Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F109 I1 R1
|
19 |
66.7 |
2403364 |
90.9% |
2184657 |
142.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
1,259,760 |
Δ1 bp :: IS186 (–) +5 bp |
coding (1040‑1044/1680 nt) |
dauA ← |
C4‑dicarboxylic acid transporter |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
608007 = | NA (NA) | 55 (0.850) |
50/276 |
0.2 |
100% |
noncoding (1/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
1259760 = |
0 (0.000) | coding (1044/1680 nt) |
dauA |
C4‑dicarboxylic acid transporter |
| * |
? |
NC_000913 |
= 609350 | NA (NA) | 34 (0.520) |
32/278 |
1.4 |
100% |
noncoding (1344/1345 nt) |
IS186 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 1259764 |
0 (0.000) | coding (1040/1680 nt) |
dauA |
C4‑dicarboxylic acid transporter |
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608152‑608007
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaCGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATAC > NC_000913/1259760‑1259899
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:1136491/1‑143
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:315670/143‑1
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTGATG > 2:887681/1‑143
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGATAAATCATATCAGGCGTAATCCCACAACCCTTAGATTAAGGCTTATG > 2:67959/1‑143
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTAGCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTCAAGTTAGCGCTAATG > 2:432218/1‑143
CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCGAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACCACCCTTGAGTTAGCGCTTATGG > 1:312891/1‑143
tgcGCATTACGTGCCGAAGTCTCCAGTTCGTCGGGCTTACCAATATGGTCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCAGCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 2:867382/140‑1
ccgcgcTTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTGATCGTGAGAGTAATTCATCCGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 2:1098830/137‑1
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:206064/1‑143
CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCAAGATACAATAGATCGGGCCTAACGCCGCAACCCGGAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:268340/1‑143
CGGCATTCCGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATAGCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 1:130303/143‑1
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGg < 2:225611/143‑2
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA < 1:209624/143‑1
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTGATGGGA > 1:306752/1‑143
CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTAAAAATATGGAGCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGg > 1:227272/1‑142
GCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAGTGAATTCTGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAACGCTTATGGcata > 2:1033128/1‑139
GCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGGTTATGGGACa > 1:626166/1‑142
CATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTGATTGTGAGAGTAATTCATCGCCACGTTAAATCATATCAGGCGGAATACCACTACCCTTAAGGTAGCGCCTATGGGggaa > 2:749019/1‑139
TACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGC > 1:1061885/1‑143
GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTTAGCGTAATTCATCGCCACGCTAAATAATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAATGTAGCGCTTATGGGCCGTGCCCCCGGCAC > 2:973695/1‑143
GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCAC < 2:802138/143‑1
AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACG > 1:900429/1‑143
ATCCAGTTCTTCGGGCTTACCGATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTAATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTGGCGCTTATGGGACCTTGCCCCGGCCCGGACG > 2:465581/1‑143
TCCAGTGCTTGGGGCTTACCAACATGATCCAGAATTTCTTACCAGTTTTCGTTATAGTAATTCATCGGCACGATAAATCACATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGT < 1:38220/143‑1
CAGGTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCGGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACCGACGGTA > 2:1046675/1‑143
ataCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGC < 1:456140/140‑1
CTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGGTCGAGGCTATCGGACGTTGCCGCGGCACGCACGTTAGCTGC > 2:820354/1‑143
tgCGGGCTTACCAATATGGGCCAGACTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA < 1:314139/141‑1
TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAACTCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA > 2:145982/1‑143
TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA < 1:1066441/143‑1
TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCA > 1:1035781/1‑143
CGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGA < 1:825119/143‑1
GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCTGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAA < 1:1070205/143‑1
GGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTAAGGGACGATGCGCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAA > 1:497052/1‑143
GGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTAATAGGACGTCACCCCCGGACGGACGTTAGCGGCAGAAC > 2:5822/1‑143
TTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGCGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCG > 2:455459/1‑143
TACCAATATGGGCCAGTATTGCTGACCAGTTATCGTGGGAGTAATTCATCGGCAATTTCTGTTGTATCAGGCGTAATATCCCGACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGCACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGC < 2:1038705/143‑1
CCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGA > 1:372205/1‑143
ATGGGCCAGAATTGATGACCATTGATCGTGAGAGTAATTCATCGTCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCA < 2:212287/143‑1
GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGCACGCGCGATCGCAGCTG > 1:663975/1‑143
TTGCTGCCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGT < 1:970144/143‑1
TTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGT > 2:292303/1‑143
CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCCGCTGTAGCCGTAct > 2:662973/1‑141
gCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACC < 2:148348/142‑1
GTTACCGTGAGAGTGACTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTTCGCGTCGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCA < 2:1106079/143‑1
TAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCAATGAAATATGGTATAGGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGA < 1:271942/143‑1
AATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGAAGAACTCGCGATGGCCGCTGTAGCGGAACTACGACCAACGAACGGAGCGAc > 2:838745/1‑142
ATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATCCCACCAAGGAGCGGAGCGATAATAg > 2:289016/1‑142
gGGCACGTCAAATCCTCGCAGGCGTCATACCACAGCCCTTAAGTTAGCGCTTACGGGACGGGGCTCCGGCACTGACGTTAGCCGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTC < 1:1041834/142‑1
GGCACGTTAAACCATATCAGGCGTATGACCACACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCC < 2:867743/143‑1
GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGACTGGAGCTGTAATATACCC > 1:69860/1‑143
ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTCATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCA > 1:393495/1‑143
GTTAAGTCATATCAGGCGCAATACCACGCCCCTTAAGTTAGCGCGTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGT < 2:796982/143‑1
GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCTGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGT > 1:328662/1‑143
ATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCACAGAACGGAGCGAGAATATGCCCCCGTCCCTG > 2:288401/1‑143
CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTACTACCCCCAAAGAACGGCGCGATACTATTCCCCAGTCCCTGTC > 2:1041207/1‑143
TATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCA < 1:402642/143‑1
ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAA > 2:398458/1‑143
GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATCCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGT < 1:292303/143‑1
GTAATACCACAACCCGTAAGTTCGCGCTTATGGGTCGTTGCCCCGGCACGGACGTTCGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCTAGTCCCTGTCCAACCAGTTC < 2:137329/143‑1
TAATACCACGACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCG < 2:497052/143‑1
CCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTT > 1:955410/1‑143
cCAACCCTTAGGTTAGCGCTTAGGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCG < 2:732924/142‑1
ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGAGAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCCGTTCG > 2:145692/1‑143
ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCACGATGGCGGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGGCCAACCAGTTCGCCGGTCG > 2:422676/1‑143
CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGCGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGGCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTG > 2:310147/1‑143
CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTG > 1:856201/1‑143
CTTAAGTTGGCGCTTGCGCGACGGTGCGCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATCCCACCAAAGAACGTCGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGT < 2:414949/143‑1
TTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTG > 1:1161511/1‑143
TTAAGTTAGCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGATGAAGCGTTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCTCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGcg > 1:1073448/1‑141
GCGCTTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCAACAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGACCCTGTCCAAACAGTTCCCTGTGCGCCTCGTGCTTCGTCC > 2:1072975/1‑143
TTATGGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATAGCACCAGAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCCGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGT > 1:449503/1‑143
GGGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATA < 1:138771/143‑1
GGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATAC < 1:50682/143‑1
GGACGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTGTCTCCCCAGTCATAC > 2:1155856/1‑143
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/608152‑608007
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggaCGTTGCCCCGGCACGGACGTTAGCGGCAGAACGCGCGATGGCAGCTGTAGCGGTAATACCACCAAAGAACGGAGCGATAATATTCCCCAGTCCCTGTCCAACCAGTTCGCTGTTCGCCTTGTGTTTCGTCCCGGTCATAC > NC_000913/1259760‑1259899
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
