Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A18 F130 I1 R1
|
38 |
76.4 |
2725422 |
95.3% |
2597327 |
137.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913_3_pae_tpiA |
2,759,615 |
G→A |
E211K (GAA→AAA) |
yfjI → |
CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913_3_pae_tpiA | 2,759,615 | 0 | G | A | 100.0%
| 297.6
/ NA
| 84 | E211K (GAA→AAA) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (44/40); total (44/40) |
CACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGC > NC_000913_3_pae_tpiA/2759469‑2759761
|
cacCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTgaaaa > 1:440486/1‑150 (MQ=255)
cTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTgaaaagga < 2:26428/150‑1 (MQ=255)
cAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGaaaa < 3:398531/150‑1 (MQ=255)
tATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGa < 4:236126/150‑1 (MQ=255)
aTTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGACGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAg > 4:157972/1‑150 (MQ=255)
aaaGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTggaaag > 2:46727/1‑137 (MQ=255)
aaaGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTggaaag < 1:46727/137‑1 (MQ=255)
aGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCga < 2:220986/150‑1 (MQ=255)
tctGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGaaaaa > 2:413464/1‑133 (MQ=255)
tctGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGaaaaa < 1:413464/133‑1 (MQ=255)
gtgGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAattaatta < 4:525346/150‑1 (MQ=255)
gtgGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAattaatta < 2:596833/150‑1 (MQ=255)
gtgGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAattaatta > 1:689701/1‑150 (MQ=255)
gggCAGTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGACAAGGAAAAACGAGCCCGAGACATTAATTaga < 4:75963/150‑1 (MQ=255)
gggCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTaga < 2:440486/150‑1 (MQ=255)
gggCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTaga > 1:669250/1‑150 (MQ=255)
ggCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTagag > 4:469241/1‑150 (MQ=255)
gaaCTGGAGAACAATCGGAAACATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCCATAAGATGTAGGCTGGTTCAATATTTAAAAAAAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAgaga < 2:78789/148‑1 (MQ=255)
gCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAg > 1:247372/1‑150 (MQ=255)
aGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAac > 4:232194/1‑150 (MQ=255)
catcatGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCACTAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTc > 1:821954/1‑150 (MQ=255)
atcatGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCg > 1:279827/1‑150 (MQ=255)
tGTCTGAGGAAGGTGGGGTCATTTTTAATGGTTACACGCTTGGCGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATGTTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGCGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGa < 2:788501/150‑1 (MQ=255)
tCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTGCACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATg > 1:449464/1‑150 (MQ=255)
tgatgaAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGt > 3:486356/1‑150 (MQ=255)
gatgaAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTc > 3:278770/1‑150 (MQ=255)
gatgaAGCTGGGATCATTTTAAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTc > 4:299337/1‑150 (MQ=255)
atgaAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTcc > 1:712843/1‑150 (MQ=255)
aaGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCCAGAATAACGCTGTCGCTGATGGTCCAGc < 4:148121/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAaattaa > 1:732584/1‑109 (MQ=255)
gCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAaattaa < 2:732584/109‑1 (MQ=255)
tGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGAt < 1:211471/115‑1 (MQ=255)
tGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGAt > 2:211471/1‑115 (MQ=255)
aTCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGtt > 2:749283/1‑150 (MQ=255)
aTCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGtt < 4:486356/150‑1 (MQ=255)
cATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGtttt < 2:247372/150‑1 (MQ=255)
ttAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAgg > 1:128323/1‑150 (MQ=255)
ttAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAgg < 1:656935/150‑1 (MQ=255)
tAAGGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAAATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAggg < 4:310903/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGtt < 2:128323/150‑1 (MQ=255)
tGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTta > 1:174292/1‑150 (MQ=255)
acacacTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAAAAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGATTGTAAGGGTTATATCg > 2:266474/1‑150 (MQ=255)
cacacTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGa > 2:53374/1‑150 (MQ=255)
acacTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTag > 1:204007/1‑89 (MQ=255)
acacTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTag < 2:204007/89‑1 (MQ=255)
acTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAAGTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATAACGACAg > 3:301468/1‑150 (MQ=255)
ttAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGCTGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATCTCGACAGGa > 2:748300/1‑150 (MQ=255)
gAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGga > 3:53538/1‑150 (MQ=255)
aGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGgag < 2:712843/150‑1 (MQ=255)
tGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGata < 1:280431/150‑1 (MQ=255)
cGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGGTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATgg < 3:299337/150‑1 (MQ=255)
gTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTaa < 1:501895/120‑1 (MQ=255)
gTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTaa > 2:501895/1‑120 (MQ=255)
ttATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTagag > 1:165513/1‑72 (MQ=255)
ttATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTagag < 2:165513/72‑1 (MQ=255)
aTCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTag < 4:52519/68‑1 (MQ=255)
aTCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTag > 3:52519/1‑68 (MQ=255)
cAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATTGTCCAGCCTAATCTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAggg > 4:490842/1‑150 (MQ=255)
aTAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGgga > 1:214582/1‑150 (MQ=255)
tAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCAGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGCGTTATATCAACAGGAAAGGAAATATGGCAAAGGggat > 2:549469/1‑150 (MQ=255)
aaGATGTGGGATGGTTGAAGATTGACGGGTAAAAGGAAAAACGAGCCCGGGAAATTAAGTAGAGATGCAAGGATAACACAGTCGCTTGTGGTCCAGCCTAATGTTTTTGAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGggatt < 4:485951/150‑1 (MQ=255)
gATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGata > 1:506564/1‑134 (MQ=255)
gATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGata < 2:506564/134‑1 (MQ=255)
aTGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTTCAGACTAATTTTTTTAAGGGTTATATCAACTGGAATTGACATATGGAAAAGTgaactgga < 2:821954/150‑1 (MQ=255)
aTGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTta > 2:716203/1‑113 (MQ=255)
aTGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTta < 1:716203/113‑1 (MQ=255)
tgGGATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGAttt < 3:35656/150‑1 (MQ=255)
gggATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGAc < 4:238954/116‑1 (MQ=255)
gggATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGAc > 3:238954/1‑116 (MQ=255)
ggATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGAttttt < 1:53374/150‑1 (MQ=255)
gATGGTTCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGAtttttt < 2:689701/150‑1 (MQ=255)
ttCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTc > 2:440411/1‑69 (MQ=255)
ttCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTc < 1:440411/69‑1 (MQ=255)
ttCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGggatt < 4:254663/136‑1 (MQ=255)
ttCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGggatt > 3:254663/1‑136 (MQ=255)
ttCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACg > 1:266975/1‑150 (MQ=255)
ttCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACAGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACg > 4:514371/1‑150 (MQ=255)
tCAATATTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACgg > 2:63968/1‑150 (MQ=255)
atatTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGc > 2:715572/1‑150 (MQ=255)
tatTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGcc < 1:715572/150‑1 (MQ=255)
tatTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGcc > 2:77555/1‑150 (MQ=255)
atTTACGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCt < 2:174292/150‑1 (MQ=255)
ttACGGTCAAAAGGAAAAACGAGCACGAGAAACTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCa > 4:131343/1‑150 (MQ=255)
cGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCAtgt < 2:96621/150‑1 (MQ=255)
cGGTGAAAAGGAAAAACGAGCCAGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCAtgt < 4:324666/150‑1 (MQ=255)
ggTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCAtgtg > 1:628435/1‑150 (MQ=255)
ggTGAAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCAtgtg > 2:720997/1‑150 (MQ=255)
gTGAAAAGGAAAAACGAGCCAGAGGCATTAATGTGACTGGCGTGAAGAACACTGTCGCTGAGGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGc < 3:232194/150‑1 (MQ=255)
|
CACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGC > NC_000913_3_pae_tpiA/2759469‑2759761
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
