Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F50 I2 R1
|
139 |
64.5 |
2139856 |
92.7% |
1983646 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,607,481 |
A→G |
T46A (ACC→GCC) |
tam → |
trans‑aconitate methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,607,481 | 0 | A | G | 98.6%
| 223.6
/ NA
| 71 | T46A (ACC→GCC) | tam | trans‑aconitate methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (39/31); total (40/31) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 |
CGGGAGTAAAAAAATGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCACCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTACAGGCACTCG > NC_000913/1607333‑1607628
|
cGGGAGTAAAAAAATGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGcc > 1:314690/1‑151 (MQ=255)
cGGGAGTAAAAAAATGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGcc < 2:736695/151‑1 (MQ=255)
tAAAAAAATGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCtt > 2:652511/1‑151 (MQ=255)
aaaaaTGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCt > 1:331925/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTac > 1:19819/1‑151 (MQ=255)
aaaTGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTaca < 2:645849/151‑1 (MQ=255)
aaTGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTaca > 2:766603/1‑150 (MQ=255)
aTGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTacaa > 2:324557/1‑150 (MQ=255)
cTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACg > 2:471652/1‑151 (MQ=255)
gACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGtt < 1:918776/151‑1 (MQ=255)
cTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTgg > 2:222266/1‑151 (MQ=255)
ggAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGcc < 1:153510/151‑1 (MQ=255)
aaCCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTg < 1:798694/151‑1 (MQ=255)
cccTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCgg < 1:331091/151‑1 (MQ=255)
cccTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCgg > 2:518287/1‑151 (MQ=255)
tttATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGTAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGCAACAGCACCGCCCTTTTACAACAACGTTGGCCGGCGGCCCgg > 2:457165/1‑151 (MQ=255)
ttATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAg < 1:284059/149‑1 (MQ=255)
tataTCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGAt > 1:191830/1‑151 (MQ=255)
atatCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATa < 1:128296/151‑1 (MQ=255)
tACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAgg > 2:113927/1‑151 (MQ=255)
tttCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCg > 2:761155/1‑150 (MQ=255)
tttCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCg < 1:959700/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGa < 1:789294/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGAACGATAGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGGATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACCACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAAAAGGCATCg > 2:436432/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTc > 2:230618/1‑151 (MQ=255)
tGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGtct > 2:542338/1‑151 (MQ=255)
tGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGtct > 1:934914/1‑151 (MQ=255)
tGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGtct > 2:275177/1‑151 (MQ=255)
tGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGtc > 2:869639/1‑150 (MQ=255)
aaCGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGTATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTcc > 1:762164/1‑151 (MQ=255)
cgcgTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCgat < 2:546488/151‑1 (MQ=255)
gcgTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCgatg > 1:853594/1‑151 (MQ=255)
ggcggTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACACGTCTCCGGCGATGATTGCt < 1:984430/151‑1 (MQ=255)
tGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCt > 1:20208/1‑151 (MQ=255)
tGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCATCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTg < 1:641962/149‑1 (MQ=255)
gCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGACCTTCTACAACAGCGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCtt < 2:331304/151‑1 (MQ=255)
agagTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGc > 1:387785/1‑151 (MQ=255)
agTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGcc > 2:881488/1‑150 (MQ=255)
agTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGcc > 2:972111/1‑150 (MQ=255)
tGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGcc > 1:247053/1‑148 (MQ=255)
tGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGcc > 1:215795/1‑150 (MQ=255)
tGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGcc > 1:935878/1‑150 (MQ=255)
gtcaaaTGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGcc > 2:141511/4‑149 (MQ=255)
gAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGa < 1:288058/122‑1 (MQ=255)
gAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGa > 2:288033/1‑122 (MQ=255)
gAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGt > 1:778114/1‑151 (MQ=255)
aaaaTGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGtt > 1:626074/1‑151 (MQ=255)
aaaaTGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGtt < 1:934191/151‑1 (MQ=255)
aTGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGt < 1:574323/151‑1 (MQ=255)
cGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGaa < 1:82509/151‑1 (MQ=255)
aaTATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGc > 1:220648/1‑151 (MQ=255)
atatGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCa < 1:175322/151‑1 (MQ=255)
atGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAg < 2:34255/150‑1 (MQ=255)
atGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAg < 1:647479/150‑1 (MQ=255)
gCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATc < 2:268987/150‑1 (MQ=255)
ccGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATcc > 1:992988/1‑150 (MQ=255)
ccGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCg > 1:44102/1‑151 (MQ=255)
cGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGc > 2:354669/1‑151 (MQ=255)
gATATTGGCTGCGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGCCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAGGCGGACATCCGc > 2:188459/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGc < 1:1013037/145‑1 (MQ=255)
tGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCaa < 2:494517/147‑1 (MQ=255)
ggCTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTgg < 1:944388/150‑1 (MQ=255)
cTGTGGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCa > 1:737858/1‑150 (MQ=255)
gtgGCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAAcc < 2:277705/151‑1 (MQ=255)
ggCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCgg < 1:73511/151‑1 (MQ=255)
ggCCCAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCg < 2:1047252/150‑1 (MQ=255)
cAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTAc > 2:108330/1‑150 (MQ=255)
cAGGTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTACa < 2:957477/151‑1 (MQ=255)
gTAACAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTACAGGc < 2:188924/151‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTACAGGCACTc > 2:337411/1‑151 (MQ=255)
aGCGCCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTACAGGCACTCg < 1:971665/151‑1 (MQ=255)
|
CGGGAGTAAAAAAATGTCTGACTGGAACCCCTCTTTATATCTACACTTTTCCGCTGAACGATCGCGTCCGGCGGTGGAGCTGCTTGCCAGAGTGCCGCTGGAAAATGTCGAATATGTTGCCGATCTTGGCTGTGGCCCAGGTAACAGCACCGCCCTTCTACAACAACGTTGGCCTGCGGCCAGGATAACAGGCATCGACTCGTCTCCGGCGATGATTGCTGAAGCGCGCAGTGCTTTGCCAGACTGCCAGTTCGTGGAAGCAGACATCCGCAACTGGCAACCGGTACAGGCACTCG > NC_000913/1607333‑1607628
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
