Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F28 I1 R1
|
172 |
67.8 |
2301510 |
98.9% |
2276193 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,354,227 |
T→C |
E164G (GAA→GGA) |
lysU ← |
lysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,354,227 | 0 | T | C | 100.0%
| 262.4
/ NA
| 75 | E164G (GAA→GGA) | lysU | lysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (34/41); total (34/41) |
GTTTCTACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTTCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGATAATGTCAC > NC_000913/4354095‑4354362
|
gTTTCTACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATc < 2:818315/140‑1 (MQ=255)
ttCTACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCt < 1:323702/140‑1 (MQ=255)
tCTACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTg > 1:48899/1‑140 (MQ=255)
cTACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGc < 2:613789/140‑1 (MQ=255)
tACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCa < 1:959260/140‑1 (MQ=255)
tACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCa < 2:397866/140‑1 (MQ=255)
tAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATgg > 1:254162/1‑140 (MQ=255)
tAAAGCCGCGCCCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGCCAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATgg > 2:854881/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGaa > 1:771736/1‑140 (MQ=255)
cgcgcgACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGa < 2:41438/133‑1 (MQ=255)
cgcgcgACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGa > 1:41438/1‑133 (MQ=255)
cgcgcgACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATc > 2:589819/1‑140 (MQ=255)
cgcgcgACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATc > 2:972100/1‑140 (MQ=255)
cgcgcgACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATc > 2:303330/1‑140 (MQ=255)
cgcgACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTg < 2:982519/140‑1 (MQ=255)
ccATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTaaa < 1:854881/140‑1 (MQ=255)
cATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAg < 1:530550/140‑1 (MQ=255)
cATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAg < 1:889066/140‑1 (MQ=255)
tGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGa < 2:771736/140‑1 (MQ=255)
aCGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTAt > 2:590619/1‑122 (MQ=255)
aCGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTAt < 1:590619/122‑1 (MQ=255)
aCGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAgcg > 1:840292/1‑138 (MQ=255)
tAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTa > 1:258230/1‑140 (MQ=255)
ggCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTca < 2:699337/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTcag > 1:128870/1‑140 (MQ=255)
ccAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTcagc < 2:97337/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAgg < 2:481179/140‑1 (MQ=255)
aaTTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGgc > 1:529234/1‑140 (MQ=255)
aTTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGgcg < 2:254162/140‑1 (MQ=255)
aTTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGgcg < 1:1083211/140‑1 (MQ=255)
tttGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAg < 1:589819/140‑1 (MQ=255)
ttGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGc < 2:529234/140‑1 (MQ=255)
tGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCt < 1:811380/140‑1 (MQ=255)
tGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCt < 1:1125345/140‑1 (MQ=255)
tGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCt < 2:756397/140‑1 (MQ=255)
aaCGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCa < 2:599232/140‑1 (MQ=255)
aCGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAg < 1:515003/140‑1 (MQ=255)
cGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGt < 1:962971/140‑1 (MQ=255)
aacaaACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGt < 1:893327/140‑1 (MQ=255)
gTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGa > 2:132041/1‑140 (MQ=255)
gTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGa < 1:303330/140‑1 (MQ=255)
tttGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCt < 1:546487/123‑1 (MQ=255)
tttGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCt > 2:546487/1‑123 (MQ=255)
tGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAg > 2:682149/1‑140 (MQ=255)
tGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAg > 2:26359/1‑140 (MQ=255)
cGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTc < 2:774909/140‑1 (MQ=255)
aTCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGttt > 2:583675/1‑140 (MQ=255)
aTCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGttt < 1:972100/140‑1 (MQ=255)
aTCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGttt < 2:356466/140‑1 (MQ=255)
gATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTaa < 2:102703/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAAc > 1:111324/1‑140 (MQ=255)
tGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAAc > 2:575314/1‑140 (MQ=255)
tGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAAc > 2:418591/1‑140 (MQ=255)
aGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAg < 1:583675/140‑1 (MQ=255)
cAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTAc > 2:580157/1‑140 (MQ=255)
cAGATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTAc > 1:839586/1‑140 (MQ=255)
gATAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACcg < 1:580157/140‑1 (MQ=255)
tAACGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACcgcg < 1:26359/140‑1 (MQ=255)
aCGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCggg < 1:575314/140‑1 (MQ=255)
cGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACcg < 2:232664/135‑1 (MQ=255)
cGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACcg > 1:232664/1‑135 (MQ=255)
cGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGc > 1:128828/1‑140 (MQ=255)
cGTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGc > 1:366716/1‑140 (MQ=255)
gTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCa > 2:154691/1‑140 (MQ=255)
gTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCa > 1:840194/1‑140 (MQ=255)
gTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCa > 1:738135/1‑140 (MQ=255)
gTTGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCa < 2:111324/140‑1 (MQ=255)
tGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCAcc > 1:96220/1‑140 (MQ=255)
tGACGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCAcc > 1:146884/1‑140 (MQ=255)
aCGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGa < 1:418591/140‑1 (MQ=255)
aCGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGa < 2:146884/140‑1 (MQ=255)
cGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGAt > 2:842395/1‑140 (MQ=255)
cGATAACGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGAt > 2:782314/1‑140 (MQ=255)
aCGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGATAATGt < 2:96220/140‑1 (MQ=255)
aCGGACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGATAATGt > 2:33206/1‑140 (MQ=255)
gACTCCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGATAATGTCAc < 1:33206/140‑1 (MQ=255)
|
GTTTCTACTTCCATAAAGCCGCGCGCGACCATGAATTGACGGATAGCGGCCAGAATTTTTGAACGGACAACAAACGTTTGACGGGATTTATCGTTAGCGATGAGGTCCAGATAACGTTGACGATAACGGACTTCCTGATCCTGCAGACCATGGAATTTATCTGGTAAAGGACGTAGTGCTTTAGTCAGCAGGCGCAGCTCAGTACAGTGAATGGAAAGCTCACCCGTTTGCGTCTTAAACAGCGTACCGCGGGCACCGATAATGTCAC > NC_000913/4354095‑4354362
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
