Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F60 I1 R1
|
10 |
83.4 |
2841042 |
98.7% |
2804108 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,354,487 |
C→T |
intergenic (‑437/‑238) |
yhcC ← / → gltB |
radical SAM family oxidoreductase YhcC/glutamate synthase subunit GltB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,354,487 | 0 | C | T | 100.0%
| 530.2
/ NA
| 149 | intergenic (‑437/‑238) | yhcC/gltB | radical SAM family oxidoreductase YhcC/glutamate synthase subunit GltB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (80/69); total (80/69) |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
AGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAGGGGGCGAATGCGAG > NC_000913/3354350‑3354623
|
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aGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAg < 2:627195/140‑1 (MQ=255)
gTCAGGAATTGGCTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 1:252829/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 1:1023824/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 1:1329440/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 2:1165617/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 1:963270/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 2:416834/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 2:550672/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 1:935977/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 2:857712/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 2:869620/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAATTGACTGTTCCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGc > 1:1124283/1‑140 (MQ=255)
tctggAATTGACTGGGTATCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAGATATAAGATCCATTTTTATTTCAGTCATTTATTTAAGATTTTTGTGCTAGATCGACTTTATGTACCAATAAACTTGCCATTTGATCTGTATTAGCt > 2:1212394/4‑140 (MQ=255)
tCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCt > 1:534605/1‑140 (MQ=255)
tCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCt < 1:369589/140‑1 (MQ=255)
aGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCttt > 1:701589/1‑140 (MQ=255)
aCTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATaa > 1:1213688/1‑140 (MQ=255)
cGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGc < 1:931366/140‑1 (MQ=255)
ggcTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCAATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTCCGCTAAAGCACATATCTGGACTAATAAACTTACCATTTAAGGTGTATTAGCTAACTCGATAAGTTGGAAATCGGCt > 2:1352596/3‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCTGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:306563/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGc < 2:1222646/139‑1 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGc > 1:1222646/1‑139 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:717205/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:574350/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:634913/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:1040701/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:720406/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:751093/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:1232264/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:129571/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:186805/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:299500/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:332440/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 2:797841/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:438088/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:1072477/1‑140 (MQ=255)
gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCt > 1:1180641/1‑140 (MQ=255)
aCTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTg > 1:31535/1‑140 (MQ=255)
aCTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTg > 1:1158184/1‑140 (MQ=255)
ttCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGa < 2:938168/140‑1 (MQ=255)
ttttAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCtt < 1:276138/140‑1 (MQ=255)
ttttAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCACGTTAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCtt > 2:1327255/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTc > 1:1381147/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTc > 1:146618/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTc < 2:741151/140‑1 (MQ=255)
aGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTg > 1:1244809/1‑140 (MQ=255)
aGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTg < 1:1401375/140‑1 (MQ=255)
gCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTgg > 2:596112/1‑140 (MQ=255)
cTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGAt < 2:1368505/140‑1 (MQ=255)
cTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGAt < 2:941799/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATg > 2:427596/1‑140 (MQ=255)
aaaGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGag > 1:540387/1‑140 (MQ=255)
tAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGcc < 2:371114/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCt > 2:350405/1‑140 (MQ=255)
aaaaTCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCt > 2:1264462/1‑140 (MQ=255)
aaaTCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTg < 2:640459/140‑1 (MQ=255)
aaTCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGc < 2:717205/140‑1 (MQ=255)
aTCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCt < 1:970002/140‑1 (MQ=255)
ccATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtca < 1:357795/140‑1 (MQ=255)
cATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtcat < 1:869620/140‑1 (MQ=255)
cATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtcat < 1:186805/140‑1 (MQ=255)
cATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtcat < 1:332440/140‑1 (MQ=255)
tttCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGGCCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa < 2:644604/140‑1 (MQ=255)
tttCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa < 2:191038/140‑1 (MQ=255)
tttCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa < 1:331296/140‑1 (MQ=255)
tttCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa < 1:247340/140‑1 (MQ=255)
ttCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTAt > 1:841365/1‑140 (MQ=255)
tCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATg < 1:1281952/140‑1 (MQ=255)
cAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGc < 2:1072477/140‑1 (MQ=255)
cAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGc < 1:1160077/140‑1 (MQ=255)
cAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGc < 1:557491/140‑1 (MQ=255)
cAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGc < 2:718757/140‑1 (MQ=255)
aGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCTCATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCa < 1:236995/140‑1 (MQ=255)
aGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCa < 1:1264462/140‑1 (MQ=255)
ttAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAAtt < 1:650540/140‑1 (MQ=255)
taataaAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTg > 2:330059/1‑140 (MQ=255)
aaGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATc > 1:1185813/1‑140 (MQ=255)
aGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATcc < 1:596112/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATccc < 2:1124283/140‑1 (MQ=255)
tGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTc < 1:113147/140‑1 (MQ=255)
gcgcTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCa < 2:879713/140‑1 (MQ=255)
gcgcTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCa < 1:422900/140‑1 (MQ=255)
gcgcTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCACATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCa < 2:631952/140‑1 (MQ=255)
gcgcTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCCGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCa < 2:991072/140‑1 (MQ=255)
ttCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCa < 2:585095/126‑1 (MQ=255)
ttCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCa > 1:585095/1‑126 (MQ=255)
tGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCg < 2:709914/140‑1 (MQ=255)
cAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAg < 1:734887/140‑1 (MQ=255)
cAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAg < 2:720406/140‑1 (MQ=255)
cAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAg < 2:548116/140‑1 (MQ=255)
cAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAg < 1:321276/140‑1 (MQ=255)
tAAGCTTGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGac > 2:1265943/1‑140 (MQ=255)
tGCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAg > 2:79629/1‑140 (MQ=255)
gCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAgg > 1:720381/1‑140 (MQ=255)
gCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAgg > 1:808778/1‑140 (MQ=255)
gCCATTTGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAgg > 2:462309/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTGTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGTGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAGGGGGCg < 2:928355/140‑1 (MQ=255)
gTATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAGGGGGCGAATGCGa > 2:734959/1‑140 (MQ=255)
tATTAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCGTCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAGGGGGCGAATGCGAg > 1:1052034/1‑140 (MQ=255)
|
AGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATTGAGATCCCCTCTTCACCGTATTAACCGATGCGAAAAGGACAACAAGGGGGCGAATGCGAG > NC_000913/3354350‑3354623
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
