Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
162 |
93.0 |
3098984 |
99.0% |
3067994 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,795,090 |
T→C |
A54A (GCT→GCC) |
waaF → |
ADP‑heptose‑‑LPS heptosyltransferase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,795,090 | 0 | T | C | 98.3%
| 433.0
/ ‑1.9
| 117 | A54A (GCT→GCC) | waaF | ADP‑heptose‑‑LPS heptosyltransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (64/51); minor base A (1/1); total (65/52) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTC > NC_000913/3794954‑3795225
|
gTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTAt < 1:465512/140‑1 (MQ=255)
gTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTAt < 2:659636/140‑1 (MQ=255)
gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct > 1:556288/1‑140 (MQ=255)
gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct > 1:739755/1‑140 (MQ=255)
gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct > 1:8544/1‑140 (MQ=255)
gCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct < 2:670129/140‑1 (MQ=255)
gCGACATGATGATGTCGCAAAGCCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCct < 1:650813/140‑1 (MQ=255)
gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGTCATTCCTATGCctct < 2:732977/140‑1 (MQ=255)
gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct < 1:1137199/140‑1 (MQ=255)
gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct < 1:727868/140‑1 (MQ=255)
gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct < 2:760344/140‑1 (MQ=255)
gACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGCGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCctct > 2:27578/1‑140 (MQ=255)
tCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAgc > 2:1160281/1‑140 (MQ=255)
cAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCt > 1:1228584/1‑140 (MQ=255)
tctcTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGaaa < 1:798126/140‑1 (MQ=255)
ctctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAAt < 2:711522/140‑1 (MQ=255)
tctATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATc > 2:399393/1‑140 (MQ=255)
tATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCgg > 2:1428112/1‑140 (MQ=255)
tCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCg > 2:1534894/1‑140 (MQ=255)
gCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGaa < 2:1333865/140‑1 (MQ=255)
gCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGaa < 2:1152859/140‑1 (MQ=255)
gCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGaa < 2:779781/140‑1 (MQ=255)
cACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAc > 2:932256/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 2:190950/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 1:1012110/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 1:199822/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcg > 1:122827/1‑140 (MQ=255)
cGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgc < 2:790440/140‑1 (MQ=255)
tCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAAcgccgc > 2:1273502/1‑140 (MQ=255)
gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 1:1069454/140‑1 (MQ=255)
gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 1:280223/140‑1 (MQ=255)
gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 1:1145323/140‑1 (MQ=255)
gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 2:597614/140‑1 (MQ=255)
gcgcgcTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACt < 2:619346/140‑1 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 1:1481050/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:475384/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:512029/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:1406480/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:325126/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 1:405091/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:734474/1‑140 (MQ=255)
cTATCCCCAGACGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGCTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCCCGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTc > 2:884330/1‑140 (MQ=255)
ccccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAg < 1:802674/140‑1 (MQ=255)
cccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACCGGGTCATAGc > 2:1107770/1‑140 (MQ=255)
ccAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGcc < 2:616980/140‑1 (MQ=255)
cGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGt < 1:302457/140‑1 (MQ=255)
aTAATCGATGTGATGACACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGa > 2:650573/1‑140 (MQ=255)
tAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaa > 1:1044072/1‑140 (MQ=255)
aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa > 1:796201/1‑140 (MQ=255)
aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 1:173265/140‑1 (MQ=255)
aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 1:712911/140‑1 (MQ=255)
aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 1:1000495/140‑1 (MQ=255)
aaTCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGaaa < 2:663485/140‑1 (MQ=255)
aTGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgcgc > 2:1109187/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAgcgc < 1:589210/140‑1 (MQ=255)
gATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACg > 1:1468432/1‑140 (MQ=255)
ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAGCGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc < 1:98806/140‑1 (MQ=255)
ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc < 1:1428112/140‑1 (MQ=255)
ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc < 1:1317273/140‑1 (MQ=255)
ggCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGAcc > 2:346396/1‑140 (MQ=255)
ccGGCATGGTGCCGTCCATTATTATTGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCgcgc > 1:158332/1‑140 (MQ=255)
ccGGCATAGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCgcgc > 1:277781/1‑140 (MQ=255)
ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt < 1:1160281/140‑1 (MQ=255)
ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt < 1:140392/140‑1 (MQ=255)
ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt < 2:1010332/140‑1 (MQ=255)
ggCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCCCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCt > 1:1018979/1‑140 (MQ=255)
cATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTAc > 1:1083331/1‑140 (MQ=255)
ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGTCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc > 1:375137/1‑140 (MQ=255)
ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc < 1:234424/140‑1 (MQ=255)
ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc < 2:1539558/140‑1 (MQ=255)
ggTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTc < 1:190950/140‑1 (MQ=255)
gTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTAccc > 1:579471/1‑140 (MQ=255)
tCCATTATTATTGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa > 1:1193771/1‑140 (MQ=255)
tCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa > 2:745791/1‑140 (MQ=255)
tCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa > 1:532671/1‑140 (MQ=255)
tCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCa < 1:505855/140‑1 (MQ=255)
cagtattatCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGGGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 2:1071855/137‑1 (MQ=255)
cATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 2:250334/140‑1 (MQ=255)
cATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAAc < 2:1228584/140‑1 (MQ=255)
tatCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTc < 1:1161401/140‑1 (MQ=255)
tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa > 1:1276212/1‑140 (MQ=255)
tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa > 1:1329117/1‑140 (MQ=255)
tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa < 1:898805/140‑1 (MQ=255)
tCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCaa > 2:9499/1‑140 (MQ=255)
gcgGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAAt > 2:9732/1‑140 (MQ=255)
gcgGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAAt > 2:647284/1‑140 (MQ=255)
cgGATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATc > 2:1297089/1‑140 (MQ=255)
gATGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTg > 2:567014/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCa > 1:1182364/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCa > 1:510892/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCa > 1:260012/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCAt < 1:692671/140‑1 (MQ=255)
cGGAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTa > 1:950000/1‑140 (MQ=255)
ggAAGTTAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCGTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAg < 2:468738/140‑1 (MQ=255)
ttAACGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCt < 2:8544/140‑1 (MQ=255)
aaCGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCttt > 2:713701/1‑140 (MQ=255)
aCGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttc < 1:1351347/140‑1 (MQ=255)
cGAAGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttct > 1:1313548/1‑140 (MQ=255)
aaGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttcttc < 2:1468432/140‑1 (MQ=255)
aaGCCATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTttcttc < 1:647284/140‑1 (MQ=255)
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CTTGGGTTGGCGACATGATGATGTCGCAAAGTCTCTATCGCACGCTCCAGGCGCGCTATCCCCAGGCGATAATCGATGTGATGGCACCGGCATGGTGCCGTCCATTATTATCGCGGATGCCGGAAGTTAACGAAGCTATTCCTATGCCTCTCGGTCACGGAGCGCTGGAAATCGGCGAACGCCGCAAACTGGGTCATAGCCTGCGTGAAAAGCGCTACGACCGCGCCTACGTCTTACCCAACTCCTTCAAATCTGCATTAGTGCCTTTCTTC > NC_000913/3794954‑3795225
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
