Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,781,324 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,781,324 | 0 | A | T | 98.8%
| 597.3
/ NA
| 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base T (115/138); total (117/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| * | CP042583 | 1,781,325 | 0 | G | C | 100.0%
| 601.6
/ NA
| 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (117/139); total (117/139) |
| * | CP042583 | 1,781,326 | 0 | T | A | 98.8%
| 594.0
/ NA
| 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (117/134); minor base G (0/3); total (117/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.52e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
CACTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCAGCCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTAGTGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCAGCCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATT > CP042583/1781045‑1781602
|||
cTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAAtgcct < 2:1178680/289‑1 (MQ=255)
cTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAAtg > 1:1204149/1‑286 (MQ=255)
cTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAAtg > 1:153152/1‑286 (MQ=255)
tttGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGccc < 2:506714/289‑1 (MQ=255)
aaCTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGGGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATg > 1:712551/1‑289 (MQ=255)
cTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAACATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGc > 1:169306/1‑289 (MQ=255)
cTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGc > 1:164424/1‑289 (MQ=255)
aCGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGt > 1:1783154/1‑288 (MQ=255)
aCGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTg > 2:791202/1‑289 (MQ=255)
cGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTTATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGt > 2:935673/1‑287 (MQ=255)
cTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTg < 1:1017064/288‑1 (MQ=255)
ccGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTCGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAACCAGAATTCCCCTCCCTGGCAGATGCCGTCACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTCAAAACCGCCTCGACGTGCTGCTAGCATCCTTCTCAGGAATGCCTGCCCCCATATGCTAAAACTGGGTCTGGCa > 2:1269855/1‑289 (MQ=255)
aGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCgg > 1:1478681/1‑289 (MQ=255)
cccGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGGGAGGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGGGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTaaaaa < 2:1480768/288‑1 (MQ=255)
ccGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACt < 1:305110/289‑1 (MQ=255)
ccGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACt > 1:1716529/1‑289 (MQ=255)
gCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTTCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCCAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGTTGAACAACTCCTAAAACCTa > 2:1434848/1‑288 (MQ=255)
cTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTAt > 1:1192688/1‑288 (MQ=255)
tggatGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCt > 1:21566/1‑248 (MQ=255)
gatGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAAATGCTAAAAACTATCCTTACCCg > 2:853699/1‑289 (MQ=255)
gCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCCAAACTGGTGCTGGCAGTggg > 1:1836941/1‑238 (MQ=255)
gCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTggg < 2:1836941/238‑1 (MQ=255)
gCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTTCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTTAAAACTATCCTTACCCGTTTgc > 1:979310/1‑289 (MQ=255)
gATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTgcg < 2:1716529/288‑1 (MQ=255)
ctaagGGGGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAAC‑ACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTg < 2:1515735/288‑1 (MQ=255)
taatGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCGAAAAACTATCCTTACCCTTTTGCGCCCGCCCAAATTg > 2:13133/1‑289 (MQ=255)
aCGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCt > 2:303293/1‑287 (MQ=255)
tgtTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTa > 2:570161/1‑288 (MQ=255)
gtTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAcc < 1:1593641/289‑1 (MQ=255)
gtTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAcc < 1:512732/289‑1 (MQ=255)
gTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGata > 2:1137745/1‑289 (MQ=255)
tCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGatat > 1:1520268/1‑289 (MQ=255)
cTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGc > 1:286552/1‑216 (MQ=255)
cTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGtt < 1:338913/251‑1 (MQ=255)
cTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATg > 1:483162/1‑289 (MQ=255)
tGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTAt > 2:663142/1‑239 (MQ=255)
tGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTAt < 1:663142/239‑1 (MQ=255)
cGGTGGCTGGAACGATCCGGAACTGGCAAAGTGGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGc < 2:1599307/288‑1 (MQ=255)
ctggcACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGc > 1:1514658/1‑288 (MQ=255)
tCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCCGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGAACTGGCTGCCGCTCCTCCGCAt > 2:341371/1‑289 (MQ=255)
tCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCAt > 2:1383588/1‑289 (MQ=255)
gaCTGGCAAAGATGGGGCGCGAATGCCCGCAGAAAATTAACAAGCCAGAATGGCCCTCGGTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGa < 2:1214219/287‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGgc < 1:905323/289‑1 (MQ=255)
tGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGCTTGCCCCAGCACAAATTGCCTGCCTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCCCAGCTGCATGCGTTGgc > 2:1028095/1‑289 (MQ=255)
gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAgg > 2:1854552/1‑187 (MQ=255)
gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAgg < 1:1854552/187‑1 (MQ=255)
gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCGTCTGCATGCGATGgcg > 1:1634782/1‑288 (MQ=255)
gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGgc > 1:1158272/1‑287 (MQ=255)
gCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCCCATCTGCATGCGATGgcg > 2:508373/1‑288 (MQ=255)
ggCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGtt > 2:888245/1‑289 (MQ=255)
cgcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTg < 2:702291/288‑1 (MQ=255)
cgcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCGGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGGGAAACGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTg < 2:40098/288‑1 (MQ=255)
gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGTTGTGGTGGCAGGATAGCTTTCAGGAAGGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:373732/289‑1 (MQ=255)
gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:1283731/289‑1 (MQ=255)
gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:935895/289‑1 (MQ=255)
gcgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 1:444188/289‑1 (MQ=255)
cgAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCGGAATTGGACTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCGCACAACATACAGTGAACAGCGCCTTGATGTGGTGGCAGGATACCTTTCAGTAATGCCTGCTCGGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGTGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACACCTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTgcg < 2:1914492/288‑1 (MQ=255)
aggCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGGACGTGGCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAGAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCgg < 2:1331011/286‑1 (MQ=255)
aTGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCgg < 2:1736644/288‑1 (MQ=255)
cAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATacac < 1:1662307/289‑1 (MQ=255)
aaaTTACAAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGAAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTa < 2:1778293/287‑1 (MQ=255)
aaaTTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTa < 1:1123616/287‑1 (MQ=255)
aaaTTAACAAGCCAGAATTGCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTa < 2:1637222/287‑1 (MQ=255)
gccctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggctg < 1:853699/282‑1 (MQ=255)
cctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGa > 1:602454/6‑289 (MQ=255)
cctcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGGGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGActggctgg < 1:83702/283‑1 (MQ=255)
tcgcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTAGAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATg < 2:1084874/286‑1 (MQ=255)
gcTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGcc > 1:1778823/2‑289 (MQ=255)
ggCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATa > 1:778091/1‑289 (MQ=255)
cGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAgcaggctcg < 1:1740541/289‑4 (MQ=255)
ttACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAcc > 1:1328088/1‑185 (MQ=255)
ttgttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAgcaggctcgctgat < 1:1434848/285‑9 (MQ=255)
tgttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAgcaggcc > 2:611650/1‑276 (MQ=255)
tgttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTaaa < 1:13133/288‑1 (MQ=255)
ttATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCCCAGTTGCGCGGTCATACAC‑ACCTTTACGACCTGACTGGCGTCATGCCATAGCAGGCTCCCCGACTgaagaa > 2:1693782/1‑288 (MQ=255)
aTCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCCGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACAAAACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTCaagaag > 1:701451/1‑288 (MQ=255)
cacCCTACAGTGAAAAGTGCATTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGaa < 2:712551/289‑1 (MQ=255)
cacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTAcc < 2:1647275/167‑1 (MQ=255)
cacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGa > 1:1058185/1‑288 (MQ=255)
cacCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGa > 1:1894805/1‑288 (MQ=255)
tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAAcgcg > 2:1679128/1‑288 (MQ=255)
tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCAGACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAAcgcg > 1:780532/1‑288 (MQ=255)
tACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCGGGAACAGTTGCGCGGTCCTACACTACCGTTACGCCCCGACTGGCTGGATTCCATAGCAGGACGCCTGATTTAAGAACACCTGAAcgcg > 2:1410413/1‑288 (MQ=255)
gAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCg < 1:136178/285‑1 (MQ=255)
aaaaGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGcc > 1:277353/1‑289 (MQ=255)
aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCCTACCCTACCGTTACGCCCTGACTGGCTGGATTGCATCTCAGGCTCGCTGCTTAAAGAACCCCTGAACCAGCCGGTCCCGtc > 2:1468284/1‑288 (MQ=255)
aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTCCCGTTACGCAATGACTGGCTGGACTCCCTAGACGGCGCGCTGCTTAAAGAAGCCCCGAAcgacgctttccctgg > 2:762331/1‑276 (MQ=255)
aGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTg > 1:1233839/1‑289 (MQ=255)
cTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACGGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCt > 1:550961/1‑289 (MQ=255)
tgtgCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcg < 1:888245/288‑1 (MQ=255)
gttgCTTGCAGGTTACCTTACTGGAAGGCCTGCCCCTGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCGGTGGGGCTTGCAAAAGGCCGGTGAAAAACTGCTAAAAACTATCCTTCCCCGTTTGCGCCAGCACAAAGTGCCCGCTTCTACCGGGGATAGGGCTGCCGCTCATCTGCATGGGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATcg < 2:256496/286‑1 (MQ=255)
cTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCgcggc < 2:1192688/288‑1 (MQ=255)
tGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCgcggcg < 2:277353/288‑1 (MQ=255)
aagATACCTTTCCGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGGGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTCCCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCAGCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:153152/287‑1 (MQ=255)
aGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCATGGGGGCTTGCAGAAGTCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCGGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:1877364/289‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:620027/286‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:1227047/286‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 1:217835/286‑1 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt > 2:217835/1‑286 (MQ=255)
aTACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTAtt < 2:1894805/286‑1 (MQ=255)
|||
CACTATTTTGCCCAACTGCGGGGCGACGCCTCCGGCGATGCGCTCAATCGTCAGCGCGAAGCCTTTATGGCCCGCTGGATTGGATGGGCGATGCAGCAAAATAATGGCGACGTGTTAGTTGTCTGCGGTGGCTGGCACGCTCCGGCACTGGCAAAGATGTGGCGCGAATGCCCTCAGAAAATTAACAAGCCAGAATTGCCCAGCCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTAGTGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCAGCCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATT > CP042583/1781045‑1781602
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
