Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I1 R1
|
163 |
55.0 |
1534755 |
98.6% |
1513268 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
1,393,457 |
IS186 (–) +5 bp |
coding (231‑235/1614 nt) |
mppA → |
murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
608007 = | NA (NA) | 60 (1.270) |
52/290 |
0.1 |
100% |
noncoding (1/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
1393457 = |
0 (0.000) | coding (231/1614 nt) |
mppA |
murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
| * |
? |
NC_000913 |
= 609351 | NA (NA) | 30 (0.630) |
27/290 |
1.0 |
100% |
noncoding (1345/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 1393461 |
0 (0.000) | coding (235/1614 nt) |
mppA |
murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608160‑608007
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAA > NC_000913/1393457‑1393605
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:245645/1‑151
GGTTAGAGCCCCGGAATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGTGCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:438106/151‑1
GTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 1:186036/151‑1
GTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 1:491004/151‑1
TAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:585449/150‑1
TAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 2:354523/1‑150
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAG < 2:28952/151‑1
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAG < 2:358043/151‑1
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA > 2:65394/1‑150
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 2:185346/150‑1
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 2:300715/150‑1
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 2:42021/150‑1
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTG > 2:353468/1‑151
CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaac < 1:636205/151‑8
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaacc < 1:91395/151‑9
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaacc < 2:235974/151‑9
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccc > 1:678065/1‑142
GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaacccc < 1:224026/151‑11
GCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccccg < 1:376623/151‑12
CATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCG < 2:355289/151‑1
CATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGACAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCC > 2:415171/1‑149
ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccccggt > 2:624386/1‑138
ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGG > 1:423245/1‑151
ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGG > 1:521734/1‑151
TACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGccgaaaccccggttg > 1:696706/1‑136
CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTT > 1:213006/1‑151
GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTG > 2:146754/1‑151
GTGCCGAAGTATCCAGTACTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAAAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACATCCCTTAAGTTAGCGCTTAAGGGAGATTGTCCCCGGCGTT < 2:151695/150‑1
GCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTGACCAGTATGGGCCAGAATTGCTGACCAGGTATCGTGATAGTAATTCATCGACACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCACGGCGTTGC > 2:568804/1‑150
CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCG > 2:107336/1‑150
CGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGAC < 1:266892/151‑1
GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACT > 1:133925/1‑151
GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGGAAGTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACT < 1:708836/151‑1
GAAGGATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACT > 2:412901/1‑151
CGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATG < 1:607829/151‑1
GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGA < 1:355731/151‑1
GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATG > 2:641721/1‑150
TACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAAC < 2:257555/150‑1
CCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGT > 1:155362/1‑151
CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTA < 1:171821/151‑1
AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTAT < 1:337930/151‑1
AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTAT > 2:230623/1‑151
ATATGGGCCAGAATTGCTGCCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGTCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATC < 2:692305/151‑1
ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTG < 2:243937/151‑1
GGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGG < 1:627601/150‑1
CAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTT > 1:685011/1‑151
CAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTT < 1:407510/151‑1
TTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCC > 2:370021/1‑151
cgGACAAGTTCTCGTGAGAGAAATTCATCTGCTCGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCAACGGCGTTGCGACTCAGTGTAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTGTTACCCTG < 2:537761/148‑1
CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGC > 1:298119/1‑151
gaaCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATTATATCAGGCGTAATACCACAACCCAGAAGTTAGCGCTTCTGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGC < 2:523694/148‑1
GACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGC > 2:97319/1‑151
CCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGA < 1:160328/151‑1
TATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACG > 2:690378/1‑151
TATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACG > 2:369666/1‑151
GTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAA < 2:332732/151‑1
AGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATG < 1:173637/151‑1
GAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGG < 1:172743/151‑1
AATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGG < 2:406232/151‑1
ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGG > 2:283668/1‑150
TCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGAT < 2:722559/150‑1
CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGG < 2:697765/151‑1
CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGG < 1:739047/151‑1
CGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCAC > 2:574585/1‑151
CACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACC < 1:265194/151‑1
GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGT < 1:636799/151‑1
AAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAA < 1:503189/150‑1
ATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGG > 1:411334/1‑151
ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAA < 2:571543/151‑1
GGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATT < 2:289046/151‑1
AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTC < 1:424243/151‑1
AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTG > 1:436469/1‑151
AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGC < 2:391834/149‑1
AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGC > 1:391855/1‑149
ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGG > 1:3927/1‑151
TTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAAC > 2:155840/1‑151
TTAAGTTAGCGCTTATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCA > 2:623315/1‑149
ATGGGAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCA < 1:353482/151‑1
GAGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAA < 2:155355/151‑1
AGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCGGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAA > 2:349889/1‑149
GGTTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608160‑608007
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaGATTGTCCCCGGCGTTGCGACTCAGTGGAAAAGTAATGACAACCGTATCTGGACTTTTACCCTGCGCGATAACGCAAAATGGGCGGATGGCACACCGGTAACGGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAA > NC_000913/1393457‑1393605
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
