Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F73 I1 R1
|
34 |
113.1 |
3988162 |
99.3% |
3960244 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,270,214 |
G→T |
intergenic (+87/‑24) |
aphA → / → yjbQ |
acid phosphatase/phosphotransferase/UPF0047 protein YjbQ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,270,214 | 0 | G | T | 99.0%
| 360.7
/ ‑2.9
| 103 | intergenic (+87/‑24) | aphA/yjbQ | acid phosphatase/phosphotransferase/UPF0047 protein YjbQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (54/48); total (55/48) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.04e-01 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CCACAAGCGGGTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAAGAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCGGCTTACT > NC_000913/4270077‑4270350
|
ccACAAGCGGGTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAatag > 2:1835309/1‑140 (MQ=255)
acaAGCGGGTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAatagag < 2:376707/140‑1 (MQ=255)
acaAGCGGGTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAatagag < 1:1787676/140‑1 (MQ=255)
aGCGGGTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGttt > 1:443997/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCa > 1:309154/1‑140 (MQ=255)
gTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCa < 2:309154/140‑1 (MQ=255)
tGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCaa > 2:1604833/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCaa > 1:1553356/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCaa > 1:1594157/1‑140 (MQ=255)
gCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAg < 1:512953/140‑1 (MQ=255)
cGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAgg < 2:817008/140‑1 (MQ=255)
cGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAgg < 1:1809918/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGa < 1:103919/140‑1 (MQ=255)
ttGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGagc < 2:1190725/140‑1 (MQ=255)
tGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGagca < 1:1835309/140‑1 (MQ=255)
ggTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGagcag < 2:1308968/140‑1 (MQ=255)
gAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGcac < 2:110493/140‑1 (MQ=255)
gagGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACAtg < 1:1649261/140‑1 (MQ=255)
agGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACAtgt < 1:507073/140‑1 (MQ=255)
gTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTgg > 1:936143/1‑140 (MQ=255)
tGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGt < 2:396822/140‑1 (MQ=255)
tGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGt < 2:1588018/140‑1 (MQ=255)
aTCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGa < 2:302763/124‑1 (MQ=255)
aTCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGa > 1:302763/1‑124 (MQ=255)
aaTTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAg > 2:1818253/1‑140 (MQ=255)
aTTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGa < 1:619666/140‑1 (MQ=255)
aGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCt > 2:1055200/1‑140 (MQ=255)
cTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCt < 2:1594157/140‑1 (MQ=255)
tGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCtt > 1:1381733/1‑140 (MQ=255)
tGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCtt > 2:88208/1‑140 (MQ=255)
tGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCtt > 1:621275/1‑140 (MQ=255)
gagCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAgcgc > 1:254756/1‑140 (MQ=255)
gCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCa > 2:409315/1‑140 (MQ=255)
cGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCaa > 1:1011879/1‑140 (MQ=255)
ggAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAAt > 2:60255/1‑140 (MQ=255)
agagCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCa > 2:1912161/1‑123 (MQ=255)
agagCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCa < 1:1912161/123‑1 (MQ=255)
agagCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAAtct > 2:1922328/1‑140 (MQ=255)
agCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCg < 1:1818253/140‑1 (MQ=255)
agCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCg < 1:1604833/140‑1 (MQ=255)
agCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCg < 1:1922328/140‑1 (MQ=255)
tGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTa < 2:1201242/123‑1 (MQ=255)
tGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTa > 1:1201242/1‑123 (MQ=255)
tGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTggg < 2:1915555/140‑1 (MQ=255)
tGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTggg > 2:1629860/1‑140 (MQ=255)
tGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTggg > 1:1205890/1‑140 (MQ=255)
cGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGt > 1:1262349/1‑140 (MQ=255)
gAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTa < 2:1328095/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTaa > 2:1938075/1‑140 (MQ=255)
aaTGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTaa > 1:39190/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAAc < 1:1055200/140‑1 (MQ=255)
tGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGAt > 1:1381027/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGAt > 1:1856493/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGAt > 2:1736419/1‑140 (MQ=255)
tttttttAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGa < 1:940051/140‑1 (MQ=255)
cacaCCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAAt > 2:720103/1‑140 (MQ=255)
acCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAg < 2:1711070/140‑1 (MQ=255)
acCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAg < 2:46705/140‑1 (MQ=255)
acCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAg < 1:409315/140‑1 (MQ=255)
cTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgct < 2:1643756/140‑1 (MQ=255)
cTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgct < 2:936143/140‑1 (MQ=255)
ttATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgctgg > 1:1857690/1‑140 (MQ=255)
ttATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgctgg < 2:39190/140‑1 (MQ=255)
ttATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgctgg > 2:1064612/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgct > 2:891024/1‑130 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAgct < 1:891024/130‑1 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 2:540330/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 1:1898685/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 1:1973893/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 2:1601152/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 2:630379/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 1:781180/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 2:1915685/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 1:909680/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 2:1386756/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 1:1039136/1‑140 (MQ=255)
tCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAAGAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATg > 1:1648703/1‑140 (MQ=255)
cGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGc < 1:1601152/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcg < 2:1898685/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcg < 2:1857690/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcg < 2:1973893/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcg > 2:1764658/1‑140 (MQ=255)
cTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcg < 2:900875/140‑1 (MQ=255)
cTGTCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcg < 2:1381733/140‑1 (MQ=255)
tCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcgcgc > 2:867110/1‑140 (MQ=255)
tCTTGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCcgcgc > 1:220367/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGCAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGt < 2:1262349/140‑1 (MQ=255)
tgctgcAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGt > 1:472372/1‑139 (MQ=255)
tgctgcAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGt < 2:472372/139‑1 (MQ=255)
ctgcAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTaa > 2:779184/1‑140 (MQ=255)
gcAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACa < 1:540330/140‑1 (MQ=255)
gcAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACa < 2:1724407/140‑1 (MQ=255)
cAAACTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACAt < 1:1064612/140‑1 (MQ=255)
aaCTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCg > 1:432950/1‑140 (MQ=255)
aaCTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCg > 2:643397/1‑140 (MQ=255)
aaCTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCg > 1:120585/1‑140 (MQ=255)
aaCTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCg > 2:1102151/1‑140 (MQ=255)
aCTGATTAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCgg < 2:254756/140‑1 (MQ=255)
tAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCGGCTTACt < 2:1205890/140‑1 (MQ=255)
tAATAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCGGCTTACt < 2:1553356/140‑1 (MQ=255)
|
CCACAAGCGGGTGCGTTTGGTGAAGAGGTGATCGTCAATTCAGAATACTGACAGAGCGGGAGAGCGTGATGCTCTCCCGAATGCTGTTTTTTTAATCACACCTTTATCCTTTCGCTGTCTTGCTGCAAACTGATTAAGAGAGTTTTATCAAGGAGCAGCACATGTGGTATCAAAAGACGCTCACGCTTAGCGCCAAATCTCGTGGGTTTCATCTGGTAACGGATGAAATTCTGAATCAGCTGGCTGATATGCCGCGCGTTAACATCGGCTTACT > NC_000913/4270077‑4270350
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
