Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
126 |
51.4 |
1736588 |
99.0% |
1719222 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,367,774 |
(C)6→7 |
intergenic (+132/‑53) |
yhcF → / → yhcG |
DUF1120 domain‑containing protein YhcF/DUF1016 domain‑containing protein YhcG |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,367,768 | 1 | . | C | 98.2%
| 189.7
/ ‑3.3
| 55 | intergenic (+126/‑59) | yhcF/yhcG | DUF1120 domain‑containing protein YhcF/DUF1016 domain‑containing protein YhcG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (30/24); total (31/24) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
TAGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑CCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGC > NC_000913/3367629‑3367901
|
tAGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑a < 2:827908/140‑1 (MQ=255)
aGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑c < 2:757094/140‑1 (MQ=255)
aGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑c < 2:735395/140‑1 (MQ=255)
aGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑c < 1:369074/140‑1 (MQ=255)
tCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccc < 2:627333/140‑1 (MQ=255)
tCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccc < 2:5141/140‑1 (MQ=255)
tACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTTGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGCAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccc > 2:418124/1‑140 (MQ=255)
aCTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑cccccc < 2:198331/140‑1 (MQ=255)
aCTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑cccccc < 2:184055/140‑1 (MQ=255)
ttGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccccca > 1:154967/1‑138 (MQ=255)
ttGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccccca > 2:787820/1‑138 (MQ=255)
ttGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccccca < 2:409926/140‑3 (MQ=255)
ttGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccccca < 2:154967/140‑3 (MQ=255)
ttGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccccca < 1:787820/140‑3 (MQ=255)
ttGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGCGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑ccccccca < 2:807663/140‑3 (MQ=255)
aTAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGta > 1:772926/1‑140 (MQ=255)
aaCAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATGCGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTCTC‑CCCCCCAGAGtata < 2:144637/140‑1 (MQ=255)
aaTGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCt < 2:287818/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCa > 2:496150/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCa < 2:110766/140‑1 (MQ=255)
gCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCAt > 1:757009/1‑140 (MQ=255)
aCAGGAGTACTACCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCat > 1:507341/1‑140 (MQ=255)
aGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCatta > 1:808728/1‑140 (MQ=255)
gAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCattatt > 2:331330/1‑140 (MQ=255)
cTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACt < 2:808728/140‑1 (MQ=255)
cTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACt > 2:529917/1‑140 (MQ=255)
cTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACt > 2:744644/1‑140 (MQ=255)
tCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAg > 2:223156/1‑140 (MQ=255)
aGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑CCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTc > 2:76783/1‑140 (MQ=255)
ggCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCattatt > 1:297317/1‑129 (MQ=255)
ggCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCattatt < 2:297317/129‑1 (MQ=255)
ggCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTc > 2:505237/1‑140 (MQ=255)
cATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCa > 2:302998/1‑140 (MQ=255)
tCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCatat > 2:176586/1‑140 (MQ=255)
cGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCAtata < 1:176586/140‑1 (MQ=255)
gTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATaa < 1:529917/140‑1 (MQ=255)
tataCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAggg < 1:328322/140‑1 (MQ=255)
tataCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAggg < 2:772926/140‑1 (MQ=255)
ataCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGa < 1:230745/140‑1 (MQ=255)
ataCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGa < 2:109073/140‑1 (MQ=255)
ataCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGa < 1:496150/140‑1 (MQ=255)
aCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACa < 2:757009/140‑1 (MQ=255)
aCGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACa < 1:744644/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCt < 1:725918/122‑1 (MQ=255)
aTCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCt > 2:725918/1‑122 (MQ=255)
aTCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGAt > 2:395940/1‑140 (MQ=255)
gTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATg > 2:455897/1‑140 (MQ=255)
aaTGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGaa < 2:65369/140‑1 (MQ=255)
aTGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAAt < 1:455897/140‑1 (MQ=255)
tCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGctc < 1:331330/140‑1 (MQ=255)
aGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCtctc > 2:55210/1‑140 (MQ=255)
ctctTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGa > 2:678779/1‑140 (MQ=255)
atCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCAcagcag > 2:295741/1‑140 (MQ=255)
aaaGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGc < 1:55210/140‑1 (MQ=255)
aaGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCa > 2:451284/1‑140 (MQ=255)
gTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCaaa > 1:111857/1‑140 (MQ=255)
tGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCac < 1:223156/140‑1 (MQ=255)
tGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCac > 1:359996/1‑140 (MQ=255)
gTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCacg > 1:791762/1‑140 (MQ=255)
tAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCacga < 1:718142/140‑1 (MQ=255)
aTACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCacgacg > 2:333866/1‑140 (MQ=255)
tACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACgg < 1:451284/140‑1 (MQ=255)
aaCGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACgg < 2:561522/139‑1 (MQ=255)
aCGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGt < 2:507341/140‑1 (MQ=255)
ttCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACgg < 1:530048/133‑1 (MQ=255)
ttCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACgg > 2:530048/1‑133 (MQ=255)
ttCTTAATTGTTCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTattatt > 1:317075/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCg > 2:409520/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCg > 1:206641/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCg > 1:531522/1‑140 (MQ=255)
tGCTC‑ACCCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAgc > 2:685350/1‑140 (MQ=255)
|
TAGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTC‑A‑CCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGC > NC_000913/3367629‑3367901
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
