Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
755,131 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 755,131 | 0 | A | T | 98.3%
| 538.2
/ NA
| 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); major base T (115/115); minor base G (0/4); total (117/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 755,132 | 0 | G | C | 99.6%
| 543.9
/ NA
| 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (117/119); total (117/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
| * | CP042583 | 755,133 | 0 | C | G | 99.6%
| 556.6
/ NA
| 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (115/121); total (117/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
AGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATAGCTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGAGCGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TAGCCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAA > CP042583/754852‑755412
|||
agGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCACGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATACGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCa > 1:149482/1‑289 (MQ=255)
agGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCa > 1:1666704/1‑289 (MQ=255)
ggTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCa < 1:1266434/288‑1 (MQ=255)
tGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCAtt > 1:1807988/1‑288 (MQ=255)
cAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGc > 1:25546/1‑288 (MQ=255)
ttGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGc < 1:886857/289‑1 (MQ=255)
tCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGt > 1:778215/1‑288 (MQ=255)
cccGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGTTCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGtt < 1:1585658/288‑1 (MQ=255)
aTGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGc < 1:288089/288‑1 (MQ=255)
aTGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCa > 1:142370/1‑289 (MQ=255)
gAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAAct > 1:814500/1‑289 (MQ=255)
aaCGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACAGGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGACAGTTACCCCATTTTGACGCAGTTATCCCGCGTATTGGCACCCACATTACCTTTTATGGGCCGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGATCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCCCGTGACAAATTGCTTTCCATGCAAca > 2:1915776/1‑287 (MQ=255)
ctctattcgtGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGtt < 2:919063/265‑1 (MQ=255)
tcgtGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTc > 1:589493/4‑289 (MQ=255)
gTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAgg > 1:517580/1‑288 (MQ=255)
aaGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGc < 1:991827/288‑1 (MQ=255)
aGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATTGAACTGCTGCCGCGTCCTGGCa > 2:179348/1‑288 (MQ=255)
cGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCCTTGCCCGGGCGCGTGCCAAATTGCGTTCCATTCAACTGCCGGCCGGTCAggggcac > 2:932846/1‑284 (MQ=255)
gCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGgcgc > 2:1615825/1‑239 (MQ=255)
gTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGAcctgc < 2:882223/288‑1 (MQ=255)
gTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGAcctgc < 2:142370/288‑1 (MQ=255)
tGAAGCCGCTATACACAGCGGTCACATGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCGTGCCACATTAACATAAATCCTGCGGCGCCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCACGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCCATGCGCCAGT‑TCGAGCTGCCGGGGAGCTACACGCTCACTGAGTCAGG‑CGCCATTGCCCGGACCTGTGACAAATTGCGTTCAATCCAACTACTGGCCCGTCAGGGACACGCcctgcca > 2:1671983/1‑288 (MQ=255)
cgcgGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCaa > 2:1943160/1‑243 (MQ=255)
cgcgGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCaa < 1:1943160/243‑1 (MQ=255)
cgcgGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTgcgc > 2:815803/1‑289 (MQ=255)
cgcgGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCCGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTgcg > 2:765210/1‑288 (MQ=255)
gcgGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCa < 2:591959/289‑1 (MQ=255)
cgGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGTACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑t > 1:1512456/1‑289 (MQ=255)
tCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGt < 2:112647/250‑1 (MQ=255)
tCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGt > 1:112647/1‑250 (MQ=255)
tCACCCGGCTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCACTTTGACGCAGTGATCCTGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGTGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAG‑CCGTCCGCCATTGCCCGTGCGCGCGACCGATTGCGTGCCATGCAACTGCCTGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCACTgcgcgttc > 2:394997/1‑284 (MQ=255)
aaccggttggAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGATACATGAACCACAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCCCTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑ttcg < 2:814500/279‑4 (MQ=255)
tGGTTGAAATGCTTGACCAGCTTGCTTTGTACTTGAACATAATACCGGCAGATGCTTTGATGCACTCAACAGGCCGAAATGTTCCCGATTTTAACGCAGTCGTCCCGCGAATTGGGACCGCCATTACCTTTTAGGTGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGCTGCTGGGGAGCTATCCGCTCAAAGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCTACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACATGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑ttcgccgga < 2:620924/289‑9 (MQ=255)
gTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACGTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑ttcgc > 1:1921126/1‑279 (MQ=255)
tccTTTATTGCTAAATAAACATAAAACCTGCGGCGCCTTCTATTCACTACAAAGGCCGAAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGTTCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAAt < 2:1739735/287‑1 (MQ=255)
cTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCg > 1:664126/1‑289 (MQ=255)
agagtacaaTAAATCCTGTGGCGGCGTTTATTCGTCACAATGGCCCAAAGTTACCCCAGTTTGCCGCAGTGATCCCGCGTATTGGAACGGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑GCGAGATGCTGTGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACACATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCgg < 2:1469878/281‑1 (MQ=255)
cATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCggt > 1:1439988/1‑289 (MQ=255)
cATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCggt > 1:873653/1‑289 (MQ=255)
cTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCtggt > 1:167700/1‑289 (MQ=255)
cggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGAc < 2:1856398/209‑1 (MQ=255)
cggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGAc > 1:1856398/1‑209 (MQ=255)
ggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTggtggt < 1:316051/288‑1 (MQ=255)
ggcgTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAAATGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTgcg > 1:1340384/1‑277 (MQ=255)
tcttctATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCACCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGGCTG‑TACCAGCCATTTAATCGCCATGGTCGGTGGTTGGCCGCTGGTGGTCAAgt > 2:313725/1‑289 (MQ=255)
ctATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAgttggt < 1:1310655/289‑1 (MQ=255)
aTTCACTACAACGGCCGCAAGTTACCCCGTTTTGGCGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAgttggttg < 2:225518/289‑1 (MQ=255)
aCTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAATTGGGGTGAAgg > 2:838996/1‑289 (MQ=255)
aCTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAggg > 1:202469/1‑289 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑ttcg < 1:188281/219‑4 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGAc < 1:1318985/246‑1 (MQ=255)
tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGAc > 2:1318985/1‑246 (MQ=255)
cAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCAc > 1:1076657/1‑288 (MQ=255)
aGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGCCCTGCCTGTCACGGGCCTGTCGCA‑TTCGCCGCATGATACCAGCCATTCAATCGACATGGTCGGCGTTGAGCCGTGGGTGGTACAGGTTGTTGAAgtccctccg > 2:385703/1‑281 (MQ=255)
aGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGAc < 1:724231/187‑1 (MQ=255)
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gCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAgg < 1:954498/288‑1 (MQ=255)
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tttGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTgg > 2:1058805/1‑289 (MQ=255)
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aTCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTc > 1:625500/1‑289 (MQ=255)
cgTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAggcgg > 1:556747/1‑289 (MQ=255)
cACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGCGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAg < 1:390609/288‑1 (MQ=255)
aCCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 1:1370661/288‑1 (MQ=255)
aCCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGAACTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGgatgat < 1:252903/177‑1 (MQ=255)
tACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGAc < 1:123684/289‑1 (MQ=255)
tACCTTTTAGGGGACGGCGGACCTG‑GGCAGTGTTGGGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGAc < 2:527184/289‑1 (MQ=255)
aTGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 1:245952/289‑1 (MQ=255)
aTGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 2:566674/289‑1 (MQ=255)
aTGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 1:170513/289‑1 (MQ=255)
tGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcgc < 1:82464/289‑1 (MQ=255)
gACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGgcggcg < 2:1028855/262‑1 (MQ=255)
gACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGgcggcg > 1:1028855/1‑262 (MQ=255)
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tATCCGCTCAATGGTCGGGA‑GTCCATTGCGCTGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCAGTCCACTGCTGGCCCGTCGGGGCACTGACCTGCCTGGCACGGGCATTGAGCA‑TTCGCCTGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAag < 2:1283141/289‑1 (MQ=255)
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|||
AGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATAGCTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGT‑TCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGAGCGT‑CGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCA‑TAGCCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAA > CP042583/754852‑755412
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
