Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I3 R1
|
168 |
141.0 |
4346284 |
99.6% |
4328898 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
1,393,457 |
IS186 (–) +5 bp |
coding (231‑235/1614 nt) |
mppA → |
murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
608007 = | NA (NA) | 133 (0.980) |
107/290 |
0.1 |
100% |
noncoding (1/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
1393457 = |
0 (0.000) | coding (231/1614 nt) |
mppA |
murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
| * |
? |
NC_000913 |
= 609351 | NA (NA) | 153 (1.130) |
114/290 |
0.1 |
100% |
noncoding (1345/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 1393461 |
0 (0.000) | coding (235/1614 nt) |
mppA |
murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608160‑608007
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAAC > NC_000913/1393457‑1393606
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCTGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:1361023/151‑1
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:340841/151‑1
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 2:169741/1‑151
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:2158637/151‑1
GTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 2:1679669/1‑151
GTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 2:1895668/151‑1
TTAGAGCCCCGCCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGGAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:2046143/1‑149
TAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATGCCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:377848/150‑1
TAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAGCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:534228/150‑1
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAG < 1:684317/151‑1
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 2:1269866/150‑1
GAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccg < 2:708425/151‑4
AGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccga < 2:1167280/151‑5
AGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGAT < 2:2105693/151‑1
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTG > 2:562728/1‑151
CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaac > 1:1805016/1‑144
CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGT < 1:581400/151‑1
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATTGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTC < 1:1792221/151‑1
GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCC < 2:1866922/151‑1
TACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccccggttg > 1:1880772/1‑136
TACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccccggttg > 2:1914740/1‑136
TACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccccggtt < 1:1079568/150‑15
CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTT < 1:1527282/151‑1
CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTT < 2:260804/151‑1
GCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCG > 1:838302/1‑151
GCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGC < 1:1423228/150‑1
GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACT > 2:1108785/1‑151
TCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGG > 1:2124731/1‑151
CCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGA < 2:1896936/151‑1
CCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGG < 1:412155/150‑1
CAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAA < 2:2131970/151‑1
AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAA < 2:1785068/151‑1
AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAA > 1:584791/1‑150
GTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAA < 1:2037187/151‑1
TTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAA > 1:1157872/1‑149
TCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAG < 1:1584497/150‑1
GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATG > 2:300775/1‑150
GCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGAC > 1:1205492/1‑150
TTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAAC > 2:777758/1‑151
TACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACC > 1:474599/1‑151
TACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAAC < 1:2095120/150‑1
ACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCG < 2:1670961/151‑1
CCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGT > 2:1620664/1‑151
CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGT > 2:269975/1‑150
CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGT > 2:103780/1‑150
ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTG < 1:2126137/151‑1
ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTG < 2:1562430/151‑1
ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTG < 2:1364095/151‑1
ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCT < 1:705462/150‑1
ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCT < 1:63293/150‑1
TGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGG > 1:321589/1‑151
TGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGG > 2:874568/1‑151
GGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGG < 1:369941/150‑1
CCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTT > 2:397283/1‑151
AGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTT > 1:149406/1‑151
GAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTT > 2:403696/1‑150
GCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCT < 2:821850/150‑1
GACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCG < 2:864923/150‑1
GACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGC < 2:647717/149‑1
CCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGA < 2:781362/151‑1
CCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGA < 1:920356/151‑1
ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGC < 1:1781909/151‑1
ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGC > 1:122614/1‑151
ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACG < 2:1634055/150‑1
CGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCA > 2:1323365/1‑150
TGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAA > 1:286521/1‑150
TGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAA > 1:2072186/1‑150
AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGG > 1:1171072/1‑151
GTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGC < 2:491910/151‑1
AATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCG < 2:6651/150‑1
ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGG > 1:1984011/1‑150
ATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGC > 2:2039346/1‑151
CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCAC < 2:2068345/151‑1
GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACAC > 1:1478/1‑151
GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGT < 1:471501/151‑1
GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGT < 1:1663095/151‑1
GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGT < 2:2113351/151‑1
TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGT > 1:1243458/1‑150
TAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTA > 1:913645/1‑150
AAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAAC < 2:1183980/151‑1
CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCG < 1:1620002/151‑1
CAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCA > 2:1612207/1‑148
AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCA > 1:1497147/1‑147
AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGAAACGGCGCAAGATTTT > 1:1329426/1‑148
ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCT < 2:983735/151‑1
CACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTAC > 1:1568164/1‑149
AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTG > 1:1903993/1‑151
CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGC > 1:235954/1‑151
TAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACG > 2:493687/1‑151
TAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAAC < 1:1013259/150‑1
AAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGT > 1:947206/1‑151
AAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACG < 1:1030086/150‑1
TAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGG > 2:2005218/1‑151
TAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGG > 2:949474/1‑151
CGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGG > 1:1342040/1‑151
GCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGG > 1:729730/1‑150
GGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAA < 2:303289/151‑1
GGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAA < 2:1845086/150‑1
GAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAA < 2:1084967/151‑1
AGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAAC < 2:204351/151‑1
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608160‑608007
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAAC > NC_000913/1393457‑1393606
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
