Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I3 R1
|
143 |
109.6 |
3434427 |
98.5% |
3382910 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,974,562 |
T→C |
T255A (ACG→GCG) |
cheA ← |
fused chemotactic sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,974,562 | 0 | T | C | 99.1%
| 412.2
/ ‑3.9
| 114 | T255A (ACG→GCG) | cheA | fused chemotactic sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (59/54); total (59/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGTTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCTGTGATGTCAT > NC_000913/1974414‑1974708
|
aTCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGctt < 2:356961/151‑1 (MQ=255)
cAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGTGCGTCGctttt < 2:704527/151‑1 (MQ=255)
aaTCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTc > 2:787634/1‑151 (MQ=255)
tCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCGCCGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTccc > 1:680223/1‑151 (MQ=255)
aTGATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTcc > 2:997073/1‑151 (MQ=255)
gATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCa < 1:1048324/150‑1 (MQ=255)
gATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCAc > 2:947956/1‑151 (MQ=255)
gATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCAc > 2:1359069/1‑151 (MQ=255)
tAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCAcgcg > 2:1234280/1‑151 (MQ=255)
tAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCAcgc < 2:1352777/150‑1 (MQ=255)
ccGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGcc < 1:778043/151‑1 (MQ=255)
gggTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCgg > 1:1195189/1‑151 (MQ=255)
gTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGtt < 1:40114/151‑1 (MQ=255)
ccAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTg < 2:757713/150‑1 (MQ=255)
cAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGgc > 2:972077/1‑151 (MQ=255)
tCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCtt > 2:1480006/1‑151 (MQ=255)
ggAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTc < 1:443215/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGc > 1:1590917/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGc > 1:552077/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGc > 1:488663/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGc > 2:724436/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGc > 1:1109832/1‑151 (MQ=255)
tGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGcc > 2:1013413/1‑150 (MQ=255)
gCAAGCATGGACTGGGCGATAACCAGCTCGCCGACGAGGCTAACTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGCGGATTCATTGCTGCCCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGCTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGtt > 1:445823/1‑151 (MQ=255)
aaGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGttt > 1:593962/1‑150 (MQ=255)
aGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTa > 1:739894/1‑150 (MQ=255)
gCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAg < 1:320732/151‑1 (MQ=255)
aTGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCa < 2:1166438/151‑1 (MQ=255)
tGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCAc > 2:715575/1‑151 (MQ=255)
gACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACtg < 2:154134/151‑1 (MQ=255)
gggTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACtggtgg < 1:1142043/151‑1 (MQ=255)
ggTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTggtggg < 1:539361/151‑1 (MQ=255)
gATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTggtggggtg < 2:508240/151‑1 (MQ=255)
tAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTggtggggtgg > 2:81338/1‑150 (MQ=255)
aaCCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGa < 2:481210/150‑1 (MQ=255)
aCCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGata < 1:1549946/151‑1 (MQ=255)
aCCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGat > 1:733619/1‑150 (MQ=255)
ccAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGatat < 2:203736/151‑1 (MQ=255)
cAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATAtt > 1:297144/1‑151 (MQ=255)
cGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATAttttt < 2:265477/149‑1 (MQ=255)
cGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATAttttt < 1:1678527/149‑1 (MQ=255)
gCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGc < 1:1079715/151‑1 (MQ=255)
cgacgaGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCg > 1:1613292/1‑150 (MQ=255)
acgaGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCg > 2:1162678/1‑148 (MQ=255)
cgaGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGAc > 1:375125/1‑151 (MQ=255)
cgaGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGAc > 2:1690415/1‑151 (MQ=255)
gTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTc < 2:189508/150‑1 (MQ=255)
gTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCt > 2:1665947/1‑151 (MQ=255)
ttaattaaTTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCt > 2:455919/1‑150 (MQ=255)
taattaatTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTa < 1:726942/150‑1 (MQ=255)
taattaatTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTAc > 1:1576950/1‑151 (MQ=255)
aattaattGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTAc < 2:873205/150‑1 (MQ=255)
aattaattGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACt < 1:862988/151‑1 (MQ=255)
aattaattGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACt < 2:1195279/151‑1 (MQ=255)
attaattGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTg > 2:1006633/1‑151 (MQ=255)
taattGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGGGGCTATTTTTGGCGAGACTTCTACTGtt > 1:550285/1‑151 (MQ=255)
aattGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGtt < 1:1473065/150‑1 (MQ=255)
tGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTc < 2:1235249/149‑1 (MQ=255)
tGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCa > 2:1254928/1‑150 (MQ=255)
tGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCa > 1:1444572/1‑150 (MQ=255)
gATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCaaa < 2:934606/151‑1 (MQ=255)
gATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGAGGGGAGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCaa > 2:183901/1‑150 (MQ=255)
aTCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAg < 2:789237/151‑1 (MQ=255)
cAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAgg < 2:1591013/150‑1 (MQ=255)
cAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAgg > 1:917876/1‑150 (MQ=255)
aCCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGGGCTTTTTCGGCTGCCAGTTTCAGCACTGGTGGGGAGGATATTTTTGGCGAGACTTCTAGTGTTTCAAAGGTa > 1:543058/1‑150 (MQ=255)
ccTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAAt < 2:1540230/151‑1 (MQ=255)
ccTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAAt < 2:641355/151‑1 (MQ=255)
tttCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCt < 2:1041160/150‑1 (MQ=255)
ttCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTg > 1:1360331/1‑150 (MQ=255)
tCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGAt > 2:1379004/1‑151 (MQ=255)
cTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATc > 1:596492/1‑151 (MQ=255)
aCCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATc < 2:656618/149‑1 (MQ=255)
aCCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCgg < 2:732273/151‑1 (MQ=255)
ccGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCGCGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTGGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGc < 1:228739/151‑1 (MQ=255)
ccGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGc > 1:1260429/1‑151 (MQ=255)
gCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCtt > 1:457030/1‑151 (MQ=255)
tACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTc > 2:1421333/1‑150 (MQ=255)
acGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATc > 2:329150/1‑151 (MQ=255)
ggATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATcac > 1:259650/1‑151 (MQ=255)
aTGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACaa < 2:704947/151‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACaa > 2:1513503/1‑150 (MQ=255)
gCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGTTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACaaa < 2:1650188/150‑1 (MQ=255)
ggtggATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACa < 2:109760/150‑1 (MQ=255)
gtggATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACaga < 1:561790/151‑1 (MQ=255)
gtggATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACaga < 1:1606072/151‑1 (MQ=255)
ggATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGt > 1:1364288/1‑151 (MQ=255)
gATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGt > 1:616336/1‑150 (MQ=255)
gATTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTa < 2:307626/151‑1 (MQ=255)
aTTCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTAc > 1:1142949/1‑151 (MQ=255)
tCATTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTAcc < 2:370673/150‑1 (MQ=255)
aTTGCTGCGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCt < 2:654192/151‑1 (MQ=255)
tgctgcGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCtgt > 1:487870/1‑151 (MQ=255)
gctgcGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCtgtg < 1:1479908/151‑1 (MQ=255)
ctgcGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCtgtg > 2:1047895/1‑150 (MQ=255)
ctgcGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCtgtg > 1:341771/1‑150 (MQ=255)
ctgcGCGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCtgtg > 2:1367343/1‑150 (MQ=255)
gcgcGTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCTGTGATg < 2:980090/151‑1 (MQ=255)
gcgTCGCTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCTGTGATGTc < 2:963066/151‑1 (MQ=255)
gtcgcTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCTGTGATGTCAt < 2:1334611/151‑1 (MQ=255)
|
ATCAAATCACCATGATTAACCGGGTCCAGTTCGCTGGAACGCTGGGCAAGCATGGACTGGGTGATAACCAGCTCGCCGACGAGGTTAATTAATTGATCAACCTTTTCTACCGCTACACGGATGCTGGTGGATTCATTGCTGCGCGTCGTTTTTTCCCGCTCCACGCGGCCGGTTGGCGCTTGTTCGGCTGCCAGTTTAAGCACTGGTGGGGTGGATATTTTTGGCGAGACTTCTACTGTTTCAAAGGTAATCTGATCGGCTTCAATCACAAAACAGAGTACCGCTGTGATGTCAT > NC_000913/1974414‑1974708
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
