Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F50 I3 R1
|
105 |
107.9 |
3491495 |
95.1% |
3320411 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,870,836 |
T→C |
L151P (CTG→CCG) |
yeaI → |
putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,870,836 | 0 | T | C | 99.0%
| 368.4
/ ‑3.9
| 99 | L151P (CTG→CCG) | yeaI | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (46/52); total (47/52) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 |
GTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGTTGCTGGC > NC_000913/1870691‑1870983
|
gTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATcc > 1:283675/1‑151 (MQ=255)
cATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAg < 2:1034787/151‑1 (MQ=255)
aTTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATcc > 1:496280/1‑148 (MQ=255)
aTTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATcc > 1:1110597/1‑148 (MQ=255)
aTTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGa < 1:150252/151‑1 (MQ=255)
tttttCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGAc > 1:80948/1‑151 (MQ=255)
ttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATCATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACaa > 2:342804/1‑150 (MQ=255)
cttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGt > 1:222658/1‑151 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAg < 2:269713/148‑1 (MQ=255)
ttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCg > 2:96759/1‑150 (MQ=255)
ttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCg > 3:51995/1‑150 (MQ=255)
cATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGaa < 2:1083074/150‑1 (MQ=255)
cATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAat < 1:1169011/151‑1 (MQ=255)
aTGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatg < 2:421947/151‑1 (MQ=255)
aTGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatg < 2:968036/151‑1 (MQ=255)
aTGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatg < 2:1159538/151‑1 (MQ=255)
aTGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatg > 4:96852/1‑151 (MQ=255)
gTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatgat > 2:657438/1‑151 (MQ=255)
gTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatga < 1:1063465/150‑1 (MQ=255)
ttAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatgatg > 2:1185981/1‑151 (MQ=255)
ttAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAatgatg > 4:75274/1‑151 (MQ=255)
aaTGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtt > 1:242616/1‑151 (MQ=255)
aTGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGttt < 2:833448/151‑1 (MQ=255)
tGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttc > 4:436590/1‑151 (MQ=255)
gAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttct < 1:1089377/151‑1 (MQ=255)
gAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttc < 2:716637/150‑1 (MQ=255)
aaTATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctat < 2:627461/151‑1 (MQ=255)
atatTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctatt < 2:147520/151‑1 (MQ=255)
atatTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctatt > 2:30193/1‑151 (MQ=255)
atTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctatttt > 1:735690/1‑151 (MQ=255)
atTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctatttt > 1:761581/1‑151 (MQ=255)
ttCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttc < 2:656056/150‑1 (MQ=255)
ttCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttc < 2:303904/150‑1 (MQ=255)
tCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttct < 2:431242/150‑1 (MQ=255)
cACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttctat < 1:746600/151‑1 (MQ=255)
cACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttctat < 1:1213869/151‑1 (MQ=255)
aCTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttctat > 1:369268/1‑150 (MQ=255)
aacaaacaAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATAttt < 2:223938/151‑1 (MQ=255)
acaaacaaATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATAtttt < 1:982709/151‑1 (MQ=255)
caaacaaaTTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTc < 1:295079/151‑1 (MQ=255)
aaacaaaTTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTcc < 1:96773/151‑1 (MQ=255)
aacaaaTTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCg < 1:704834/151‑1 (MQ=255)
acaaaTTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGc < 2:766844/151‑1 (MQ=255)
acaaaTTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGc < 1:1258012/151‑1 (MQ=255)
acttttACCAACGCTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTCGTTGTTATCTTTGCAATTATCCATAAATCAATTATCAGCAGTACACCGATCATGTCAAAGTCGTATGATGTTTATATTTTCTATAtttt > 2:293604/3‑144 (MQ=255)
ttttACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACt > 1:315312/1‑151 (MQ=255)
gttACCAACACTCATTTTAAGGGTTGCATTTTTAGGTGTCCTTATCTATTTAGTTGGAACCCTTGTAATTATAAATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTc > 2:394676/2‑151 (MQ=255)
aCCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAg < 1:605860/150‑1 (MQ=255)
aaCACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGtttt < 1:558853/151‑1 (MQ=255)
cATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTg < 1:474788/150‑1 (MQ=255)
cATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTg < 1:889707/150‑1 (MQ=255)
cATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGt > 1:1248835/1‑151 (MQ=255)
tttAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGttt > 4:164442/1‑150 (MQ=255)
aaGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAAcc < 1:1025961/151‑1 (MQ=255)
gCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTc > 2:554219/1‑151 (MQ=255)
ccTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTC‑GGTTTATTTTTTTaaac > 2:651008/1‑145 (MQ=255)
cTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGc > 4:444551/1‑151 (MQ=255)
gCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTgg > 1:604353/1‑151 (MQ=255)
cATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCGTTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGgc < 2:435281/151‑1 (MQ=255)
ttttAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGgcgc < 2:77402/150‑1 (MQ=255)
tttAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGctc > 2:959521/1‑151 (MQ=255)
tttAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGctc > 4:95673/1‑151 (MQ=255)
tAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCtt > 2:342514/1‑151 (MQ=255)
aaGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCttt > 3:418950/1‑151 (MQ=255)
tGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGt > 1:69576/1‑151 (MQ=255)
tGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGt > 4:11210/1‑151 (MQ=255)
ggCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGt < 1:964878/150‑1 (MQ=255)
ccTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTAt > 2:673643/1‑151 (MQ=255)
ccTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTAt < 1:554322/151‑1 (MQ=255)
aTCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGa > 4:201629/1‑150 (MQ=255)
tttAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGac > 4:318722/1‑151 (MQ=255)
tAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGaca > 1:778626/1‑150 (MQ=255)
gTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGacaaca < 4:77425/151‑1 (MQ=255)
tGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATc > 2:348914/1‑151 (MQ=255)
gAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATc < 2:1251097/150‑1 (MQ=255)
aaCCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCtt < 2:242578/151‑1 (MQ=255)
aCCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGCTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTg > 1:445928/1‑151 (MQ=255)
gTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGacaaca < 2:810714/151‑1 (MQ=255)
tAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGacaaca > 4:418796/1‑150 (MQ=255)
aTTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATa < 2:93684/151‑1 (MQ=255)
tATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATa > 2:1171998/1‑149 (MQ=255)
tATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACACAGTTTTATTTGTTTAACCTCTCTGTCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACACTaa < 2:63445/150‑1 (MQ=255)
tCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGa > 2:509781/1‑150 (MQ=255)
ccATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGaa < 2:604232/150‑1 (MQ=255)
ccATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGaa < 2:1120215/150‑1 (MQ=255)
cATAAACCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGaaaa < 1:598049/151‑1 (MQ=255)
aaaCCAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGaaaaaaa < 2:351502/151‑1 (MQ=255)
cAATTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACggg < 1:926670/151‑1 (MQ=255)
aaTTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGa < 2:835456/151‑1 (MQ=255)
aaTTAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGa < 2:294153/151‑1 (MQ=255)
ttAACGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAAt > 1:436501/1‑151 (MQ=255)
aaCGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATcc > 2:866811/1‑151 (MQ=255)
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aCGGCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCt < 2:267288/151‑1 (MQ=255)
ggCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGt < 1:689907/151‑1 (MQ=255)
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gCAGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGtt > 1:858636/1‑151 (MQ=255)
aGTACACCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGTTGc > 1:468657/1‑151 (MQ=255)
cacCGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGTTGCTGgc > 2:1188900/1‑151 (MQ=255)
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GTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCTCGCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGTTGCTGGC > NC_000913/1870691‑1870983
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
