Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
144 |
141.8 |
4677362 |
93.6% |
4378010 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,136,954 |
A→G |
V97A (GTC→GCC) |
wza ← |
colanic acid export protein; outer membrane auxillary lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,136,954 | 0 | A | G | 99.2%
| 426.3
/ ‑4.4
| 122 | V97A (GTC→GCC) | wza | colanic acid export protein; outer membrane auxillary lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (71/50); total (71/51) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
ACTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGACGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCATTT > NC_000913/2136806‑2137101
|
aCTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCg < 4:255824/151‑1 (MQ=255)
aCTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCg < 4:426330/151‑1 (MQ=255)
ggATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGAc > 2:883422/1‑151 (MQ=255)
tCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTa < 2:1531692/150‑1 (MQ=255)
cAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTa > 2:1701161/1‑149 (MQ=255)
cAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAg < 1:656730/151‑1 (MQ=255)
cAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCAGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTaa < 2:1151994/150‑1 (MQ=255)
agcgagcgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGGGATCCCAGGCGGTGACATTa > 1:1675066/1‑148 (MQ=255)
gagcgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACg > 1:682715/1‑151 (MQ=255)
cgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTcc > 4:135327/1‑151 (MQ=255)
cgTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTAAAATTAAGAACGTc > 2:1605535/1‑150 (MQ=255)
ttCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTccccc < 2:1139484/150‑1 (MQ=255)
tCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCg < 1:866902/150‑1 (MQ=255)
cGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGcgc < 2:39399/151‑3 (MQ=255)
aCTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCg > 2:594603/1‑150 (MQ=255)
aCTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCg > 2:1316883/1‑150 (MQ=255)
cTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGACGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGa < 4:351224/150‑1 (MQ=255)
aCGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGAcgc < 4:584631/151‑1 (MQ=255)
cGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGAGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGAcgcg > 3:391161/1‑151 (MQ=255)
tGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGActc < 1:1572825/148‑3 (MQ=255)
cTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTgg > 1:1337346/1‑151 (MQ=255)
tGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTgg < 2:249203/149‑1 (MQ=255)
tGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGt > 2:1352253/1‑150 (MQ=255)
ccGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAAt > 2:1187688/1‑151 (MQ=255)
ccGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAAt > 3:3661/1‑151 (MQ=255)
cGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTTAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGGGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACCCGATACTGGTAAtt > 1:576896/1‑151 (MQ=255)
cGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAAtt > 2:1551862/1‑151 (MQ=255)
cGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGGAAtt > 4:150984/1‑151 (MQ=255)
atatACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGGGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcg > 2:1712618/1‑151 (MQ=255)
tataCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGCGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcgc > 1:1374463/1‑151 (MQ=255)
ataCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcgc < 2:1525570/150‑1 (MQ=255)
taCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTcgc > 4:281527/1‑149 (MQ=255)
aCGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGAt < 2:516964/151‑1 (MQ=255)
gTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCa < 2:660759/151‑1 (MQ=255)
gTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGCGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGAtctc > 2:196311/1‑150 (MQ=255)
tAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCAc > 2:110461/1‑151 (MQ=255)
tAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCAc > 1:137124/1‑151 (MQ=255)
tAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCAc > 2:745237/1‑151 (MQ=255)
aaaaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACt > 2:656892/1‑151 (MQ=255)
aaaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACtt > 1:211863/1‑151 (MQ=255)
aaaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACtt < 2:365317/151‑1 (MQ=255)
aaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACttt > 4:260348/1‑151 (MQ=255)
aaCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACttt > 2:1342008/1‑151 (MQ=255)
aCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACttt > 4:393865/1‑150 (MQ=255)
aCATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTc > 1:1710410/1‑151 (MQ=255)
aTAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTcc > 3:240562/1‑150 (MQ=255)
aGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGGGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATGCTGGTAATTCTCGATCTCACTTTCAAGc > 1:1228694/1‑151 (MQ=255)
gCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGCGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCg > 2:195524/1‑149 (MQ=255)
ccGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCa < 1:1659006/151‑1 (MQ=255)
cGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCat > 2:1080054/1‑151 (MQ=255)
gTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCata < 1:842121/151‑1 (MQ=255)
cAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATAtt < 2:118475/151‑1 (MQ=255)
aGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATAtt > 1:906863/1‑150 (MQ=255)
aGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTg < 1:117582/151‑1 (MQ=255)
tGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTgggg > 1:920122/1‑150 (MQ=255)
tGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGgc > 3:38107/1‑151 (MQ=255)
aCCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGT‑CCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGgcgcgc > 2:1593553/1‑151 (MQ=255)
ccAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCt < 4:244840/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCt < 2:9887/151‑1 (MQ=255)
cAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTa < 2:736090/151‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGGGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGAAACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGGCATATTgggg > 1:824360/1‑143 (MQ=255)
gTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACa < 1:1195947/151‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGGAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACAtt > 2:279640/1‑151 (MQ=255)
gCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACAtt < 1:883307/150‑1 (MQ=255)
ccGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTc < 1:1002360/150‑1 (MQ=255)
gtgtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggc < 1:546832/151‑1 (MQ=255)
gtgtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggc < 2:709758/151‑1 (MQ=255)
tgtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcg > 1:1539916/1‑151 (MQ=255)
gtCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgt > 1:796853/1‑151 (MQ=255)
tCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgt > 1:1698557/1‑150 (MQ=255)
tCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGATACATTCgggcgtg > 1:437693/1‑151 (MQ=255)
cGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgg < 2:1343071/151‑1 (MQ=255)
tGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGCTCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggcg > 3:422837/1‑151 (MQ=255)
tGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggcg > 1:1190394/1‑151 (MQ=255)
ggAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggcg > 1:1155880/1‑150 (MQ=255)
ggAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCgggcgtgggc < 3:329680/149‑1 (MQ=255)
gAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTa < 1:981598/151‑1 (MQ=255)
tGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTg > 2:1000994/1‑151 (MQ=255)
tGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTg > 2:541191/1‑151 (MQ=255)
gCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAAtt < 1:1296973/149‑1 (MQ=255)
gTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTc > 2:1487123/1‑150 (MQ=255)
gACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCa < 2:682813/150‑1 (MQ=255)
gACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAg < 2:1523872/151‑1 (MQ=255)
gCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGcgcg > 1:271764/1‑151 (MQ=255)
tGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCggg > 2:988278/1‑151 (MQ=255)
gCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGt < 2:1680999/151‑1 (MQ=255)
cGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTc > 3:552410/1‑151 (MQ=255)
cGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTc < 1:745128/151‑1 (MQ=255)
gtggtgAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTc > 4:246334/1‑150 (MQ=255)
gtgAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCg < 1:1700995/151‑1 (MQ=255)
gtgAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCg < 2:776779/151‑1 (MQ=255)
tgAGTTCCGTGTGATCCCAGGCGGTGCGATTAAGAACGCCCCTGGAGCCGACGCGATACTGGTAATTGGCGATCTCTCTTCCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTGCATTCGGGCGTGGGGGTAATTGGGCAATGATGCGCggggcgag < 1:1557824/148‑5 (MQ=255)
gAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCgg > 1:822038/1‑150 (MQ=255)
gAGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGa < 1:539400/151‑1 (MQ=255)
aGTTCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGAt < 2:814978/151‑1 (MQ=255)
tCCGGGTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATaa > 2:116810/1‑150 (MQ=255)
gggTGATCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCTTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTCGGCGAAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACAt < 1:1510476/151‑1 (MQ=255)
aTCCCAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCAcc > 1:395976/1‑151 (MQ=255)
ccAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCAtt > 2:653770/1‑151 (MQ=255)
cAGGCGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCAttt < 3:155479/151‑1 (MQ=255)
|
ACTGCGGATTTCAGCGAGCGTTTTCCCGACTACGTGGACCTTGCCGATATACGGGTAAAACATAGTGCCGTCAGGCTGTACCCAGTTGCCGGTGTCGCTGGAGCTGCGGTACTGACCGGCTGGCGTGGTGAGTTCCGGGTGATCCCAGACGGTGACATTAAGAACGTCCCCCGGCCCGACGCGATACTGGTAATTCGCGATCTCACTTTCCAGCGTCATATTGGGGCGCGCTACATTCGGGCGTGGGCGTAATTGGTCAATCAGGCGCGGGGTCAGCGGATAAACATTCACCATTT > NC_000913/2136806‑2137101
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
