Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
747,422 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 747,422 | 0 | A | T | 100.0%
| 422.6
/ NA
| 182 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (84/98); total (84/98) |
| * | CP042583 | 747,423 | 0 | G | C | 98.4%
| 409.4
/ NA
| 182 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/0); new base C (81/98); total (84/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.64e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 747,424 | 0 | C | G | 98.3%
| 409.4
/ NA
| 182 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base G (80/98); total (84/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.45e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GCCACGCGTATAGGCGAGAAACTGAGTCTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGAGCCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑AGCCGCCGCACCG‑TACGTAGCCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCAGTAGCCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGA > CP042583/747152‑747700
|||
ccACGCGTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGggcgg > 1:679967/1‑289 (MQ=255)
gcgTTTCGGCGGGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 2:909400/289‑1 (MQ=255)
gcgTATAGGCGGTAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGGGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 1:940429/289‑1 (MQ=255)
gcgTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 2:679967/289‑1 (MQ=255)
gcgTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGACGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 1:26959/289‑1 (MQ=255)
gTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGCTCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGc < 2:423626/288‑1 (MQ=255)
gTATAGGCGAGAAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGc < 2:1174223/288‑1 (MQ=255)
gaAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1040878/288‑1 (MQ=255)
gaAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1195608/288‑1 (MQ=255)
gaAACTGTCACTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1561457/288‑1 (MQ=255)
aaactgtcacTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGGGCTGGCGCTGGGGTTCGTTTGGCTGCCGTTGCTGGCGTGGGTCGCCCCCTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCCGCTGGGCCGCTATGAATCTGGCTTGCTGCATGTGCCTATTTTCAGGGCG‑TTCATTTCTGGGTTCTTGTCTTTAGCGCGTCTGACC‑TCCTGCCGGACCGTTCCTTTGCCT‑CCTATTTTGGGGTGCTGGACGGTTATGATTg > 2:1494145/10‑289 (MQ=255)
aaactgtcacTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCGATGAATATGGCTTGCTGCCAGTGCCGCTTTTCGGGGCG‑TTAATTTCGGGGTACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCCCCCCGCACCG‑TATGTTCGCTGATTATTTTGGGCGCGTGGCGGGTTATGATTg > 2:1885495/10‑289 (MQ=255)
tCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGc < 1:1347599/288‑1 (MQ=255)
tCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCa > 1:1152331/1‑289 (MQ=255)
tGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTTCTGGCGTGGATCCGCCAGGCCCCGCTTATCATCATTACCCGCGACCCGTTGAGCATCCATGAATATGGCTTGCTTCCAGTTCCTATTTTCGTGGCC‑TTCATTTCGGGTAACTTGCTGTTTGCCCGTCGCCCC‑CACCCCCGCCCCC‑TCCGTTCCCTGGTTATTTTTGTCGCCCGGCCCAGTGTGATTTGTTTATTTGTCTCTGCTTCgtcgccg > 2:1932150/1‑283 (MQ=255)
aaGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGGTCGCCCAGTCGCCGCTTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCCGCTATGGATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTTTTACCGCGTCCGCCC‑CCGCCCCGCACCC‑GTCGTTCGCTGCTTATTATGGGCCGCCGGCCGGTGCTGCTTTGTGCTGTGGTCGCTGGTGCTGCGACCGTTagc > 2:1624153/1‑286 (MQ=255)
gTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGGTTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGGTTATTGTTGGTCTATTGGGTGCTGCTGCGGGAACGGGTATctcatcg > 1:1627664/1‑282 (MQ=255)
tGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTTGGATTCGTTAGTCTGCCGTTTCTGGCGGGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTTCTGCAAGTGCCCATTTTTGGGGCG‑TTAATTTCGGGTAACTTGCTGTTTGCGCGTTTGACCTCGCCG‑CGCACCC‑TACGTTCGCTGGTTATTATTGGCGGGTGGCCGGTTGTGATTGGTCTCTTTGTCGCTTGTGCCGGAACGGTTATctcctcgg > 2:279434/1‑281 (MQ=255)
tGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgc > 1:1938490/1‑281 (MQ=255)
tGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgc > 1:1769052/1‑281 (MQ=255)
gCTGAGGACCGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgca < 1:1925676/288‑9 (MQ=255)
gCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgca < 1:708589/288‑9 (MQ=255)
gCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgca < 2:1276177/288‑9 (MQ=255)
agaaCGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATctcatcgcacgcgt < 2:1769052/288‑14 (MQ=255)
cGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTa > 1:824955/1‑289 (MQ=255)
gtgGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTg < 1:1516785/289‑1 (MQ=255)
gggCGGTGACGCTGTCGTTGGCATTCCTTGCTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCGAGTCTCCGATTATCATCATTACCGGCGGGCAGTTGAGCAGCTATTAATATGGCTTGCTTCAAGTGCCTTTTTTCGGGGCT‑GTCATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTGATGGATGACTg < 2:965150/287‑1 (MQ=255)
gCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTgg < 2:1246924/213‑1 (MQ=255)
ggggCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCgggg > 1:1220762/1‑288 (MQ=255)
ggggCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGt > 1:552399/1‑289 (MQ=255)
ggggctggcgctggGGTTAGTTAGGCGGCCGTTGCGGGCGTGGTTCGCACAGGAGCCGATTATCATCATTACCGGCGCGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGtt < 2:1189086/285‑1 (MQ=255)
ggcgctggcgctGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGtt < 1:903794/288‑1 (MQ=255)
ggcgctggcgctGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGtt < 2:552399/288‑1 (MQ=255)
gggATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCt > 2:1174532/1‑289 (MQ=255)
ggATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCtt > 1:1302165/1‑289 (MQ=255)
gTTGGTCTGCCGTTGCTGGAGTGGTTCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa < 2:1651200/289‑1 (MQ=255)
tGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa < 2:655144/282‑1 (MQ=255)
ccGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTg > 1:1373994/1‑288 (MQ=255)
cGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGGGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGc < 2:1152331/289‑1 (MQ=255)
cGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGc < 1:38733/289‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCt > 2:161840/1‑263 (MQ=255)
cGTGGATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCt < 1:161840/263‑1 (MQ=255)
ggATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGAc < 1:295846/288‑1 (MQ=255)
gATCGCCCAGTCGCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGGGGGAcgt > 2:405155/1‑287 (MQ=255)
tcgccaagtctccGATTAGCATGAGTACCGGGGGTAAGTTGAGTAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt < 2:1734771/278‑1 (MQ=255)
cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTGGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCg > 2:641106/9‑289 (MQ=255)
cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa < 2:590827/253‑1 (MQ=255)
cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTa > 1:590827/9‑261 (MQ=255)
cccagtcgccGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCg > 2:1982319/9‑289 (MQ=255)
tcatcaTTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt > 1:415688/1‑271 (MQ=255)
catcatTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTAGTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGcc < 1:1608973/289‑1 (MQ=255)
ttACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGa > 1:118319/1‑289 (MQ=255)
tACCGGCGAGGGGTTGTGCGGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 2:1220762/289‑1 (MQ=255)
tACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 1:1361993/289‑1 (MQ=255)
gaCCGGGGGGAAGTTGGGCGGCTATGAATATGGCTTGATTGAATTGCCTATTTT‑GGGGCGTTTATTTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATAGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 2:1071280/288‑1 (MQ=255)
gaCCGGGGAGCAGTTGGGCGGCTATGACTATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGat < 2:1967012/288‑1 (MQ=255)
gCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAg > 1:1834543/1‑289 (MQ=255)
aGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGAt < 1:1406712/142‑1 (MQ=255)
agcagcTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCACCGCACGCGTCCTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGTGAATGCGGGACTGGTGCGTTTAAACCTGTTTGCCAGCCACATGAGTAAAggctcgg > 2:1977815/1‑284 (MQ=255)
cagcTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGtt > 1:542929/1‑289 (MQ=255)
tATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGttt < 1:1885495/286‑1 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGata < 1:1802510/267‑1 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGata > 2:1802510/1‑267 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGt > 1:1789510/1‑278 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGt < 2:1789510/278‑1 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:1173690/1‑288 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:1146414/1‑288 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:558559/1‑288 (MQ=255)
aTGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTg > 1:1317056/1‑288 (MQ=255)
aaTATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTCTTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCcgc > 1:1265472/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGTGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1519504/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGa < 1:245390/118‑1 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGTATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGGAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1677116/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAAcc < 2:842981/243‑1 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCTAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGTCGCGATgg > 1:913360/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTACAGGTACGGTTTCTGCCGCGTTgg > 1:207776/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1954855/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:1962171/1‑289 (MQ=255)
ggCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATgg > 1:884627/1‑289 (MQ=255)
cTTGCTGCAAGTGCATATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCTGGTAACTTGTTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGAACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGGAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATggg < 2:296671/288‑1 (MQ=255)
tgctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAAt < 1:274497/289‑1 (MQ=255)
gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTaa < 1:1124588/185‑1 (MQ=255)
gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTaa > 2:1124588/1‑185 (MQ=255)
gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt > 2:454582/1‑228 (MQ=255)
gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGt < 1:454582/228‑1 (MQ=255)
gctgcAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAAt > 1:1838024/1‑288 (MQ=255)
aGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTa < 1:917189/178‑1 (MQ=255)
cGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCttt < 1:1715871/289‑1 (MQ=255)
gggCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAAt > 2:247234/1‑268 (MQ=255)
gggg‑TTAGTTGCGGGTAACTTGCTGGTGGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCAACG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTAc < 2:1373994/285‑1 (MQ=255)
tGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTAtt < 1:147945/289‑1 (MQ=255)
tGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCaa < 2:1834543/289‑1 (MQ=255)
tAGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATg < 2:1302165/288‑1 (MQ=255)
aGCGCGTCTGACC‑TCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATg > 1:702997/1‑287 (MQ=255)
ggcgTCTGCCC‑CCGCGCCGCACCG‑TACGTTCGCTGAGTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCTCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCTTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCt < 2:1317056/287‑1 (MQ=255)
gccgcACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCa < 1:279434/288‑1 (MQ=255)
cACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACgg > 1:651637/1‑288 (MQ=255)
cACCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACgg > 2:1407559/1‑288 (MQ=255)
aCCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTTCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGa < 2:919991/288‑1 (MQ=255)
aCCG‑TACGTTCGCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCTCATCGCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGa < 1:1982319/288‑1 (MQ=255)
|||
GCCACGCGTATAGGCGAGAAACTGAGTCTGAAAGAACTCGGTCGTGACTATAAGCTGGTGCTGAAGAACGGCCGCTTTGTGGCGGGGGCGCTGGCGCTGGGATTCGTTAGTCTGCCGTTGCTGGCGTGGATCGCCCAGAGCCCGATTATCATCATTACCGGCGAGCAGTTGAGCAGCTATGAATATGGCTTGCTGCAAGTGCCTATTTTCGGGGCG‑TTAATTGCGGGTAACTTGCTGTTAGCGCGTCTGACC‑AGCCGCCGCACCG‑TACGTAGCCTGATTATTATGGGCGGCTGGCCGATTATGATTGGTCTATTGGTCGCTGCTGCGGCAACGGTTATCAGTAGCCACGCGTATTTATGGATGACTGCCGGGTTAAGTATTTATGCTTTCGGTATTGGTCTGGCGAATGCGGGACTGGTGCGATTAACCCTGTTTGCCAGCGATATGAGTAAAGGTACGGTTTCTGCCGCGATGGGAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGA > CP042583/747152‑747700
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
