Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F28 I1 R1
|
126 |
72.5 |
2472046 |
99.4% |
2457213 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,027,312 |
A→G |
A64A (GCA→GCG) |
ghxQ → |
guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,027,312 | 0 | A | G | 98.6%
| 252.2
/ ‑4.3
| 70 | A64A (GCA→GCG) | ghxQ | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (36/33); total (36/34) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 |
GGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGC > NC_000913/3027174‑3027445
|
ggATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAg < 2:584627/140‑1 (MQ=255)
aTAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCt > 1:322922/1‑140 (MQ=255)
aTAATTATTTTAAAATTACCGCTAGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCt < 1:994560/140‑1 (MQ=255)
ttattTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTgtgt < 2:1161233/140‑1 (MQ=255)
tttAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGtgtttgt < 1:867332/140‑1 (MQ=255)
ttAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGtgtttgtt > 2:285878/1‑140 (MQ=255)
ttAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGtgtttgtt > 2:474316/1‑140 (MQ=255)
aaaaTTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGc < 1:1211436/140‑1 (MQ=255)
aTTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCAc < 1:992070/140‑1 (MQ=255)
cGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCg < 2:301570/140‑1 (MQ=255)
cGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCg < 1:285878/140‑1 (MQ=255)
ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc > 1:69171/1‑140 (MQ=255)
ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc > 2:360710/1‑140 (MQ=255)
ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc > 1:889447/1‑140 (MQ=255)
ttCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGc < 1:360710/140‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCt < 2:322922/140‑1 (MQ=255)
cAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGTCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGtt < 2:551431/140‑1 (MQ=255)
cAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGtt > 2:384189/1‑140 (MQ=255)
cAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGtt > 2:885903/1‑140 (MQ=255)
aGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTg < 2:828134/140‑1 (MQ=255)
aGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTg < 2:399279/140‑1 (MQ=255)
aaGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCGCCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTg < 2:209908/140‑1 (MQ=255)
ctggctggCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATggg > 1:1114744/1‑140 (MQ=255)
gctggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGAtt > 1:1121761/1‑140 (MQ=255)
tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 1:398559/1‑140 (MQ=255)
tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 1:1152992/1‑140 (MQ=255)
ctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATggg > 2:999002/1‑140 (MQ=255)
cTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGc > 1:1156213/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCaa < 2:494960/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAAt > 1:1013130/1‑140 (MQ=255)
aTGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGAt < 1:999002/140‑1 (MQ=255)
tGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTaa < 2:1113197/124‑1 (MQ=255)
tGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTaa > 1:1113197/1‑124 (MQ=255)
ggTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGcc > 2:334104/1‑129 (MQ=255)
ggTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGcc < 1:334104/129‑1 (MQ=255)
ggTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTg > 1:242696/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTgg > 1:843446/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTgg > 1:793839/1‑140 (MQ=255)
tttATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTCTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGt < 2:843446/140‑1 (MQ=255)
ttATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGtt < 1:1225926/140‑1 (MQ=255)
aTTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTgc > 2:148672/1‑140 (MQ=255)
ttCCGCTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTgcg < 2:829300/140‑1 (MQ=255)
ttATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGAtt > 2:1136232/1‑140 (MQ=255)
ttATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGAtt > 2:1207352/1‑140 (MQ=255)
ttATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGAtt > 1:1102766/1‑140 (MQ=255)
tATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGAttt > 2:662028/1‑140 (MQ=255)
gtcgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCtt > 2:915156/1‑140 (MQ=255)
gtcgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCtt > 1:293543/1‑140 (MQ=255)
gtcgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCtt > 1:421923/1‑140 (MQ=255)
cgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGa < 2:1013130/140‑1 (MQ=255)
cgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGa < 1:915156/140‑1 (MQ=255)
cgtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGa < 1:662028/140‑1 (MQ=255)
gtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGAc < 2:889447/140‑1 (MQ=255)
gtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGAc < 1:885903/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACg > 2:600391/1‑140 (MQ=255)
gCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCg > 1:97741/1‑140 (MQ=255)
gCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCg > 2:431715/1‑140 (MQ=255)
ggCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCAtt > 2:587656/1‑140 (MQ=255)
ggCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCAtt < 2:793839/140‑1 (MQ=255)
ggCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCAtt < 2:1114744/140‑1 (MQ=255)
gCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTc < 2:293543/140‑1 (MQ=255)
cAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCa < 2:398559/140‑1 (MQ=255)
aGCAGGTTTTCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTc > 2:480358/1‑140 (MQ=255)
ttCCTCCCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTc > 1:481578/1‑140 (MQ=255)
tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg < 2:634229/140‑1 (MQ=255)
tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg > 1:634229/1‑140 (MQ=255)
tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg < 1:384189/140‑1 (MQ=255)
tcctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCg < 2:97741/140‑1 (MQ=255)
cctccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCgg > 2:407414/1‑140 (MQ=255)
tccCGCGGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGc < 2:481578/140‑1 (MQ=255)
|
GGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGC > NC_000913/3027174‑3027445
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
