Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
699,596 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 699,596 | 0 | A | T | 99.5%
| 479.9
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (102/105); total (103/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 699,597 | 0 | G | C | 99.0%
| 477.2
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (101/104); total (103/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 699,598 | 0 | C | G | 99.0%
| 473.4
/ NA
| 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (101/105); total (103/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
AACAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATAGTCATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACAGCCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGC > CP042583/699324‑699877
|||
aaCAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTTAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCg > 1:1741922/1‑289 (MQ=255)
aCAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGGCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGAGTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCAGTGGCGCGAAATAACTCGCATCAAATCGGCCGt > 1:456143/1‑289 (MQ=255)
gacgCGAAATAAGTTGCCAATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGATCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTACCAATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGCTCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCCGAACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTAt < 2:1023056/284‑1 (MQ=255)
gAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTa < 1:924526/288‑1 (MQ=255)
gAAATTAGTGGCCGTTAATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGTCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCACTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTa < 2:1160490/288‑1 (MQ=255)
aaTTAGTGGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGTCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCAACTGCAAATTAACCATCAGGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACt < 1:1883506/288‑1 (MQ=255)
aaTGAGTTGCCGTTCATTTAATCGCGGCAAACCGGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACt < 2:1621756/288‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCg < 1:1910899/289‑1 (MQ=255)
tGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGa < 1:242797/288‑1 (MQ=255)
tGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGAATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAg < 2:328722/289‑1 (MQ=255)
tttAATCGCGGGCAACCTGTCAGGGCAGGATTACCCTGGTTTTTGCATGATCCCAAGCTGTGTACGCTCCTTGAGACAGGGGCACCCGCAAATTACCCATCATGCCAAAAACGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGGTCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGGACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCa < 2:456143/289‑1 (MQ=255)
acggcgGCAATCCTGGTCAGACATGGTTGACATGCTGTTGGCGTAGTCCGAAGCTAAGTACGCTCGTAGAGTCAGGGGCACATGCAAATAAACCAGCATGCCAAAGCCGTTCAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGAGCGATCGCGATCGCGCATTTAGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGAATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATGGCCGCCGTGGCGCTACATGACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGGGgcgg < 2:787729/286‑1 (MQ=255)
cgGCAAACCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTTGGGATTGAGAAAGCGCATCCGGCCGGTATTGCCGCCCGGGCGCCACATAACTCGCCTCATACCGGCCGCATCGGTTCCTTGGCGGCGCAGTGTGCCGAGGCggg > 2:1761229/1‑289 (MQ=255)
aaCCTGGCAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTg < 2:1834602/289‑1 (MQ=255)
cAGGGCATGATTCACATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTa < 1:874451/288‑1 (MQ=255)
acATGGCATTCGCATTCTCCCAATCTATGTACGACACTGGAGGCAGGGGACCGTGCAAATGATCCAGCATGCCAAAACCGTTAACGAGGCGGGGGCGGCGGTGTCCGTCGATGGCGATCGCGCATGTGGTCAGGTAGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGAATTGAGAAAGCGCATCAGCACTGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGc < 2:1066624/288‑1 (MQ=255)
gTATTGGCATGATCCCAAGCTCTGTACCCTCCTGGAGTCAGGGGAACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 2:204845/289‑1 (MQ=255)
tATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGt < 1:48050/260‑1 (MQ=255)
tATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTCTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 1:1818476/288‑1 (MQ=255)
tATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGAGCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCTATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 1:595038/288‑1 (MQ=255)
aTTGGCAGACTCCCAAGCTATGTAAGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCGGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCg < 2:1581204/289‑1 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGTCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGGGGAGCGGCGGGGTTTGTATCTATCCACTTTGGTCGC‑G‑TGGTCGGTATTCCaa > 1:378783/1‑289 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAg > 2:1208748/1‑231 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAg < 1:1208748/231‑1 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa > 1:1017803/1‑263 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCaa > 1:1400141/1‑289 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTAATGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGGGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGGTAGC‑G‑TGGTCGGTAGTccca > 1:311576/1‑287 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCCATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATTACGGCCGGAACGGTTACTGGGCGGCGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCCCTGTCCACTTTGGTAGC‑C‑GTGTCGGTGTTccca > 2:1667367/1‑287 (MQ=255)
aTCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGAGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGGTTGTCCTCAACCACTTTGTTAGC‑C‑TGGTTGGGATTGCaa > 2:840828/1‑289 (MQ=255)
cccAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 1:70661/276‑1 (MQ=255)
tATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTcgcg < 1:1792399/288‑1 (MQ=255)
aTGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGc‑c > 1:123962/1‑289 (MQ=255)
tGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 2:1308439/267‑1 (MQ=255)
tGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt > 1:1308439/1‑267 (MQ=255)
tGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑Cg > 1:27846/1‑289 (MQ=255)
tGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGGGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTTCGGGGCGGTGCAGTGGTCAGCGGCGGGTGTTGGCGTTTTCCACGTCGTT‑GC‑GCTGGGCGGTATTCCTCAGGTCTCGc‑c > 2:1565260/1‑288 (MQ=255)
gTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGGTTGGTTCTATCCACTTTGTTATC‑G‑TGGGCGGGATTCCaactggttcttata > 2:70661/1‑277 (MQ=255)
gTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGAGCATAAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTTTGCAGCGGACGGGTTTGTCTCCATCCACATTGTTATC‑G‑TGGTCGGTACTGCAAGTGTcgcgactg > 2:891754/1‑285 (MQ=255)
tACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGt > 1:37199/1‑288 (MQ=255)
tACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTGGTCTCCTTCCACTTTGTTAGC‑G‑TTGTTGGTTTTCCAATGGTccgcgcgg > 2:1878585/1‑281 (MQ=255)
tCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGcc > 1:1537362/1‑193 (MQ=255)
tCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCa < 1:1865662/245‑1 (MQ=255)
tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 2:196532/257‑1 (MQ=255)
tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt > 1:196532/1‑257 (MQ=255)
tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑GGTTCCACGGt > 1:375809/1‑288 (MQ=255)
tGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCCATGGCGCTGGGGATTTAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTTGCGCTACATAACTCGCGTCATATCGGCCGTATCGGTTACCGGGCGGAGCAGTGGTCAGCGGCGGGGTTTTGCGCTATCCACTTTGTTCTC‑G‑TGGTCGGTATTTCAATGTCGGCGC‑CGGTCCACCGtt > 2:1196930/1‑288 (MQ=255)
gAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCCATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTcgc > 1:1158412/1‑289 (MQ=255)
aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGGGCAGTGTGCAGCGTCGGGGGTGTGCTCTATTCACCTGGTTATCGG‑TGGT‑GGTATTCCAATGGTC‑CGCGCGTTCCCCGGTCGCCAcc > 2:1456903/1‑287 (MQ=255)
aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTTTGCAGCGGCGGGGTTTGTCCTTATCCACTTTGTTAGG‑G‑TGGTCGGTATTCCAATCGTCGCGG‑CGTTCCACGGTCGCGACAg > 1:1137389/1‑289 (MQ=255)
aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACa > 1:1868419/1‑288 (MQ=255)
aGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGGTTGGCTCTATCCCATTTGTTTGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGGGC‑CGGTCCCCGGGcgcgtcc > 2:509000/1‑285 (MQ=255)
gggCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGGTCCACGGTCGCGACAGc > 1:1172791/1‑288 (MQ=255)
gggAACTTGCAAATTTACGATCATGCGAAAACTGTGAAAGGGGGGGGGGCGCGGGGAGCGCTGAGTGGGGATCGGGAATTTGGTGAGGCGGCGGCACATGAAGCGAGGGCGATGGGGATTGAGAAGGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGc < 2:1735514/288‑1 (MQ=255)
acgtagaaaTTAACACTCAGGCCAAACCCTGTAAGGGGGGGGGGGCGGGGGTCAAGCTCGATGGCGATGGCGAATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAGGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCtt < 2:18115/283‑1 (MQ=255)
cAAATTACCCATAACGCCGAAACCGTTGAAGCGGCGGGGGCGGGGGTATCGTTCGTGGGGCATGGCGCAGTTGGTGAGGTCGGGGCACATGAAGCGGTGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCGGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCa < 2:1866771/289‑1 (MQ=255)
cAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTTTGCAGCGGCGGGGTTGGTCTTCCTCCACTTTGTTAGT‑G‑GTGTCGGTATTTCCATGGTTGGCC‑CTGTCCCGGGTCCCGCCAGCCGGCTTTgc > 2:740245/1‑287 (MQ=255)
caactAACCATCATTACAAAACCGTTAGAGGGGGGGGGGCGGCGGTCAGGCACGATGGGGGTCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGGGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCa < 2:614413/284‑1 (MQ=255)
tAACCATCATGCCAAAACGGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAAt < 1:1359477/289‑1 (MQ=255)
tAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGACGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAAt < 1:1196930/289‑1 (MQ=255)
ccATCATGCCAAAACCGTTAAAGCGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCg < 1:100062/289‑1 (MQ=255)
atcatGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGtt < 1:509000/289‑1 (MQ=255)
aaaCCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACCTAACTCGCATCATATCGGCCGTATCCGTTACTTGGGCGAGCAGTTCGCAGCGGCGGGGTTCGTCTCCATCCACCTTGGTTGA‑G‑TGGGTGGTCTTCCCACGTTGTCCC‑CGTTCCACGGTCTCGGCATCC‑GCTTTTGCACCCAACCCTTCCGTGTGGt > 2:1219999/1‑289 (MQ=255)
aaCCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAGGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGtt < 2:27846/289‑1 (MQ=255)
ggggCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGt < 2:374904/286‑1 (MQ=255)
gCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACGTAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGGTTTCCCTCGTAAAg > 1:3879/1‑289 (MQ=255)
ggcggTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACT‑GGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTc > 1:572959/1‑288 (MQ=255)
cggTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTcc < 1:1219999/288‑1 (MQ=255)
cccGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATACCTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCt < 1:807666/286‑1 (MQ=255)
cACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTccc > 1:1655541/1‑285 (MQ=255)
cGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTTGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGtt > 1:1550141/1‑289 (MQ=255)
gCTCGATGGCGTTCGCGCTTTTGGTAAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTg < 2:350594/286‑1 (MQ=255)
cGATCGGGAATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTa < 2:381192/288‑1 (MQ=255)
gATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACg < 1:1496057/289‑1 (MQ=255)
gATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACg < 1:1456903/289‑1 (MQ=255)
tCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCAt < 1:1615362/288‑1 (MQ=255)
ggCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGc > 1:16404/1‑289 (MQ=255)
ggCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCCACCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCCCTGTCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCAC‑CGTTCCACCGTAGCGAAAGCC‑GTTTTTGCACCAACCCGTGCTGTTGTGATCTGCTTCGGACAGATAACTGCCCGCCTTTCTCTGAGTACCCCACCAGCCGCAATGCATTCggt > 2:159621/1‑288 (MQ=255)
ggCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGcc < 1:740245/289‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCCCGACAGCC‑GCTTTGGCCCCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTTATTACGCCACCCGCCCCCTTTCCTTTTCCAAAAcccccctccc > 2:1503743/1‑281 (MQ=255)
gcgcTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGcc < 1:335693/288‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGcc < 1:952553/288‑1 (MQ=255)
tGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt > 2:684084/1‑129 (MQ=255)
tGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGt < 1:684084/129‑1 (MQ=255)
tGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCCCCAATCCGTTCTGTTTGGTTTTTCCTCGTAAAGATATTTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCCCCATTGCTTTTTGCAAAACCCCGGTCCCCTGGCCTAAAgg > 2:335693/1‑288 (MQ=255)
aaGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGt > 2:814433/1‑128 (MQ=255)
gtatacgcgacaggTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCg < 1:98323/277‑1 (MQ=255)
cgcATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCg < 1:1667367/288‑1 (MQ=255)
aTCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCAt < 1:287774/246‑1 (MQ=255)
tCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑C‑TGGTCGGTATTCCCATGGTCCCAC‑CGTTCCACGGTCGCGACCCCC‑GCTTTTGCACCAACCCCTTCCGCGTGGTTTTCCCCCCTAAAGATACTTCACCGCTGCTCCTTCATTACGCCACCCGCGCCCGTTCATTTGGCACAACCCCCCTCCCCTGGCCTAAACGCCTccccctccc > 2:1558381/1‑283 (MQ=255)
tATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTa > 1:773039/1‑188 (MQ=255)
tATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTa < 2:773039/188‑1 (MQ=255)
tATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTg > 1:1054883/1‑233 (MQ=255)
tATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTg < 1:307388/288‑1 (MQ=255)
ccgccgTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGCTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCCTTGCTTTTGGCAAAACACGCGTCGCCTGGCCTAAAGGCGTCCCCGCGCCGCCAGTGTGccgtgt > 2:1363687/1‑285 (MQ=255)
ccgTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTg > 1:65649/1‑288 (MQ=255)
gTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCCCGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTTCCGCTGGTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATCTGGCAAAACCCGCGTCGCCCGGCACAAAGGCGTCCCCCGTCCCCCAGGTTGcgccatc > 2:303/1‑279 (MQ=255)
gTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACCGCC‑GCTTTGGCACCCATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCCCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCCGGTTGCCTGATTGagt > 2:63411/1‑287 (MQ=255)
gTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGa < 1:1712155/283‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGa > 2:1712155/1‑283 (MQ=255)
gTGGCGCTACATAACTCGCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCGGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCCCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACg > 1:1226251/1‑289 (MQ=255)
|||
AACAAGAAGCGAAATTAGTTGCCGATCATTTAATCGCGGCAAACCTGGCAGGGCATGATAGTCATGGTATTGGCATGATCCCAAGCTATGTACGCTCCTGGAGTCAGGGGCACCTGCAAATTAACCATCATGCCAAAACCGTTAAAGAGGCGGGGGCGGCGGTCACGCTCGATGGCGATCGCGCATTTGGTCAGGTCGCGGCACATGAAGCGATGGCGCTGGGGATTGAGAAAGCGCATCAGCACGGTATTGCCGCCGTGGCGCTACATAACAGCCATCATATCGGCCGTATCGGTTACTGGGCGGAGCAGTGTGCAGCGGCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGC‑G‑TGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGC‑CGTTCCACGGTCGCGACAGCC‑GCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGC > CP042583/699324‑699877
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
