Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,240,984 |
(G)7→8 |
coding (1041/1245 nt) |
sstT → |
serine/threonine:Na(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,240,977 | 1 | . | G | 95.9%
| 166.3
/ 0.1
| 49 | coding (1034/1245 nt) | sstT | serine/threonine:Na(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (9/38); total (10/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.26e-01 |
TGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTC > NC_000913/3240842‑3241109
|
tGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg < 1:2030467/140‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg < 1:967255/140‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg < 1:1956082/140‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg < 1:1802543/140‑1 (MQ=255)
tGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg < 2:1211400/140‑1 (MQ=255)
gcgggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggggg < 1:444073/140‑1 (MQ=255)
cgggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggg < 1:25858/140‑1 (MQ=255)
ggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggggt < 1:111211/140‑3 (MQ=255)
ggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggggt < 1:1923892/140‑3 (MQ=255)
ggcgCAGCAATCACTATTACCCTGTTTTCGCTGGCCGGGGGTTATAAGCTGGGGGTTCCGGTCGGTCTTCCCCCCGCGCTGCCTTTGTGCGCGGGGGGTTCTCTGTGTGCCTGTGGGGCGTCCGGCGCGGC‑ggggggggg > 2:1255372/1‑138 (MQ=255)
cgcAGCAATCCCTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATT‑CGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggggtctc < 1:1246960/140‑6 (MQ=255)
gcagcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggggtctc < 1:713418/140‑6 (MQ=255)
gcagcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggggtctc < 2:1204511/140‑6 (MQ=255)
gcagcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTACCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑ggggggggtctc < 1:1471895/140‑6 (MQ=255)
agcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTctg < 2:2228982/140‑1 (MQ=255)
caATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTctgct < 2:1767326/140‑1 (MQ=255)
caATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg > 1:1331790/1‑128 (MQ=255)
caATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑gggg < 2:1331790/128‑1 (MQ=255)
aaTCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTctgctg < 1:1598891/140‑1 (MQ=255)
tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:2156447/140‑1 (MQ=255)
tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:1711651/140‑1 (MQ=255)
tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:2269430/1‑140 (MQ=255)
tACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTCAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:2081500/1‑140 (MQ=255)
ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACt < 1:253084/140‑1 (MQ=255)
cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTg < 2:530722/140‑1 (MQ=255)
cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTg < 1:1927752/140‑1 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:771633/140‑1 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:868780/1‑140 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 2:2379998/1‑140 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1732946/140‑1 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:644237/140‑1 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1385651/140‑1 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGGTGCTGATCCCACAGGc > 1:897249/1‑140 (MQ=255)
tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGGTccccgcggc > 2:2216200/1‑134 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 2:905075/1‑133 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:905075/133‑1 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:211069/138‑1 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:301857/138‑1 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:301857/1‑138 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:1011863/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGGTCTCCCGCTGATTCCACCGGCCt > 2:5236/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGccc > 1:387751/1‑139 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:211069/1‑138 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:79722/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACCTGCCt > 1:1078078/1‑140 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGATGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:983020/138‑1 (MQ=255)
ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGATGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 2:983020/1‑138 (MQ=255)
tGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg < 2:1928209/140‑1 (MQ=255)
gACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGt > 1:240816/1‑140 (MQ=255)
gACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGt > 2:2088921/1‑140 (MQ=255)
gctggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGCCTGTaaa > 2:116382/1‑139 (MQ=255)
ggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTTCTGCTGGTCCCCCCGGCCCGTaaaaat > 2:49546/1‑136 (MQ=255)
tgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTc < 1:5236/140‑1 (MQ=255)
gCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCg < 1:2249798/140‑1 (MQ=255)
aTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtttt > 1:815644/1‑139 (MQ=255)
aTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGGTCTGCTGGGTAACCCCCTTGCCTGGAATATGTTCTGTttttt > 2:604754/1‑139 (MQ=255)
aTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCCGTAATATGTTTGGGAtttt > 2:1493631/1‑139 (MQ=255)
cGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaa < 1:10940/140‑1 (MQ=255)
cGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaa < 1:2379998/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTTCTCCTCTTTCCCCTGGCCTGTAATAATTTTGGGAttttgcaa > 1:2320620/1‑135 (MQ=255)
tGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGa < 1:2004960/140‑1 (MQ=255)
tGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGa > 1:1649506/1‑140 (MQ=255)
ggggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGa < 1:1888/139‑1 (MQ=255)
gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGat > 2:1891867/1‑140 (MQ=255)
gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTTGGACGat > 2:2004960/1‑140 (MQ=255)
tATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATc < 2:2269430/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc < 1:1510663/140‑1 (MQ=255)
gTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCACATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGc < 1:766351/140‑1 (MQ=255)
tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCa > 1:369297/1‑140 (MQ=255)
tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACCGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTTGAACGATATCGcccagcc > 2:1888/1‑135 (MQ=255)
cACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGcc > 1:2019469/1‑140 (MQ=255)
cGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGt < 2:868780/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCCTGCAGGGGGGTGCCGTc > 2:803012/1‑140 (MQ=255)
tgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACCGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGGGGGTGCCGTCGGCtt > 2:289051/1‑140 (MQ=255)
ttGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatca < 2:2081500/140‑1 (MQ=255)
ttGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCTGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCCTGCAGGGGGGTGCCGTCGGCCTTttca > 2:543193/1‑140 (MQ=255)
tGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 1:817047/140‑1 (MQ=255)
agacagggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:1237284/134‑1 (MQ=255)
gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:543193/140‑1 (MQ=255)
gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 2:240816/140‑1 (MQ=255)
gtggtgGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 2:369297/140‑1 (MQ=255)
ggtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGTCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTa < 1:604754/140‑1 (MQ=255)
gtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTCATCATCGGCGTAt < 1:289051/140‑1 (MQ=255)
tggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTAtt > 1:2292898/1‑140 (MQ=255)
gtgCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTTGAACGATATCGCCATGCAGGTGGGTGCCGTCGGCTTTTTTATCGGCGTATTGCAGGAcctgtct > 2:1237284/1‑134 (MQ=255)
cTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTTGAACGATATCGCCATGCAGGTGGGTGCCGTCGGCTTTTTCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTTCGaa > 2:1400389/1‑140 (MQ=255)
gtgGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGC‑TTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAAcc < 2:815644/140‑1 (MQ=255)
gcgcATCCGGCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACCGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGGTGCCGTCGGCTTTTTCATCGGCGGATTGCAGGACTCTTGCGAAACcgc > 2:1515741/1‑140 (MQ=255)
aTCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCAAAACCGCGCTg < 1:1658474/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAActc < 2:1078078/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAActc < 2:2270674/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGCGGGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTTGAACGATATCGCCCTGCAGGGGGGTGCCGTCGGCTTTTTTATCGGCGGATTGCAGGACTCTTGCGAAAACCCGCCGGActc > 2:2225993/1‑140 (MQ=255)
|
TGGCGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTC > NC_000913/3240842‑3241109
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
