Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F1 I1 R1
|
759 |
71.0 |
3673240 |
91.5% |
3361014 |
104.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,796,146 |
C→T |
A158V (GCG→GTG) |
csiR → |
transcriptional repressor of csiD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,796,146 | 0 | C | T | 100.0%
| 236.9
/ NA
| 73 | A158V (GCG→GTG) | csiR | transcriptional repressor of csiD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/39); total (34/39) |
GCTTGAGGCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGCGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCAGTGAGTTAATGCG > NC_000913/2796012‑2796281
|
gCTTGAGGCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGgtggcg < 1:880321/139‑1 (MQ=255)
gAGGCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGtt < 1:1405416/139‑1 (MQ=255)
aGGCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTa > 1:689111/1‑139 (MQ=255)
aGGCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTa > 2:17308/1‑139 (MQ=255)
ggCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGAAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTac < 2:1125936/139‑2 (MQ=255)
gCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATc > 1:1405399/1‑139 (MQ=255)
ccTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCg < 1:17308/139‑1 (MQ=255)
tgtgACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGAt > 2:894470/1‑139 (MQ=255)
gtgACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGAtt > 2:797981/1‑139 (MQ=255)
tgACGCCAGCGAGAAATTGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGAttt > 1:4029/1‑139 (MQ=255)
gCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCt > 2:1790098/1‑139 (MQ=255)
gCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCt < 2:474578/139‑1 (MQ=255)
gagaAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTgc > 1:237942/1‑139 (MQ=255)
ttGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGaa < 2:4029/138‑1 (MQ=255)
aGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTc < 2:689111/139‑1 (MQ=255)
gTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCg < 1:797981/139‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTgg < 2:1741175/139‑1 (MQ=255)
tGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAAt > 1:758285/1‑139 (MQ=255)
gCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGgtggcg < 2:1152351/91‑1 (MQ=255)
gCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGgtggcg > 1:1152351/1‑91 (MQ=255)
catcaGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTgg < 2:237942/139‑1 (MQ=255)
atcaGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTgga > 1:95192/1‑139 (MQ=255)
ggCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGtt < 2:101621/86‑1 (MQ=255)
ggCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGtt > 1:101621/1‑86 (MQ=255)
ggCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGAt > 2:796201/1‑139 (MQ=255)
ggCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGAt > 2:1761777/1‑139 (MQ=255)
tttCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGaa < 2:1524890/123‑1 (MQ=255)
tttCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGaa > 1:1524890/1‑123 (MQ=255)
ttCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAaca < 1:796201/139‑1 (MQ=255)
tCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAacac > 2:1627434/1‑139 (MQ=255)
tACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGAt < 1:1761777/139‑1 (MQ=255)
cGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCa < 2:1323020/139‑1 (MQ=255)
gCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga > 2:200138/1‑125 (MQ=255)
gCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga < 1:200138/125‑1 (MQ=255)
aaTTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCAc < 2:1405399/139‑1 (MQ=255)
aaTTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCAc < 1:577021/139‑1 (MQ=255)
aaTTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCCGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCa > 2:750288/1‑135 (MQ=255)
aaTTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCCGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCa < 1:750288/135‑1 (MQ=255)
gCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGAccc > 1:128317/1‑139 (MQ=255)
ggCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCt < 2:372147/77‑1 (MQ=255)
ggCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCt > 1:372147/1‑77 (MQ=255)
gCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGAc < 1:1627434/139‑1 (MQ=255)
gCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGAc < 2:333865/139‑1 (MQ=255)
cTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACt > 2:1656455/1‑139 (MQ=255)
cTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACt < 1:894470/139‑1 (MQ=255)
ctcACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga > 2:10985/1‑103 (MQ=255)
ctcACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga < 1:10985/103‑1 (MQ=255)
ctcACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAaca < 1:153462/109‑1 (MQ=255)
ctcACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAaca > 2:153462/1‑109 (MQ=255)
cACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTCGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTAc < 1:351803/139‑1 (MQ=255)
cTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTg < 1:1972/139‑1 (MQ=255)
tATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTgg < 2:1017683/139‑1 (MQ=255)
tttGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGgcg > 2:1126041/1‑139 (MQ=255)
tttGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGgc > 2:479421/1‑138 (MQ=255)
tttGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGgc < 1:479421/138‑1 (MQ=255)
ttGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGgcgc < 2:128317/139‑1 (MQ=255)
tgcAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTAc < 2:933470/129‑1 (MQ=255)
tgcAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTAc > 1:933470/1‑129 (MQ=255)
gcAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGAt > 2:1476400/1‑139 (MQ=255)
gcAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGAt > 2:1765567/1‑139 (MQ=255)
aaaTGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATAc > 1:202729/1‑139 (MQ=255)
aTGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga > 1:1075374/1‑86 (MQ=255)
aTGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga < 2:1075374/86‑1 (MQ=255)
aTGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACcg > 2:1450982/1‑139 (MQ=255)
cGTGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACcgcgc < 1:1790098/139‑1 (MQ=255)
tGAACGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACcgcgcgc > 2:1595396/1‑139 (MQ=255)
cGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCa < 2:202729/139‑1 (MQ=255)
cGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCa < 2:758285/139‑1 (MQ=255)
cGGTTGTTTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCa < 1:1126041/139‑1 (MQ=255)
gttgttTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCAGt < 1:1450982/139‑1 (MQ=255)
ttgttTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTg < 1:769287/69‑1 (MQ=255)
ttgttTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTg > 2:769287/1‑69 (MQ=255)
gttTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAAc > 1:967088/1‑45 (MQ=255)
gttTGATCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAAc < 2:967088/45‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga < 2:166446/66‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTggagga > 1:166446/1‑66 (MQ=255)
tggtggCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGgc < 1:754765/106‑1 (MQ=255)
tggtggCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCAGTGAGTTAATgcg > 2:923092/1‑139 (MQ=255)
|
GCTTGAGGCCTGTGACGCCAGCGAGAAAATGCTTGATGAGTGGGATCTGCGTCATCAGGCGTTTCATACGGCAATTGTGGCGGGCTGTGGTTCTCACTATTTGCTGCAAATGCGTGAACGGTTGTTTGATCTGGCGGCGCGTTATCGATTTATCTGGCTGCGGCGAACGGTGCTTTCGGTGGAAATGCTGGAGGATAAACACGATCAGCACCAGACCCTGACTGCGGCGGTACTGGCGCGAGATACCGCGCGCGCCAGTGAGTTAATGCG > NC_000913/2796012‑2796281
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
