCTCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGCGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGAt > 2:1231619/1‑151 (MQ=255)
acTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGAt < 1:452168/151‑1 (MQ=255)
cTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGAtt > 1:530629/1‑151 (MQ=255)
ggggATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAgg < 1:1089032/151‑1 (MQ=255)
gATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGAtt < 1:675162/151‑1 (MQ=255)
aTGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGAttt < 2:1025932/151‑1 (MQ=255)
gAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGAtttt < 1:25817/150‑1 (MQ=255)
tGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGCTCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTtata > 2:645861/1‑149 (MQ=255)
gTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTtat > 1:135666/1‑147 (MQ=255)
ttCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATg > 2:396808/1‑151 (MQ=255)
tCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATgg > 1:720462/1‑151 (MQ=255)
tCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATg < 1:524522/150‑1 (MQ=255)
cgcgCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATgg > 1:1126134/1‑150 (MQ=255)
cgcgCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATgg < 1:823055/150‑1 (MQ=255)
cgcgCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGt < 1:247495/151‑1 (MQ=255)
cgcgCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGt > 1:650510/1‑151 (MQ=255)
cgcgCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGt > 1:895524/1‑151 (MQ=255)
cgcgCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGt > 2:468272/1‑151 (MQ=255)
gcgcTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGtt < 2:728442/151‑1 (MQ=255)
ggTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTg < 1:1005089/150‑1 (MQ=255)
aCTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCg < 1:1345270/150‑1 (MQ=255)
gtttgCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGcac > 2:213195/1‑151 (MQ=255)
tttgCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGcac > 1:1168013/1‑150 (MQ=255)
ttgCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGcaca < 2:1118282/150‑1 (MQ=255)
ttgCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGcac > 2:1054161/1‑149 (MQ=255)
ttgCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGcac > 1:263964/1‑149 (MQ=255)
tgCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAg < 2:962069/150‑1 (MQ=255)
gCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGa < 1:213219/151‑1 (MQ=255)
aCCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAg < 2:240546/149‑1 (MQ=255)
aCCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTa < 2:655694/151‑1 (MQ=255)
ccTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTAc < 1:1357604/151‑1 (MQ=255)
tGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACgg > 2:1074783/1‑151 (MQ=255)
gATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACgggg > 2:299616/1‑149 (MQ=255)
aTGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGa < 2:903087/151‑1 (MQ=255)
gCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGAttt < 1:1023271/151‑1 (MQ=255)
ggTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGAttttt > 2:392314/1‑151 (MQ=255)
tgtgAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAat > 2:395303/1‑151 (MQ=255)
gAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAattat > 2:1352637/1‑151 (MQ=255)
aGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTattg < 2:1206491/151‑1 (MQ=255)
atatTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTattgc > 1:983738/1‑150 (MQ=255)
tgttgtGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTattgcaattg > 1:1094645/1‑151 (MQ=255)
gttgtGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTattgcaattgc > 2:727683/1‑151 (MQ=255)
gttgtGGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTattgcaattgc > 1:1300456/1‑151 (MQ=255)
tgtgGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGcac > 1:662389/1‑151 (MQ=255)
gtgGATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGcac < 1:579654/150‑1 (MQ=255)
ggATGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAag < 1:1273419/151‑1 (MQ=255)
aTGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAagag < 1:601166/151‑1 (MQ=255)
aTGTCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAag > 1:586480/1‑149 (MQ=255)
tCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTc < 1:1453860/150‑1 (MQ=255)
tCTACAACACGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTc > 1:14685/1‑150 (MQ=255)
acaacaCGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGt < 2:788968/150‑1 (MQ=255)
caacaCGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTc < 1:769427/151‑1 (MQ=255)
caacaCGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTc < 2:959784/151‑1 (MQ=255)
acGGAGCAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGGTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGccc > 1:1262993/1‑151 (MQ=255)
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GGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGATGTCTACAACACGGAACAGCAGTGTCTTTATTCTATGAGCGATCAACGGATCCGCCAGGGCGGTTGTTTTCCGATTGAGGATTTTATAGATGGTTTCTGGCGACCTGCACAGGAGTACGGTGATTTTTAATTATTGCAATTGCACAAGAGTCAGTTCGCCC > NC_000913/1922056‑1922343
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
