Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,536,495 |
G→A |
A248V (GCG→GTG) |
pdxK ← |
pyridoxal‑pyridoxamine kinase/hydroxymethylpyrimidine kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,536,495 | 0 | G | A | 100.0%
| 460.8
/ NA
| 121 | A248V (GCG→GTG) | pdxK | pyridoxal‑pyridoxamine kinase/hydroxymethylpyrimidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (64/57); total (64/57) |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACGCCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCATTAC > NC_000913/2536347‑2536642
|
tGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACAcc < 2:154655/150‑1 (MQ=255)
gCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCtt < 3:839753/151‑1 (MQ=255)
ccGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTGTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTc < 2:25986/151‑1 (MQ=255)
cGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTcc < 3:1362/151‑1 (MQ=255)
gCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTccc > 3:216604/1‑151 (MQ=255)
aGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCtt > 4:72403/1‑151 (MQ=255)
aaaTGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGc > 2:1045624/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCa > 3:719512/1‑150 (MQ=255)
gcCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCCTCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCAc > 3:812484/1‑150 (MQ=255)
cccATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACtg > 2:650478/1‑151 (MQ=255)
cccATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACtg < 2:1265693/151‑1 (MQ=255)
ccATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACtg > 1:179031/1‑150 (MQ=255)
cATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACtgat < 2:406459/151‑1 (MQ=255)
ggCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCGCTGAtgagc > 2:862055/1‑151 (MQ=255)
gcgcCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGAtgagct < 2:836677/151‑1 (MQ=255)
gcgcCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGAtgagct > 3:242487/1‑151 (MQ=255)
cgcCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGAtgagctg > 2:61212/1‑151 (MQ=255)
cgcCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACCGAtgagctg < 3:644435/151‑1 (MQ=255)
gcCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGAtgagctga < 2:586790/151‑1 (MQ=255)
ccATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGAtgagctgag < 2:968595/151‑1 (MQ=255)
cATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGAtgagctgagc < 2:150053/151‑1 (MQ=255)
tttttttATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGcac > 3:1057565/1‑151 (MQ=255)
ttttttATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGcac < 3:61223/150‑1 (MQ=255)
ttttttATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGcac < 1:465829/150‑1 (MQ=255)
ttttttATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGcac > 4:19548/1‑150 (MQ=255)
ttttATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACaa > 2:973600/1‑150 (MQ=255)
ttttATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACaa > 3:1255391/1‑150 (MQ=255)
tATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAAc > 3:446893/1‑150 (MQ=255)
tATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAAc > 1:453867/1‑150 (MQ=255)
tATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAAc > 2:878693/1‑150 (MQ=255)
tGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAgg > 3:395473/1‑151 (MQ=255)
cTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTc > 3:137545/1‑151 (MQ=255)
cGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCa < 2:332070/151‑1 (MQ=255)
gCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGcc > 2:736800/1‑149 (MQ=255)
ccAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGt > 2:650868/1‑151 (MQ=255)
cAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTc > 2:876990/1‑151 (MQ=255)
cAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTc > 2:780166/1‑151 (MQ=255)
aGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTcc < 3:1054776/151‑1 (MQ=255)
gcggcgGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAGCCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTc < 2:1054753/149‑1 (MQ=255)
gcggcgGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTccc < 2:1008685/151‑1 (MQ=255)
ggcggcAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCtt > 3:1347829/1‑151 (MQ=255)
ggcggcAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCtt > 3:279215/1‑151 (MQ=255)
cggcAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTc > 2:1305290/1‑151 (MQ=255)
ggcAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCa < 3:932270/151‑1 (MQ=255)
aaaaTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGt < 4:376880/151‑1 (MQ=255)
aaaaTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGt > 3:11111/1‑151 (MQ=255)
aaaTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTc > 1:180090/1‑151 (MQ=255)
aaTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCg < 1:40840/151‑1 (MQ=255)
aaTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCg > 3:1123187/1‑151 (MQ=255)
aTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCgg < 2:367408/151‑1 (MQ=255)
aTCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCgg < 2:137529/151‑1 (MQ=255)
cAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGt < 2:348920/150‑1 (MQ=255)
aaTTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGttt > 3:1301201/1‑151 (MQ=255)
cATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTAc < 1:72403/151‑1 (MQ=255)
aTCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTAcc > 2:196687/1‑151 (MQ=255)
cGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCg < 3:641886/151‑1 (MQ=255)
gCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCg > 3:171550/1‑150 (MQ=255)
gCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGt < 2:768739/151‑1 (MQ=255)
tctcATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCGCTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTg > 3:466796/1‑150 (MQ=255)
cATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAAt < 2:242462/150‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATgg < 3:428665/151‑1 (MQ=255)
aTGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATgg > 2:2216/1‑151 (MQ=255)
gctgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGaaa < 2:1014477/150‑1 (MQ=255)
gctgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAAt < 3:844824/151‑1 (MQ=255)
gctgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAAt < 1:152854/151‑1 (MQ=255)
gctgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAAt > 3:564627/1‑151 (MQ=255)
gctgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAAt < 2:842501/151‑1 (MQ=255)
ctgGGTGTAGCGCATCCCTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCTGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCCTAAAACCGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCTGTTTTTACCCGTGAATGGGaa < 3:1388039/148‑1 (MQ=255)
tgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATg > 4:85754/1‑150 (MQ=255)
tgGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATg > 3:1289535/1‑150 (MQ=255)
gggTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGAc > 4:453337/1‑151 (MQ=255)
ggTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACa < 2:137187/151‑1 (MQ=255)
gtgtAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACAt > 2:435762/1‑151 (MQ=255)
cgcgcATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCCCGGCGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCAc > 4:479693/2‑151 (MQ=255)
cATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTg < 1:109823/151‑1 (MQ=255)
aTCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGt > 4:399573/1‑151 (MQ=255)
aTCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGt > 2:159073/1‑151 (MQ=255)
aCTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCgg > 4:322369/1‑151 (MQ=255)
cTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGc > 1:181391/1‑151 (MQ=255)
tCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGc < 4:181389/149‑1 (MQ=255)
ccAGTACGCGCAACCCCGCTCGGAGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGCCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGt > 4:56713/1‑151 (MQ=255)
aGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTg > 3:236697/1‑150 (MQ=255)
aGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGa < 3:736831/151‑1 (MQ=255)
gTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGac < 2:252237/151‑1 (MQ=255)
aCGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGacca < 3:1388417/151‑1 (MQ=255)
aaCCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACaa < 2:247657/151‑1 (MQ=255)
ccGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTg > 4:301127/1‑151 (MQ=255)
gCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGc > 3:1356671/1‑150 (MQ=255)
cGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCAtct < 3:180911/151‑1 (MQ=255)
cGGTGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCAtct > 4:244533/1‑151 (MQ=255)
tGCACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCt > 3:1389786/1‑151 (MQ=255)
cACTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGa < 3:1149157/151‑1 (MQ=255)
cTGCATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCGGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGAt < 2:812450/150‑1 (MQ=255)
cATCGGTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTttc > 1:65717/1‑151 (MQ=255)
ggTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCa < 2:1389716/151‑1 (MQ=255)
ggTTAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCa < 3:780201/151‑1 (MQ=255)
tAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCAtt > 3:1027000/1‑150 (MQ=255)
tAACACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCAtt > 3:114203/1‑150 (MQ=255)
aaCACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCATTa < 1:314853/150‑1 (MQ=255)
aaCACCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCATTAc > 2:664098/1‑151 (MQ=255)
|
TTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGCGCAACCCCGCTCGGTGCACTGCATCGGTTAACGCCTTCCCTTTCAGCAAGCCACTGATGAGCTGAGCACAAAACAGGTCGCCAGTCCCTTTCAGGTCGGTTTTTACCCGTGAATGGGAAATGACATTCACGCTGTCGGCAGTGACCACCACAACCTGCATCTCCTGATTTTCTTCATTAC > NC_000913/2536347‑2536642
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
