Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F73 I1 R1
|
28 |
161.3 |
5699896 |
99.3% |
5659996 |
139.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,133,720 |
C→A |
intergenic (+214/‑115) |
metF → / → katG |
5,10‑methylenetetrahydrofolate reductase/hydroperoxidase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,133,720 | 0 | C | A | 100.0%
| 739.0
/ NA
| 206 | intergenic (+214/‑115) | metF/katG | 5,10‑methylenetetrahydrofolate reductase/hydroperoxidase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (68/138); total (68/138) |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CGGGAAAATAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATCTCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGACGATATCC > NC_000913/4133584‑4133856
|
cGGGAAAATAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTAGATCTACATatct < 2:2826180/140‑1 (MQ=255)
aaTAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAAcc < 1:2774131/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 1:467484/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 2:1232392/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 1:2322404/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 2:2644451/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 2:2785074/140‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 2:1902055/140‑1 (MQ=255)
aGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATTTTTAACcaaca < 2:1436518/140‑1 (MQ=255)
aGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaaca < 2:184490/140‑1 (MQ=255)
tCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGt > 1:934168/1‑140 (MQ=255)
cAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTa < 1:1591194/140‑1 (MQ=255)
cAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTa < 1:1623071/140‑1 (MQ=255)
cAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTa < 2:1152287/140‑1 (MQ=255)
cAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTa < 1:2228984/140‑1 (MQ=255)
cAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTa < 2:1279505/140‑1 (MQ=255)
aGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa > 1:762496/1‑130 (MQ=255)
aGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACcaa < 2:762496/130‑1 (MQ=255)
aGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTaa > 2:1676819/1‑140 (MQ=255)
cTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGAt < 1:2189231/140‑1 (MQ=255)
cTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGAt < 1:2274033/140‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGAtc > 1:2487950/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTCTTCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGAtct > 2:2675046/1‑140 (MQ=255)
gTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGAtctc < 1:2161741/140‑1 (MQ=255)
ttttCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCa < 2:2530885/140‑1 (MQ=255)
tttCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCaa < 1:2535468/140‑1 (MQ=255)
tttCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCaa < 2:2054418/140‑1 (MQ=255)
ttCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAAc < 2:255485/140‑1 (MQ=255)
ttCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAAc < 2:2749664/140‑1 (MQ=255)
tcCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCa > 2:2174575/1‑135 (MQ=255)
tcCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTAt > 1:492018/1‑140 (MQ=255)
ccTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCg < 2:2495119/140‑1 (MQ=255)
cTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGc < 2:1756455/140‑1 (MQ=255)
cTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGc < 1:1114710/140‑1 (MQ=255)
cATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCAt > 1:777141/1‑140 (MQ=255)
aTTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATc < 1:1556799/140‑1 (MQ=255)
cTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTg > 1:2402337/1‑140 (MQ=255)
tGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGa > 1:554723/1‑140 (MQ=255)
ggATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTaa > 2:2505211/1‑140 (MQ=255)
gATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGAt < 2:1039511/136‑1 (MQ=255)
gATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGAt > 1:1039511/1‑136 (MQ=255)
atatGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAAtt < 2:492018/140‑1 (MQ=255)
atatGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAAtt < 2:2038838/140‑1 (MQ=255)
atGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCa > 1:1927029/1‑140 (MQ=255)
tGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCaa > 2:644863/1‑140 (MQ=255)
tGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCaa > 1:1724626/1‑140 (MQ=255)
gAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAAt < 2:2487950/140‑1 (MQ=255)
gCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATtat < 2:383118/140‑1 (MQ=255)
tAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATaa < 1:2124668/140‑1 (MQ=255)
tAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATaa > 1:1994004/1‑140 (MQ=255)
aaaaCCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAAc < 1:1431739/140‑1 (MQ=255)
aaaCCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACt > 1:784598/1‑140 (MQ=255)
aaaCCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACt > 2:2111474/1‑140 (MQ=255)
aaaCCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACt > 2:2653621/1‑140 (MQ=255)
aaCCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACtt < 2:1362680/140‑1 (MQ=255)
aaCCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACtt < 2:825737/140‑1 (MQ=255)
ttttttATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTtctctc > 2:1592506/1‑140 (MQ=255)
tttttATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTctctct > 1:166300/1‑140 (MQ=255)
ttttATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTa < 1:1676819/140‑1 (MQ=255)
tttATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTaa < 1:2505211/140‑1 (MQ=255)
tataAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATTTGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACg < 1:2022534/140‑1 (MQ=255)
tataAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACg < 1:1335597/140‑1 (MQ=255)
tataAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACg < 1:293683/140‑1 (MQ=255)
tataAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACg < 2:1625395/140‑1 (MQ=255)
tataAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACg < 1:708219/140‑1 (MQ=255)
ataAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGc < 2:1550924/140‑1 (MQ=255)
taAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCt < 1:1911633/140‑1 (MQ=255)
taAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGAGCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCGCTCTAACGCt < 2:540754/140‑1 (MQ=255)
aaaGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCtg > 2:2255690/1‑140 (MQ=255)
aaGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCtgt > 1:840125/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTAt < 2:2346209/140‑1 (MQ=255)
ttGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCg > 1:1584245/1‑140 (MQ=255)
tGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGt < 2:582093/140‑1 (MQ=255)
gAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACgg < 1:2111474/140‑1 (MQ=255)
gAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACgg < 1:2653621/140‑1 (MQ=255)
gAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACgg < 2:2402337/140‑1 (MQ=255)
aaTTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGt < 1:2618740/140‑1 (MQ=255)
aaTTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGt < 1:1226746/140‑1 (MQ=255)
aaTTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCATGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAAc > 2:1019906/1‑122 (MQ=255)
aaTTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCATGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAAc < 1:1019906/122‑1 (MQ=255)
aTTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGt > 2:1791895/1‑133 (MQ=255)
aTTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGt < 1:1791895/133‑1 (MQ=255)
ttCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTaa < 1:1862491/140‑1 (MQ=255)
cGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAaca < 2:640029/140‑1 (MQ=255)
tAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTag > 2:718815/1‑140 (MQ=255)
tCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAaca > 1:2048961/1‑131 (MQ=255)
cAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAggg < 2:1994004/140‑1 (MQ=255)
aaGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGca < 1:718815/140‑1 (MQ=255)
taattaaGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATtg < 1:59281/140‑1 (MQ=255)
taattaaGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATtg > 1:1265089/1‑140 (MQ=255)
aaGATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAg < 2:2126589/140‑1 (MQ=255)
gATCAATTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCAGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCa > 1:2056243/1‑140 (MQ=255)
aaTTTGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTc < 2:1961003/140‑1 (MQ=255)
tttGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAg > 2:1854225/1‑132 (MQ=255)
tttGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAg < 2:2356429/140‑1 (MQ=255)
ttGATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGa < 1:401176/140‑1 (MQ=255)
gATCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGACg < 2:2329453/140‑1 (MQ=255)
tCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGACGat < 1:2675046/140‑1 (MQ=255)
tCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGACGat < 2:1724626/140‑1 (MQ=255)
tCTACATATCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGACGat > 2:872748/1‑140 (MQ=255)
|
CGGGAAAATAAGGTTATCAGCCTTGTTTTCTCCCTCATTACTTGAAGGATATGAAGCTAAAACCCTTTTTTATAAAGCATTTGTCCGAATTCGGACATAATCAAAAAAGCTTAATTAAGATCAATTTGATCTACATCTCTTTAACCAACAATATGTAAGATCTCAACTATCGCATCCGTGGATTAATTCAATTATAACTTCTCTCTAACGCTGTGTATCGTAACGGTAACACTGTAGAGGGGAGCACATTGATGAGCACGTCAGACGATATCC > NC_000913/4133584‑4133856
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
