Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F80 I1 R1
|
83 |
52.9 |
1240211 |
98.2% |
1217887 |
216.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,023,510 |
T→C |
R206R (CGT→CGC) |
fliR → |
flagellar biosynthesis protein FliR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,023,510 | 0 | T | C | 100.0%
| 190.1
/ NA
| 51 | R206R (CGT→CGC) | fliR | flagellar biosynthesis protein FliR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (29/22); total (29/22) |
TGGATATGCTGGCGTTACTGCTGTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGTATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCTTCCAG > NC_000913/2023278‑2023744
|
tGGATATGCTGGCGTTACTGCTGTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGccc < 1:481628/240‑1 (MQ=255)
tatGCTGGCGTTACTGCTGTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGc > 2:506573/1‑239 (MQ=255)
gCGTTACTGCTGTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATcc > 2:162000/1‑240 (MQ=255)
aCTGCTGTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCAtttt > 1:376000/1‑240 (MQ=255)
gTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCAt > 2:195800/1‑213 (MQ=255)
ttCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGTAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTAtt > 1:89484/1‑240 (MQ=255)
tttAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCa < 1:223910/240‑1 (MQ=255)
ttGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGc < 1:344534/240‑1 (MQ=255)
gATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCAt < 1:162844/240‑1 (MQ=255)
aCTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCttt > 2:143683/1‑240 (MQ=255)
ggTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATgg < 1:98886/239‑1 (MQ=255)
tACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCAtt > 2:502278/1‑240 (MQ=255)
acCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGtt > 2:586549/1‑239 (MQ=255)
cTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAAtt > 2:288163/1‑240 (MQ=255)
tGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAAtt > 1:62019/1‑239 (MQ=255)
gCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTg > 2:395682/1‑239 (MQ=255)
ccGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGc < 1:142055/239‑1 (MQ=255)
gCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACTCTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCg < 1:355342/240‑1 (MQ=255)
gCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCg < 1:282107/240‑1 (MQ=255)
gCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCg < 1:19044/240‑1 (MQ=255)
cGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCg < 1:517227/239‑1 (MQ=255)
ccGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAGAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCg < 2:197967/235‑1 (MQ=255)
tCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTgctgg < 1:204765/240‑1 (MQ=255)
cACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACCTTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTgctgg > 2:346130/1‑239 (MQ=255)
ggAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCAtt > 2:28745/1‑169 (MQ=255)
ggAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATattatt > 1:36256/1‑239 (MQ=255)
gAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGatat < 2:589854/234‑1 (MQ=255)
tttGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTg > 1:129386/1‑239 (MQ=255)
tCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCAt > 2:156025/1‑240 (MQ=255)
cGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCAt < 1:331555/233‑1 (MQ=255)
cTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAAtt > 1:496038/1‑239 (MQ=255)
tGCTGTCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATAttatta < 2:585174/213‑1 (MQ=255)
tGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGa > 1:444224/1‑98 (MQ=255)
tGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGa < 2:444216/98‑1 (MQ=255)
aCCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCa > 2:460110/1‑240 (MQ=255)
aCCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTAGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGACATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATc > 2:177531/1‑239 (MQ=255)
cTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGt < 1:610356/239‑1 (MQ=255)
tACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTTGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCt < 1:195804/240‑1 (MQ=255)
tgctgctgACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAgg > 1:540766/1‑239 (MQ=255)
ctgctgACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTATCGTTTAt > 2:188905/1‑222 (MQ=255)
ctgctgACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTTTc > 2:227091/1‑231 (MQ=255)
ctgACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTAt > 2:412131/1‑239 (MQ=255)
cacTGAATCTGCCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTg < 1:283967/164‑1 (MQ=255)
tGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGaaaaa > 2:100367/1‑240 (MQ=255)
tCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTAATGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAaataat > 2:422342/1‑240 (MQ=255)
tAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATg < 2:505520/204‑1 (MQ=255)
tAGGTTTACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACATACGa > 2:602080/1‑240 (MQ=255)
tttACTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACa < 1:412139/239‑1 (MQ=255)
aCTTAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCtt > 2:482877/1‑240 (MQ=255)
ttAATCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCTTc < 1:372886/239‑1 (MQ=255)
aTCGCATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCTTCCAg > 1:225530/1‑239 (MQ=255)
|
TGGATATGCTGGCGTTACTGCTGTTCCTGACATTTAACGGTCATTTATGGTTGATTTCACTGCTGGTCGATACCTTTCACACCCTGCCGATTGGTGGCGAACCGTTGAACAGCAATGCGTTTCTGGCACTCACCAAAGCAGGGAGTTTGATTTTCCTTAACGGGCTGATGCTGGCGTTACCGCTCATTACTCTGCTGCTGACACTGAATCTGGCATTAGGTTTACTTAATCGTATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCTTCCAG > NC_000913/2023278‑2023744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
