Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I3 R1
|
143 |
109.6 |
3434427 |
98.5% |
3382910 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,923,142 |
G→A |
intergenic (‑173/+223) |
pphA ← / ← yebY |
serine/threonine‑specific protein phosphatase 1/DUF2511 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,923,142 | 0 | G | A | 97.9%
| 365.1
/ ‑1.6
| 95 | intergenic (‑173/+223) | pphA/yebY | serine/threonine‑specific protein phosphatase 1/DUF2511 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (50/43); total (50/45) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.54e-01 |
TCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGGAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGTCATCAGC > NC_000913/1922995‑1923284
|
tCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGaaa > 1:689348/1‑150 (MQ=255)
cacaTAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAAt > 1:671629/1‑151 (MQ=255)
acaTAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATg > 2:907238/1‑151 (MQ=255)
aTAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGc > 1:405702/1‑151 (MQ=255)
cTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTg > 2:154504/1‑151 (MQ=255)
tAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTggg > 2:691922/1‑151 (MQ=255)
tAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTgg < 1:1123608/150‑1 (MQ=255)
cAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGgaga < 1:1009687/151‑1 (MQ=255)
aaGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGgagag < 2:1407665/151‑1 (MQ=255)
aGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGgagaga < 1:1628189/151‑1 (MQ=255)
gAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGagagag < 2:1616671/151‑1 (MQ=255)
gTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGt > 1:1029554/1‑151 (MQ=255)
ttAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGt < 2:1019024/150‑1 (MQ=255)
tAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTgc > 1:1535217/1‑151 (MQ=255)
aaaaaaCGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGGAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTgcg < 2:1714217/151‑1 (MQ=255)
aaaCGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCt > 1:1391566/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTa > 1:981375/1‑150 (MQ=255)
aCGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTaaa < 2:1196435/151‑1 (MQ=255)
gCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTaaa > 1:1238015/1‑149 (MQ=255)
gCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAg < 2:162345/151‑1 (MQ=255)
tGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGtt > 1:836791/1‑151 (MQ=255)
ggACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTg < 2:1103607/151‑1 (MQ=255)
aCTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGc < 2:1252244/151‑1 (MQ=255)
tCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCAt > 2:30966/1‑151 (MQ=255)
cAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGATAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCa < 1:1516218/149‑1 (MQ=255)
cAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCa < 1:303220/149‑1 (MQ=255)
aGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTa < 1:924015/151‑1 (MQ=255)
gTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCa < 1:980512/151‑1 (MQ=255)
gagTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGc < 1:1100914/151‑1 (MQ=255)
agTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCt < 2:951604/151‑1 (MQ=255)
gtgtgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCtt < 2:671687/151‑1 (MQ=255)
tgtgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCtt > 2:1691861/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCtt > 1:1268264/1‑150 (MQ=255)
gtgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTa < 1:1379819/150‑1 (MQ=255)
tgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttg > 1:875484/1‑151 (MQ=255)
gtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttgc < 2:1552571/151‑1 (MQ=255)
gtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttg < 1:483449/150‑1 (MQ=255)
gtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttg < 1:1270669/150‑1 (MQ=255)
tATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttgcc < 2:1349335/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttgcctt < 2:1453671/151‑1 (MQ=255)
ggTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttgccttgc > 2:1142772/1‑151 (MQ=255)
ggTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGttgccttgc > 2:944479/1‑151 (MQ=255)
tGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCt > 2:685425/1‑151 (MQ=255)
cTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCttt > 1:1387665/1‑150 (MQ=255)
tataAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCttt > 2:534181/1‑149 (MQ=255)
ataAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTa > 1:1023660/1‑149 (MQ=255)
taAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTa > 1:86908/1‑148 (MQ=255)
aaaGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGaa < 1:613507/151‑1 (MQ=255)
aGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATg > 2:471833/1‑151 (MQ=255)
gCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATga < 1:1163581/151‑1 (MQ=255)
gAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATgacg > 2:571553/1‑151 (MQ=255)
gAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATgacg > 1:275705/1‑151 (MQ=255)
gAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATgacg > 1:257335/1‑151 (MQ=255)
aaGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATgacga < 2:510697/151‑1 (MQ=255)
aaGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATgacg > 2:1434020/1‑150 (MQ=255)
ggAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGacgacg > 2:687283/1‑151 (MQ=255)
gAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGc < 1:1227194/151‑1 (MQ=255)
aaaTGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGcc < 2:1563439/151‑1 (MQ=255)
aaaTGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGc > 1:1578568/1‑150 (MQ=255)
aTGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGcc > 2:1048002/1‑149 (MQ=255)
aTGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGcc > 2:145295/1‑149 (MQ=255)
ttCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGttt > 2:580255/1‑151 (MQ=255)
ttCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGttt > 2:242434/1‑151 (MQ=255)
ttCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGttt > 1:771541/1‑151 (MQ=255)
tCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGtttt > 1:995171/1‑151 (MQ=255)
tCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGttt < 2:1189741/150‑1 (MQ=255)
tCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGttt < 2:486252/150‑1 (MQ=255)
ggCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTcc < 2:1698392/150‑1 (MQ=255)
cTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGt > 2:498153/1‑151 (MQ=255)
ttAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGttt < 2:1482278/150‑1 (MQ=255)
aCAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGt < 1:1218257/151‑1 (MQ=255)
cAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTg < 1:1048038/151‑1 (MQ=255)
aGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTg > 1:978599/1‑150 (MQ=255)
aGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGc > 1:1072858/1‑151 (MQ=255)
aGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGc > 1:1372588/1‑151 (MQ=255)
aaaaaGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCaaa > 2:648147/1‑150 (MQ=255)
gagaCCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTc < 1:312976/151‑1 (MQ=255)
agaCCGAACACGTTTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTc > 1:1044678/1‑150 (MQ=255)
gAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATaa > 1:71995/1‑150 (MQ=255)
cacGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATaaaa > 2:485148/1‑149 (MQ=255)
cacGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAg < 2:689407/151‑1 (MQ=255)
acGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGc < 1:1549771/151‑1 (MQ=255)
cGATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCg > 2:412922/1‑151 (MQ=255)
gATTCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCgt > 1:1320787/1‑151 (MQ=255)
ttCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCgtgg > 1:953639/1‑151 (MQ=255)
tCCTGTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCgtggt > 2:806085/1‑151 (MQ=255)
gTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAACTGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGtc > 2:1375634/1‑151 (MQ=255)
gTATTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGtc < 1:1141887/151‑1 (MQ=255)
aTTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGtcat < 2:1535315/151‑1 (MQ=255)
aTTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGtcat < 2:316774/151‑1 (MQ=255)
aTTCGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGtcat > 1:1150998/1‑151 (MQ=255)
cGGTCCAGGGAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGTCATCAg < 1:343111/151‑1 (MQ=255)
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cGGTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGACAATAAAAAGCGTGGTGGTCATCAg < 2:980487/151‑1 (MQ=255)
ggTCCAGGAAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGTCATCAGc > 1:1532132/1‑151 (MQ=255)
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TCACATAATCTTAACAAGAATGTTAAAAAACGCTGGACTCAGACAGTAGAGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAATGCTTCTGGCTTTTAACAGATAAAAAGAGACCGAACACGATTCCTGTATTCGGTCCAGGGAAATGGCTCTTGGGAGAGAGCCGTGCGCTAAAAGTTGGCATTAATGCAGGCTTAGTTGCCTTGCCCTTTAAGAATAGATGACGACGCCAGGTTTTCCAGTTTGCGTGCAAAATGGTCAATAAAAAGCGTGGTGGTCATCAGC > NC_000913/1922995‑1923284
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
