Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
809,137 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 809,137 | 0 | A | T | 98.5%
| 480.5
/ ‑6.1
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (92/111); minor base G (3/0); total (97/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.64e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 809,138 | 0 | G | C | 99.0%
| 477.9
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (96/109); minor base A (1/1); total (97/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 809,139 | 0 | T | A | 99.5%
| 484.8
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (96/111); minor base C (1/0); total (97/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCAGTTCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGAGTCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTAGTACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATAGCACGAGTATTACGAGTATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCAGTGGAATCGTTCTGGGATC > CP042583/808865‑809417
|||
gAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGttt > 2:438245/1‑287 (MQ=255)
cacaTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTttgcttg < 1:1591024/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCTTTGTCAGCTGTTCCTATGTTACCGGCAACCTTGTCGTTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:637044/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 1:311152/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:329496/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 1:438245/289‑1 (MQ=255)
caTGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCCATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:170537/289‑1 (MQ=255)
tGTCAACATGGCAGGTATGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTtgctgc < 1:1032980/289‑1 (MQ=255)
aTGGCAGGTGGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg < 2:1656969/289‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatga < 2:193735/289‑1 (MQ=255)
cAGGTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatga < 2:1713968/286‑1 (MQ=255)
gTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:383458/273‑1 (MQ=255)
gTAGGCGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTATGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCCGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGta > 2:502308/1‑278 (MQ=255)
cGTTGTCAGCTCATCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCGTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGGGGTTGTTGAGAGCGCGCTGGTGTGCAGGTGGCCGGCACGGAACCGTGGGCGTTTTACTGCTGGGTATATGATGGttttgtac > 2:592473/1‑284 (MQ=255)
ctcatCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCCCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTCTATGTTGGTTTTTTACGTGGGAACg > 2:1222160/5‑289 (MQ=255)
tCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGtttt < 1:465416/289‑1 (MQ=255)
aTTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAgg < 2:20020/289‑1 (MQ=255)
aTTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAgg < 1:436373/289‑1 (MQ=255)
cGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTTGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTGTTAGGCCAGtt > 1:1571833/1‑288 (MQ=255)
cGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGGGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGGGCTGTGGTTCAGTGGGACGGCACGTAAACGTGGGCGGTTGCTTGGTGCGGTTGTGATGGTTTAATACGTGGGAACTgttttggtgtcgttg > 2:46898/1‑279 (MQ=255)
gCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAgg > 2:1100488/1‑280 (MQ=255)
gCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGc > 1:502881/1‑281 (MQ=255)
aaCCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTTGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGGGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACggg > 1:1801917/1‑289 (MQ=255)
tttCGGTACATTGCTGACAGGGTATTGCATTAAGCGCTTTGGCTTTAACCGCAGCTATGATCTGGCCTCCTTCGTTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGc < 2:1156881/287‑1 (MQ=255)
aCATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGttt < 1:1606248/289‑2 (MQ=255)
aCATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGGTTATTACGGGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTgggtctcaaagttt > 2:1606135/1‑277 (MQ=255)
aTTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCGATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct > 1:1351856/1‑226 (MQ=255)
aTTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCGATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTtgcttgct < 2:1351856/226‑1 (MQ=255)
tGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatgat < 1:1849921/235‑1 (MQ=255)
tGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGtttcaa > 2:784375/1‑284 (MQ=255)
tGCTGACAGGGTATGTCATGAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTAGCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGaa < 1:1622489/252‑1 (MQ=255)
aCAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGtttcaaccga > 1:707481/1‑279 (MQ=255)
cATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTa < 1:784375/289‑1 (MQ=255)
cATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTAGCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTa < 1:1790763/289‑1 (MQ=255)
aTTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatgat < 2:308082/218‑1 (MQ=255)
aTTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg < 2:1282402/216‑1 (MQ=255)
aTTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCACCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATatg > 1:1282402/1‑216 (MQ=255)
tAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGGTTGCTTGCTGCGTATATGGTGGTTTATTACGTGGGCACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTAtt > 2:810531/1‑288 (MQ=255)
aaGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCGGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTAAGAAAAGTTTCAACTGAGCTG‑GGGTCCGTCTTg > 2:1735275/1‑288 (MQ=255)
aGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGt < 2:1129109/279‑1 (MQ=255)
aGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGcc < 1:874288/289‑1 (MQ=255)
aGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGcc > 1:1073944/1‑289 (MQ=255)
cATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAg < 1:989396/268‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGttg > 1:378442/1‑287 (MQ=255)
cATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTgg > 1:625735/1‑289 (MQ=255)
tGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGGTGGAACGGTTTTAGGCCAGTTACTGGGTCGCAAATTTTCAACCG‑GCTGCATGTCCTTATGTCCGTTGGtt > 2:1319556/1‑289 (MQ=255)
aCCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGGTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTTTTGCCGGTGGTTatcgggtt > 2:43035/1‑282 (MQ=255)
cAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGc > 1:1517763/1‑238 (MQ=255)
tataagagtgagtctTTATTTTGTCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGGTGATTGGATTCTGGGGCTGGTTGGCTTGGCGTGTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGGGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGc < 2:1921191/276‑1 (MQ=255)
atgttgCCTCCTTCATTTTTGCCACTGGCTGTGGCGGACTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTGTTGTCTCGTGCGTCGGCTGTGCCTTGATTTGGGTGGTTGTTGTGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAgg < 2:1788703/284‑1 (MQ=255)
atCTGGCTCCTTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATAGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAgg < 2:510437/289‑1 (MQ=255)
atCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAgg < 1:927533/289‑1 (MQ=255)
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gCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCt > 1:36341/1‑289 (MQ=255)
gCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGGGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCt > 1:287812/1‑289 (MQ=255)
cctcctTCTTTTTTGCCGCTGGCTGTACCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGTTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATCGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCt < 1:1117993/288‑1 (MQ=255)
tcctTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTa > 1:1502646/1‑288 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGGGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCtg < 2:551762/289‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTa < 1:254683/257‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTa > 2:254683/1‑257 (MQ=255)
cATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCtg < 1:727802/289‑1 (MQ=255)
gCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTa > 1:1921191/1‑276 (MQ=255)
gCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGc > 1:9806/1‑280 (MQ=255)
gCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGttt > 1:869270/1‑288 (MQ=255)
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tgtgCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGtgtg < 1:853150/288‑1 (MQ=255)
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cTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATcagc < 2:982329/289‑1 (MQ=255)
cTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCGGTGCCATAAGTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGTGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTGTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATcagc < 1:1454504/289‑1 (MQ=255)
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gatgatTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGaa < 1:1320294/289‑1 (MQ=255)
tGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGt < 2:1335753/230‑1 (MQ=255)
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tggcttggcGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTTGGCGTTTGCTTGCTGCGGATATGATGGTTTATTACGTTGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGGTTCAACAGAGCTG‑ATGTCGTTATTGCCTTGGGTTACAGGTTTGTCGTTGGAAGGGATCTTAACGGTGTTTTTTACGCGTGTGCTGAGTTAACGGGCTGACAACCAGGAttcgagggccattac > 2:973715/1‑275 (MQ=255)
cttggcGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCt > 1:992582/1‑175 (MQ=255)
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ggtggaTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGATGAATCAGCCGGACGAAAACCATGATTCTACGTCAATTACGTCAATGCTAAACCTCCGTCCGGCGCGGCTTGGCGCGAATgg > 2:1655095/1‑288 (MQ=255)
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cgcgcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATctcagga > 1:556586/1‑283 (MQ=255)
cgcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATctcaggaat > 2:824/1‑281 (MQ=255)
cgcTGATGTGCAGTGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATctcaggaa < 2:713807/288‑8 (MQ=255)
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ttggCAGTGGGACGTAACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCt < 2:36341/286‑1 (MQ=255)
tGGGACGTCACGTAACCTTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGTATTATTACGTGGGAACGTTTTTATGCCAGTTAATGGTCAGCAAAGTTTCAACCGATCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGGGTGTGCTGAATCAGCAGACTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATTCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTGGGAtc < 1:1206862/288‑1 (MQ=255)
tGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTGGGAtc > 1:1776483/1‑288 (MQ=255)
tGGGACGTCACGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTTCAACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATTCGACGTCAATTACGTCAATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCTCAGGAATCGTTCTGGGAtc > 2:1957985/1‑288 (MQ=255)
|||
CCCAGGAACACATGTCCACATGGCAGGTAGGCGTTGTCAGCAGTTCCTATTTTACCGGCAACCTTGTCGGTACATTGCTGACAGGGTATGTCATTAAGCGCATTGGCTTTAACCGCAGCTATTATCTGGCCTCCTTCATTTTTGCCGCTGGCTGTGCCGGCCTTGGCCTGATGATTGGATTCTGGAGCTGGTTGGCTTGGCGTTTTGTCGCGGGCGTCGGCTGTGCCATGATTTGGGTGGTTGTTGAGAGCGCGCTGATGTGCAGTGGGACGAGTCGTAACCGTGGGCGTTTGCTTGCTGCGTATATGATGGTTTATTACGTGGGAACGTTTTTAGGCCAGTTACTGGTCAGCAAAGTTAGTACCGAGCTG‑ATGTCCGTATTGCCGTGGGTTACAGGTTTGACGTTGGCAGGGATCTTACCGCTGTTGTTTACGCGTGTGCTGAATCAGCAGGCTGAAAACCATGATAGCACGAGTATTACGAGTATGCTAAAACTCCGTCAGGCGCGGCTTGGCGTGAATGGCTGCATTATCAGTGGAATCGTTCTGGGATC > CP042583/808865‑809417
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
