Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,781,546 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,781,546 | 0 | A | T | 98.8%
| 765.3
/ NA
| 331 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (171/155); minor base C (4/0); total (176/155) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 |
| * | CP042583 | 1,781,547 | 0 | G | C | 99.1%
| 769.4
/ NA
| 331 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (174/153); minor base A (2/1); total (176/155) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 1,781,548 | 0 | C | G | 99.1%
| 767.6
/ NA
| 331 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (173/155); minor base T (3/0); total (176/155) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.51e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
GTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTAGTGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCAGCCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACATCGGCTGGCAATACTGGAG > CP042583/1781268‑1781824
|||
tgttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAaag > 2:1534336/1‑289 (MQ=255)
tgttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAaag < 1:1534336/289‑1 (MQ=255)
acacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTAGCTGATTAAAGAAGCCCTGa > 1:2137155/1‑289 (MQ=255)
cacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGa > 1:100256/1‑288 (MQ=255)
tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑Acgcg > 1:439138/1‑288 (MQ=255)
aCAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGcc > 1:690119/1‑289 (MQ=255)
cAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCg > 1:595882/1‑289 (MQ=255)
gAAAGGCGCCTTGAGGTGCTGGCAGGATACCGTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGt < 2:1584326/286‑1 (MQ=255)
aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTCCCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCCTTACGCACTGACTGGCCGGATGCCACTGCCGGCTCGCCAATTAAAGAAGGCCTGACACGCG‑CTTTGCCGTg > 2:1963359/1‑289 (MQ=255)
aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGTCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTg > 1:1381188/1‑289 (MQ=255)
aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTg > 1:1707388/1‑289 (MQ=255)
cgcCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGa > 1:1951086/1‑289 (MQ=255)
gcCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ATGCGCCGTTGCCGTGGAg < 1:1447965/289‑1 (MQ=255)
cTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACCGACTGGATGGATGCCATCGCAGGATCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑AGTCGCTGGTGCCGGGGa > 2:850301/1‑286 (MQ=255)
tgtgCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcg < 1:490753/288‑1 (MQ=255)
gtgCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcgcg < 1:1466568/289‑1 (MQ=255)
tgCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcgcg < 2:1415427/288‑1 (MQ=255)
gCTGGGAGGATACCGTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCTGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCgcgg < 2:1732994/288‑1 (MQ=255)
tGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGACATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCCTACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGAGGCCATAGCAGGGTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑AAGCCCCGTAGCTGGGGCGCTACCgcggc > 2:1694693/1‑287 (MQ=255)
agggtccgttgcaggAATGCCTGCCCCGGGAGAGAAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCGGAAGGCCTGTCACCAACTGCTAAAAGCTATCCTTACCCGGTGGCGCCAGCACAAGCTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGGCGCGCAACTGCATGCGATGGGGCTGGGACAGTTGGGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCGGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:1856707/276‑1 (MQ=255)
aGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:1804883/289‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCTGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:2093365/286‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:1121457/286‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:972841/286‑1 (MQ=255)
acgtttcaggAAGGCCTGCCCCGGTATGGAAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATcc < 2:745430/281‑1 (MQ=255)
acctttcaggAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATcc < 1:1139457/281‑1 (MQ=255)
tgcctgccCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATAccgatcc > 1:156431/1‑289 (MQ=255)
cctgccCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATAccgatccga > 1:158841/1‑289 (MQ=255)
cctgccCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATAccgatccga > 1:1402188/1‑289 (MQ=255)
cctgccCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCGCGATGCCATAGCAGGCTCGGTGATTATAGAAGGCCTGA‑ACGCCCCGTTGCCTGTGAGCTATCGCCGCGCTATTTAATCCTGTAccgacccgg > 2:727765/1‑288 (MQ=255)
cgcggattGGCAAACATGGTGAGGGCAGGGGGGTTTGCCGAAGGCCGTTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATAGGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTg < 2:1265010/282‑1 (MQ=255)
aaaCTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATAccgat > 1:544907/1‑268 (MQ=255)
aaaCTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATa < 1:1686736/289‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑CCGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGac > 1:1289011/1‑289 (MQ=255)
ggTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGCTAccgatccgat > 2:2228047/1‑268 (MQ=255)
tGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACAt > 1:40121/1‑289 (MQ=255)
ggCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCATTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTGATTCATCCCGATCCCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTac > 2:2035216/1‑287 (MQ=255)
aGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATcc > 1:462138/1‑244 (MQ=255)
ttGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGa < 1:364355/288‑1 (MQ=255)
tGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAaag > 1:658084/1‑186 (MQ=255)
tGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGAt > 1:2221675/1‑288 (MQ=255)
tGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGAt > 2:1307532/1‑288 (MQ=255)
tGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACAGTAGCGGGTTACGGGtt > 2:524607/1‑289 (MQ=255)
ggCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATAc < 2:951291/234‑1 (MQ=255)
cccgtgcacctcctcTAAACACTATCCTTCCCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCGTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTGATTTGCATGGGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTaaa < 2:17656/273‑1 (MQ=255)
tGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGc < 2:439138/288‑1 (MQ=255)
tGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGc < 1:1764033/288‑1 (MQ=255)
gAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGcc < 2:362376/288‑1 (MQ=255)
tGCTACAAACTCTCCGTACCCGTGTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTTTACCGCGGATATGGCTGCGGCTCAGCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTCCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTc < 2:2114201/286‑1 (MQ=255)
aaaaaCTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAg < 1:813090/189‑1 (MQ=255)
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tttGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCTCTGATTAAAGAGGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTCTCGCGGCGTTATTTATCCCGATACCGATCCGACTCTGCTCACGTTGATAGACACATTACCCGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCCCCTCGCCCaaaa > 2:1389504/1‑289 (MQ=255)
tttGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGCAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTCATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCACTTCCACGCCACAACCGCCTCTCCCaaaa > 1:1061860/1‑289 (MQ=255)
tttGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGAt < 1:707555/222‑1 (MQ=255)
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tttGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCaaaa > 2:1601718/1‑289 (MQ=255)
ttGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAg > 2:1634448/1‑289 (MQ=255)
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acaAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCt < 1:916518/288‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGa < 2:1215188/225‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGa > 1:1215188/1‑225 (MQ=255)
aTTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGaa < 1:1307532/289‑1 (MQ=255)
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cccGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTgg > 1:1649713/1‑289 (MQ=255)
cTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCg > 2:1674769/1‑279 (MQ=255)
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ctatGGCTCCCCGTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCCCAGTTGCGCGGTCCTACCCTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGAGGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATATCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAAtct < 2:412305/287‑1 (MQ=255)
gCCGCTGATCTTCCTGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTTGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCcgg < 2:100256/289‑1 (MQ=255)
ccGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCcggc > 1:1917974/1‑289 (MQ=255)
ccGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTCCGAACCGGAACGTACCGCAACCCCCCTTCcgg > 2:27438/1‑288 (MQ=255)
cGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCcggcg > 1:312542/1‑289 (MQ=255)
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ggCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCg < 2:925845/288‑1 (MQ=255)
cgcTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCt < 1:2035216/288‑1 (MQ=255)
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tACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTaaa > 2:640204/1‑161 (MQ=255)
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tGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGtt > 2:328138/1‑270 (MQ=255)
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cATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACATCGGCTGGCAATACTGgag < 1:1018210/289‑1 (MQ=255)
aTAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGCACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTCAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCGCGCGCAAAGTCAGGTGTTACATCGCCTGTCAATACGGga > 2:1801391/1‑287 (MQ=255)
|||
GTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTAGTGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCAGCCTGATTAAAGAAGCCCTGA‑ACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACATCGGCTGGCAATACTGGAG > CP042583/1781268‑1781824
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
