Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
809,137 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 809,137 | 0 | A | T | 100.0%
| 492.7
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (103/105); total (103/105) |
| * | CP042583 | 809,138 | 0 | G | C | 98.5%
| 475.0
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (102/101); minor base A (0/3); total (103/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 809,139 | 0 | T | A | 98.5%
| 470.4
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (99/103); minor base C (3/0); total (103/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCAGTTCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGAGTCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTAGTACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATAGCACGAGTATTACGAGTATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCAGTGGAATCGTTCTGGGATC > CP042583/808865‑809417
|||
caTGTCCACATGGCAGTTAGGCGGTGTCAGCTCATCCGAGTTTACCGGCAACATTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:1610524/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:1434011/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 1:4914/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 1:523627/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct > 2:459052/1‑289 (MQ=255)
tGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGATATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatga < 1:293506/289‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTAGGCCTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATGGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatga < 1:1751487/289‑1 (MQ=255)
ggCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatgat > 1:236926/1‑289 (MQ=255)
ggCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTAGCTGGCCTCCTTCATGTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGTCTTGGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGGTTGTGTGCTGTGGGGCGTTGCGTAACCGTGTGCGTTTGCTTGCTGCGTACatgtt > 2:1685408/1‑287 (MQ=255)
cGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGGGGGTGTGTAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTAc > 1:1111731/1‑289 (MQ=255)
gtcagctcatCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatgat < 2:480394/266‑1 (MQ=255)
gtcagctcatCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTgg > 1:363514/10‑289 (MQ=255)
tcagctcatCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTggg > 1:38803/9‑289 (MQ=255)
aTTTTCCCTGGAACCTTGTCGGTACATTGCGGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAgg < 2:1246235/289‑1 (MQ=255)
aTTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGACCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAgg < 2:236926/289‑1 (MQ=255)
tttACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGcc < 1:434076/289‑1 (MQ=255)
ccGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:1538316/245‑1 (MQ=255)
ccGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct > 1:1538316/1‑245 (MQ=255)
aaCCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTgg > 1:1078062/1‑289 (MQ=255)
aaCCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCAGGATATGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTGGCTTGCTTGGTCTGTGGTGGCTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACggg > 2:1570656/1‑289 (MQ=255)
tGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGc < 2:1078062/289‑1 (MQ=255)
tCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGGTGTTGAGAGCGCGCGGATGTGCAGTGGGACGTCCAGTAACCGTGGGCGCTTGCTGCCTGTGTATGTGGGGGTTTTTTTAGGGTGAACGGGTTTTGGACGGTTACTGGTCAGCaa > 2:499159/1‑289 (MQ=255)
tGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCg < 2:1626643/214‑1 (MQ=255)
gCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGtttcaacc < 1:872114/289‑7 (MQ=255)
aCAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct > 2:653826/1‑219 (MQ=255)
aCAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGAGGGTTTATTACGGGGGAACGTTTTTAGGACAGTTACTGGTCTGCAAAGTTTCAACCGAgg > 1:1018759/1‑288 (MQ=255)
aGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatgat > 1:1621964/1‑228 (MQ=255)
aGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGaa < 1:1385379/245‑1 (MQ=255)
gTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCt < 1:121161/285‑1 (MQ=255)
aTGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGACGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCTTCGGCCGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGTTGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGt > 1:944724/1‑288 (MQ=255)
cgcttAGGCGCATTGGCGTTGCCCGCAGCTTTTGTCTGCCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGGTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGGGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGt < 2:1144879/286‑1 (MQ=255)
ctttAAGCGCTTTGGGTTTAACCGCAGTTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCTCTGGCTGGGCCGGTCTTGGCCTGAGGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTa < 2:1057371/287‑1 (MQ=255)
cATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTa < 1:1121208/289‑1 (MQ=255)
cATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTa < 1:1790702/289‑1 (MQ=255)
aTTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTAt > 1:377640/1‑289 (MQ=255)
aTTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTAt > 1:1479259/1‑289 (MQ=255)
tAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTAtt > 1:613940/1‑288 (MQ=255)
tAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCCGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGCTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTCCGTACCTGATGGTTTATTACGTGGGACCCGTTTTCGCCCCGGTACTGGGCAGCCAAGTGTCAACCGAGCCGATGTCCGTCtt > 2:1376952/1‑288 (MQ=255)
tAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCC‑TCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg < 1:1896403/213‑1 (MQ=255)
tAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCC‑TCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg > 2:1896403/1‑213 (MQ=255)
aGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGCCCAGTTACTGGTTAGCAAAGTTTCAACCGGGCTGATGTCCGTATTgac > 1:655860/1‑287 (MQ=255)
gcATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCg < 1:1542466/287‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGcc > 2:1468023/1‑239 (MQ=255)
cATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGcc < 1:1468023/239‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGATGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTAGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCTGTGGGCTGTCATGTCACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTGTCTGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTTAGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCCAGCTGACGTCCGGCTTGCCGCgg > 2:1267106/1‑289 (MQ=255)
ttAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAgg > 1:1056568/1‑289 (MQ=255)
cAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTGTATGATGGTTTATTCTGTGGTAACTCTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAATTTTGAACGTAGCTGATGTCCTTATTGCCGTGGGTTAGAGGTTTgggg > 2:1164790/1‑286 (MQ=255)
cAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatga > 1:1574313/1‑194 (MQ=255)
cAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACg > 1:306812/1‑289 (MQ=255)
cAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACg > 1:1006597/1‑289 (MQ=255)
cAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGCATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACg > 1:1698561/1‑289 (MQ=255)
agcTGGCCTCGTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGGGCTGGTTGGCTTGGCGTTTGGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAgg < 1:499159/287‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCTTCCTTTTTGCCGTTGGCTGTGCCGGCGTTGGCCTGATGGTTGAGTTCTGGAGCTGGTTGGCTGGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGa < 2:1698561/289‑1 (MQ=255)
tGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTTGCGTTTTGTCGCCGGCGTCGGCTGTGCCCTGAATTGGGTGGTTGTTGAGAGCTCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGTGCTATTGCGTTGGCACGTTCTTAGGCCTGTTACTGGTCAGCAAAGTTCCAGCCGAGCTGATGTCCGTATTGTCGTGGTGTACAGGTTTGACGtgtgcggtga > 2:174442/1‑279 (MQ=255)
gCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCt > 1:576208/1‑289 (MQ=255)
gCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCt > 1:1722492/1‑289 (MQ=255)
tcctTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg > 2:418168/1‑177 (MQ=255)
tcctTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGttttt < 1:1509417/203‑1 (MQ=255)
tcctTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGCCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGCACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGGTGATGTCCGTAGTGGCGTGGGTTCACGGTTTGCAGTTGGCAGGGATCTTa > 2:303106/1‑288 (MQ=255)
cctTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAgg > 2:148071/1‑205 (MQ=255)
ttCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGTTTGGATTCTGGAGCTGGTTAGCTTGGCGTTTGGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGc < 1:1267106/289‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCtg < 2:1106066/289‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCtg < 1:1656051/289‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCtg < 2:38803/289‑1 (MQ=255)
aggtttGCCGTGGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATGCTGTGGCTGGTTGGCTTGGCGTGTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGGGGGCTGATGTGCAGGGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCtg < 2:1351700/285‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGt > 1:721958/1‑232 (MQ=255)
gCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGt < 2:721958/232‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGttt > 1:759291/1‑288 (MQ=255)
ccTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCCGTTACTTGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGGTTGACGTTTGCATGGTTCTTACCGCTGTTGTTTATGCGTTTGCTGAATca > 1:79154/1‑288 (MQ=255)
ggCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAgg > 1:439641/1‑289 (MQ=255)
gatgatTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCg > 2:575586/1‑217 (MQ=255)
atgatTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGaaa > 2:937643/1‑289 (MQ=255)
atgatTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGaaa > 1:1481609/1‑289 (MQ=255)
tCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGCGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGGAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACTCGTGTTCTGAAGCAGCAGGCGGAAAACCATGAt > 2:1323348/1‑287 (MQ=255)
ggtgggttgggttgGCGTTTTGTCGGGGGGGTCGGCTGTGCCATGGTTTGGGTGGTTGTTGAGGGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGAttcgacg < 2:759291/284‑7 (MQ=255)
gggtGGTTGGCTGGGCTTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGGGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGAttcgacg < 2:1111731/285‑7 (MQ=255)
ggTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGAttcgacgtcaat > 2:1886062/1‑278 (MQ=255)
cGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTCTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGTTGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACTCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTGTACGTCCATTACgtcaatga > 2:203861/1‑282 (MQ=255)
tgtcATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTAAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCtt > 2:1830234/4‑289 (MQ=255)
tGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGt > 1:604969/1‑289 (MQ=255)
tttGGGTTGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGa < 1:1356496/288‑1 (MQ=255)
tGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATg < 1:351175/289‑1 (MQ=255)
gggTGTTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTTGGACGTCGCGGAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATgg < 2:1402625/289‑1 (MQ=255)
gggTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATgg < 1:968799/289‑1 (MQ=255)
ttgttgAGAGCGCGGTGTGGTGCAGTGGGACGTGACGTAAGCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCa < 2:1732537/288‑1 (MQ=255)
ttgttgAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTa < 1:1420773/153‑1 (MQ=255)
ttgttgAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTa > 2:1420773/1‑153 (MQ=255)
ttgttgAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCAt > 1:464055/1‑289 (MQ=255)
ttgttgAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCAt > 1:328920/1‑289 (MQ=255)
agCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTa < 2:311139/132‑1 (MQ=255)
cgcgcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACTGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATctcagga > 1:216264/1‑283 (MQ=255)
gcgcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATctcaggaa < 1:1670031/289‑8 (MQ=255)
cggtGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATctcaggaa < 1:1376952/285‑8 (MQ=255)
cgcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTTAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATtctctacagaa > 2:1670031/1‑281 (MQ=255)
gcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAAc < 2:765909/75‑1 (MQ=255)
tcAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTgg < 1:1105862/287‑1 (MQ=255)
gCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTgg < 2:363514/288‑1 (MQ=255)
gCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGATCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTggg < 1:267942/289‑1 (MQ=255)
gTGGGACGTAACGTAATCGTGTGGGGTTGCTTGCTTCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTGGGAt < 2:1007341/288‑1 (MQ=255)
tGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGGGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTGGGAtc > 2:858121/1‑288 (MQ=255)
|||
CCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCAGTTCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGAGTCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTAGTACCGAGCTGATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATAGCACGAGTATTACGAGTATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCAGTGGAATCGTTCTGGGATC > CP042583/808865‑809417
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
