Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A15 F73 I1 R1
|
29 |
140.0 |
4785556 |
99.3% |
4752057 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,412,516 |
C→A |
L44I (CTA→ATA) |
yjfM → |
DUF1190 domain‑containing protein YjfM |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,412,516 | 0 | C | A | 99.4%
| 588.2
/ ‑4.1
| 169 | L44I (CTA→ATA) | yjfM | DUF1190 domain‑containing protein YjfM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (80/88); total (81/88) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGCTAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTGCGCGC > NC_000913/4412380‑4412651
|
tcctGGCCAGTAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGATCGATTAGTCGCATTGTTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:2304269/4‑140 (MQ=255)
tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:329684/1‑140 (MQ=255)
tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:320097/1‑140 (MQ=255)
tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:569549/1‑140 (MQ=255)
tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 2:2284486/1‑140 (MQ=255)
tCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGc > 1:1508626/1‑140 (MQ=255)
tGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGt > 1:1089921/1‑140 (MQ=255)
ggCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTg < 1:880045/140‑1 (MQ=255)
aaaaCGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGTGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCtt > 2:824103/1‑140 (MQ=255)
aaaaCGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGc > 2:2179893/1‑138 (MQ=255)
aaaaCGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCtt > 2:651219/1‑140 (MQ=255)
aaaaCGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCtt > 1:946791/1‑140 (MQ=255)
aaaaCGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCtt > 1:1303425/1‑140 (MQ=255)
gCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTc < 2:187747/140‑1 (MQ=255)
gCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTc < 1:1778179/140‑1 (MQ=255)
gCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTc < 1:208056/140‑1 (MQ=255)
cAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCg < 1:1950342/140‑1 (MQ=255)
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aaCAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTg > 1:615532/1‑140 (MQ=255)
aGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAg < 2:1508626/140‑1 (MQ=255)
tAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCg > 1:1262281/1‑140 (MQ=255)
tAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCg > 1:1021502/1‑140 (MQ=255)
aTTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGAtag > 1:2244719/1‑140 (MQ=255)
ttGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGAtagt > 2:2016905/1‑140 (MQ=255)
gTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGc > 1:1775343/1‑140 (MQ=255)
gTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGc > 2:726926/1‑140 (MQ=255)
gTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGc > 2:886483/1‑140 (MQ=255)
tCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCg < 1:601646/140‑1 (MQ=255)
tCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCg < 2:1368422/140‑1 (MQ=255)
tCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCg < 1:1140523/140‑1 (MQ=255)
cACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGa > 1:845884/1‑140 (MQ=255)
cACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGa > 2:972621/1‑140 (MQ=255)
aCGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGAt < 1:1144655/140‑1 (MQ=255)
cGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTTCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATg > 2:511936/1‑140 (MQ=255)
aTTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTTAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATaa > 1:69982/1‑140 (MQ=255)
cGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAAcgacgg > 1:2335787/1‑140 (MQ=255)
aTTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAAcgacggcga < 1:2284486/140‑1 (MQ=255)
tGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAAcgacggcgacg < 2:575994/140‑1 (MQ=255)
ccGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGtt > 2:1058285/1‑140 (MQ=255)
aataatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAacgac < 2:9126/123‑1 (MQ=255)
aataatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTa > 1:1247525/1‑140 (MQ=255)
aataatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTa > 1:276970/1‑140 (MQ=255)
aataatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTa > 2:1274380/1‑140 (MQ=255)
aataatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTa > 2:1718961/1‑140 (MQ=255)
aataatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGATGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTa > 2:2354635/1‑140 (MQ=255)
taatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTAcg < 2:2130399/140‑1 (MQ=255)
taatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTAcg < 1:1477324/140‑1 (MQ=255)
aatCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTAcgc < 2:36527/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 2:2214346/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 1:1924833/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 2:276970/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 1:2324130/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 2:931020/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 1:743803/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 1:726926/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 2:615532/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACa < 2:1946652/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACa > 1:2304097/1‑140 (MQ=255)
cTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACa < 1:511936/140‑1 (MQ=255)
ttttAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGt < 2:69982/140‑1 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTg < 2:845884/140‑1 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTg < 1:219515/140‑1 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTg > 2:2337533/1‑140 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTg < 1:893082/140‑1 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTg < 1:842116/140‑1 (MQ=255)
gAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCa < 1:989243/140‑1 (MQ=255)
gAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCa < 2:1775343/140‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 2:1085012/140‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 1:2337533/140‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 1:635601/140‑1 (MQ=255)
ccGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 2:898548/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGGACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTg > 2:1508714/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGCTAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTg > 1:256297/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa > 2:2224776/1‑127 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa > 2:2255855/1‑127 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 1:2224776/127‑1 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGa < 1:2255855/127‑1 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTg < 1:916371/132‑1 (MQ=255)
tGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 2:425193/137‑1 (MQ=255)
gCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGt > 1:1652966/1‑140 (MQ=255)
aaTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtga < 2:422291/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 1:2034772/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 1:2217785/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 1:1058285/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 1:320097/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 1:330993/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 2:1557381/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat > 2:209815/1‑140 (MQ=255)
aTCGCGACGCACAGAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTCAACGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACAGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat < 1:2380349/140‑1 (MQ=255)
cGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgatga < 2:2374114/140‑1 (MQ=255)
gCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATtgat > 1:393806/1‑137 (MQ=255)
tACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACgg > 2:853270/1‑140 (MQ=255)
aCGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGa < 2:125905/124‑1 (MQ=255)
cGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGTCGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGta < 2:1127640/140‑1 (MQ=255)
caAAAATACTTAACGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGtaataa > 1:1391005/1‑140 (MQ=255)
cGTTGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgc > 1:242295/1‑140 (MQ=255)
tGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcg > 1:911238/1‑140 (MQ=255)
tGGCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcg < 2:1303425/140‑1 (MQ=255)
ggCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcgc < 1:1562101/140‑1 (MQ=255)
ggCGATAATGGGCGGTGCCGCTTTCTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTgcgcgc < 2:71509/140‑1 (MQ=255)
|
GACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCACAAAAATACTTAACGTTGGCGCTAATGGGCGGTGCCGCTTTTTTCGTATTGAAAGGTTGTAGCGATAGTAGCGATGTCGATAACGACGGCGACGGAACGTTTTACGCGACAGTGCAGGATTGTATTGATGACGGTAATAATGCCGACATTTGCGCGC > NC_000913/4412380‑4412651
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
