Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
162 |
93.0 |
3098984 |
99.0% |
3067994 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,942,901 |
(T)8→7 |
intergenic (+1/+17) |
gcvB → / ← ygdI |
small regulatory RNA GcvB/DUF903 domain‑containing lipoprotein YgdI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,942,894 | 0 | T | . | 100.0%
| 399.4
/ NA
| 91 | noncoding (199/205 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (51/40); total (51/40) |
TACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTG > NC_000913/2942755‑2943029
|
tACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCt > 1:1510906/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCttt > 1:904811/1‑140 (MQ=255)
gtgATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCttttttta > 1:1261878/1‑139 (MQ=255)
tgtgttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCg > 1:631471/1‑140 (MQ=255)
gtgttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGa > 2:101594/1‑140 (MQ=255)
gtgttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGa > 1:413996/1‑140 (MQ=255)
tgttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGAt < 1:991441/140‑1 (MQ=255)
gttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATc < 2:1382148/140‑1 (MQ=255)
ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCCGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCCCCGACTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGa < 2:221898/140‑1 (MQ=255)
ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGa < 1:754975/140‑1 (MQ=255)
ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGa < 1:904399/140‑1 (MQ=255)
ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGa < 1:580077/140‑1 (MQ=255)
ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGa < 2:684323/140‑1 (MQ=255)
ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGa < 2:330059/140‑1 (MQ=255)
gttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTa < 1:438380/140‑1 (MQ=255)
gttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTa < 1:997750/140‑1 (MQ=255)
gttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTa < 1:101594/140‑1 (MQ=255)
tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTAc > 1:1492511/1‑140 (MQ=255)
tttGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTAc > 2:175686/1‑140 (MQ=255)
tGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTg > 1:1432868/1‑140 (MQ=255)
gCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGa < 2:1371237/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATc < 2:1428614/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATc > 1:868841/1‑140 (MQ=255)
ttGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCa > 2:688433/1‑140 (MQ=255)
ggTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGt < 2:1510906/140‑1 (MQ=255)
gTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGtt < 2:74846/140‑1 (MQ=255)
tGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGa < 2:644264/140‑1 (MQ=255)
cGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGAcc > 2:1274145/1‑140 (MQ=255)
cGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGAcc > 2:900643/1‑140 (MQ=255)
cAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtctc > 2:937480/1‑140 (MQ=255)
aCCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCttt < 2:1378223/140‑1 (MQ=255)
aCCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCttt < 1:858877/140‑1 (MQ=255)
cATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCa > 1:35752/1‑140 (MQ=255)
aTGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCAc < 1:1309658/140‑1 (MQ=255)
tGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACg < 2:216739/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt < 2:217765/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt < 2:1432868/140‑1 (MQ=255)
ggTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt > 1:91919/1‑140 (MQ=255)
ggTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt > 1:624484/1‑140 (MQ=255)
ggTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt > 1:474882/1‑140 (MQ=255)
tAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGTGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCa < 1:373996/140‑1 (MQ=255)
tAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCa > 1:415416/1‑140 (MQ=255)
aGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAg < 1:1092355/140‑1 (MQ=255)
cAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa > 2:331645/1‑140 (MQ=255)
aaGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACg > 1:1014017/1‑140 (MQ=255)
cTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGtt > 2:1309375/1‑140 (MQ=255)
cTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGtt > 2:910936/1‑140 (MQ=255)
cTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATc > 1:259523/1‑140 (MQ=255)
tttttCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATctg > 1:1125661/1‑140 (MQ=255)
ccTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTttgttg < 2:1125661/140‑1 (MQ=255)
ccTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTttgttg < 2:35752/140‑1 (MQ=255)
tttACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGc > 2:1540596/1‑140 (MQ=255)
tttACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGc < 1:175686/140‑1 (MQ=255)
aCCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTc > 2:1053790/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTc > 1:280084/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTc < 1:331645/140‑1 (MQ=255)
cccTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCt > 2:1215072/1‑140 (MQ=255)
cccTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCt > 2:860612/1‑140 (MQ=255)
gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTtat > 1:1292235/1‑140 (MQ=255)
gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTtat > 1:1316707/1‑140 (MQ=255)
gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTtat > 2:252350/1‑140 (MQ=255)
tctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTtata < 1:1385204/140‑1 (MQ=255)
tctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTtata > 1:688101/1‑140 (MQ=255)
tctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTtata > 1:1340665/1‑140 (MQ=255)
tgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACg > 1:685321/1‑140 (MQ=255)
gtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGa < 2:1261878/140‑1 (MQ=255)
tcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGaa > 1:1394564/1‑140 (MQ=255)
tAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCa < 2:517272/140‑1 (MQ=255)
aGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCAt > 2:893618/1‑140 (MQ=255)
aTTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCg < 1:1393/140‑1 (MQ=255)
ttAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCgg > 2:556890/1‑140 (MQ=255)
ttAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCgg > 2:767064/1‑140 (MQ=255)
ttAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCgg > 2:285991/1‑140 (MQ=255)
ttAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCgg > 1:119781/1‑140 (MQ=255)
tAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGt < 1:1329044/140‑1 (MQ=255)
tAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGt < 2:868841/140‑1 (MQ=255)
tGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATc > 2:1264154/1‑140 (MQ=255)
gTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCg < 1:603013/140‑1 (MQ=255)
aGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGtt > 2:515822/1‑140 (MQ=255)
aGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGtt > 1:413189/1‑140 (MQ=255)
cACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTAt < 2:280084/140‑1 (MQ=255)
cACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTAt > 2:1308683/1‑140 (MQ=255)
cACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATATGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTAt > 2:493676/1‑140 (MQ=255)
cccGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTTATCCAGTTCGACCATCCCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATc < 1:1416147/139‑1 (MQ=255)
gCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGt < 2:247033/140‑1 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 2:966550/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 2:954144/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 1:994571/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 1:804342/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 2:195662/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 2:84364/1‑140 (MQ=255)
ccTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTc > 2:318471/1‑140 (MQ=255)
ggTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTg < 2:1014017/140‑1 (MQ=255)
ggTGC‑TTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTg < 2:631471/140‑1 (MQ=255)
|
TACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTATACGAAATCATACCGGTATCGTTATCAGTCTGTGGTTTG > NC_000913/2942755‑2943029
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
