Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A43 F60 I1 R1
|
14 |
61.8 |
2083732 |
98.8% |
2058727 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,119,259 |
IS1 (+) +9 bp |
intergenic (‑147/+330) |
yghJ ← / ← glcA |
putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
3119259 = | 0 (0.000) | 88 (1.430) |
54/278 |
0.1 |
100% |
intergenic (‑147/+338) |
yghJ/glcA |
putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| ? | NC_000913 |
= 3584195 |
NA (NA) | noncoding (768/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3119267 | 0 (0.000) | 50 (0.810) |
41/278 |
0.3 |
100% |
intergenic (‑155/+330) |
yghJ/glcA |
putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| ? | NC_000913 |
3583428 = |
NA (NA) | noncoding (1/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
AGCAAACACCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3119394‑3119259
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < NC_000913/3584195‑3584058
AGCAAACACCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTA < 1:633324/140‑1
AAACACCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATG < 1:406561/140‑1
CACCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACT < 2:106456/140‑1
ACCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTC > 1:396835/1‑140
CCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCC < 2:268388/140‑1
CCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCC < 1:155919/140‑1
CCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCC < 2:577483/140‑1
GTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAA < 2:250129/140‑1
TTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAAC > 2:97532/1‑140
TTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAAC > 1:52788/1‑140
CTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTT < 1:551218/140‑1
CTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTT < 1:871754/140‑1
TCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATT > 2:287430/1‑140
TGTTGC‑TTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGAc < 2:946180/140‑2
GTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:724992/1‑140
GTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 1:833169/1‑140
TTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:776808/140‑1
TTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 2:823928/140‑1
TGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:388338/1‑140
GCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:797989/1‑140
CTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:986236/1‑140
TTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:217238/140‑1
GCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 2:780910/1‑140
AATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:816196/140‑1
TCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:280472/140‑1
TCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:544401/140‑1
TCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:655907/140‑1
TCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:335601/140‑1
CGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 1:145220/140‑1
TAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTG‑TAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTGATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:713209/1‑140
AAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 1:13945/1‑140
CTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT > 1:502475/1‑140
CCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 2:46105/1‑140
CCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 1:59139/1‑140
CAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT > 1:739167/1‑140
CAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 1:620352/140‑1
CAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 2:13945/140‑1
ATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 2:41621/140‑1
AGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC > 1:544909/1‑140
TTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 2:329497/1‑140
TTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 1:232698/1‑140
TTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 1:243921/1‑140
TTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 2:714127/1‑140
TACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 2:532286/1‑140
TACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 2:488548/1‑140
TACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:515874/1‑140
TACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:890426/1‑140
ACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACC > 1:834715/1‑140
TGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATT < 1:954667/140‑1
TGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATT < 2:600665/140‑1
TGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT > 2:500203/1‑140
TGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT > 2:926150/1‑140
TGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT > 2:327613/1‑140
TGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT > 1:970047/1‑140
TGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT > 1:923265/1‑140
AAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA > 1:472304/1‑140
TTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA > 2:739388/1‑140
TTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA > 2:778599/1‑140
AATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 1:693212/140‑1
AATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 1:365521/140‑1
TTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 2:2236/1‑140
TTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTCTGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTT > 1:914909/1‑140
TTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTT > 2:395551/1‑140
TTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC < 1:395551/140‑1
GTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > 2:241575/1‑140
TTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:500203/140‑1
TGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCC < 1:577458/140‑1
GTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACATCGACTTCCGTCCC > 2:609178/1‑140
TTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCA < 2:468980/140‑1
TTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCA < 2:738068/140‑1
GAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGC < 1:488548/140‑1
AAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCC < 2:515874/140‑1
CGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCA > 2:70111/1‑140
GTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCGGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAG > 1:97884/1‑140
AGCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCC < 2:834715/140‑1
GCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 2:544909/140‑1
GCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:49338/140‑1
GCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 2:59139/140‑1
GCCAGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:609178/140‑1
AGATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAG < 1:722604/140‑1
ATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT > 1:937688/1‑140
ATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT < 1:790742/140‑1
ATAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT > 2:414191/1‑140
TAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 1:739388/140‑1
TAGACATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 1:778599/140‑1
ATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGT > 2:1030317/1‑140
ATCGTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGT > 1:754902/1‑140
TAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG > 2:931908/1‑140
AGCAAACACCGTTCTATCTGTTGCTTTTGCAATCTTAATCGTTAAAACTACCAACAAATTTATATAGTTACGTTGTGAAATGTTGTTAATTTTTTGTTTGTTGAAATTTCGTAAAAATAGCCAGATAGACATCGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3119394‑3119259
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < NC_000913/3584195‑3584058
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
