Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F48 I1 R1
|
45 |
111.1 |
3780378 |
99.2% |
3750134 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,352,911 |
G→T |
A2S (GCA→TCA) |
ghoT → |
toxin of the GhoTS toxin‑antitoxin system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,352,911 | 0 | G | T | 100.0%
| 379.5
/ NA
| 106 | A2S (GCA→TCA) | ghoT | toxin of the GhoTS toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (31/75); total (31/75) |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTGGCCAATGAGT > NC_000913/4352774‑4353048
|
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gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCa < 2:1615100/140‑1 (MQ=255)
aaaTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTa < 2:1476923/140‑1 (MQ=255)
aaaTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTa < 1:1876307/140‑1 (MQ=255)
aGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTa > 1:266231/1‑140 (MQ=255)
aGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTa > 1:1599598/1‑140 (MQ=255)
aTTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTaaa < 1:935196/140‑1 (MQ=255)
aGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAAt < 1:1252833/140‑1 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 1:1851406/1‑140 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 2:876251/1‑140 (MQ=255)
cTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAAtttt > 2:5656/1‑140 (MQ=255)
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aaaTGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTa < 1:977522/140‑1 (MQ=255)
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cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:1851406/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt > 2:631918/1‑140 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt < 1:287431/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt > 2:1399346/1‑140 (MQ=255)
aCTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgt > 2:1637084/1‑140 (MQ=255)
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cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 1:1536253/140‑1 (MQ=255)
cTTACCGGATAGTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 2:1593769/140‑1 (MQ=255)
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ttACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtgt < 1:876251/140‑1 (MQ=255)
tACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGtgtg < 2:1520921/140‑1 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgt < 2:1405166/136‑1 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgt > 1:1405166/1‑136 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 2:1834652/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 2:1580483/1‑140 (MQ=255)
cGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAATGGTGTGAAc > 2:1315585/1‑140 (MQ=255)
gATATTTATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACat < 1:242090/140‑1 (MQ=255)
gATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACat < 1:1123826/140‑1 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 2:673808/140‑1 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 1:1465108/140‑1 (MQ=255)
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tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 2:1531871/140‑1 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 2:1599598/140‑1 (MQ=255)
gATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCtt < 2:1792097/140‑1 (MQ=255)
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tttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGt < 2:24806/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 1:391480/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 1:549446/140‑1 (MQ=255)
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aCATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTgg < 2:21695/140‑1 (MQ=255)
cAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTca > 1:43761/1‑140 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca < 2:195349/140‑1 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca > 2:799411/1‑140 (MQ=255)
gatgaCTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATga > 2:910509/1‑140 (MQ=255)
tgaCGAGTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATgaga < 2:1224391/140‑1 (MQ=255)
tttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAacac > 2:16813/1‑140 (MQ=255)
tttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAacac > 2:1749347/1‑140 (MQ=255)
ttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAAcaca < 1:294882/140‑1 (MQ=255)
ttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAAcaca < 1:1834652/140‑1 (MQ=255)
ttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAAcaca < 1:1399346/140‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 2:96993/140‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 2:1826382/140‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 1:335131/140‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 1:1611230/140‑1 (MQ=255)
gTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATAtt > 1:839313/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATAtt > 2:669448/1‑140 (MQ=255)
tACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACt < 2:1660881/140‑1 (MQ=255)
tACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACt < 1:1749347/140‑1 (MQ=255)
gTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTg < 2:1884935/140‑1 (MQ=255)
aGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCa > 1:1064325/1‑140 (MQ=255)
aGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCa > 2:1704534/1‑140 (MQ=255)
cAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTACTGCATTc < 1:791724/140‑1 (MQ=255)
aggaaggaTAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTcc < 2:19733/140‑1 (MQ=255)
aaggaTAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTgg < 2:1246694/140‑1 (MQ=255)
aaggaTAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTgg < 1:5656/140‑1 (MQ=255)
aaggaTAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTgg < 1:910509/140‑1 (MQ=255)
aggaTAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGt < 1:711902/140‑1 (MQ=255)
aTAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCgg > 1:1882535/1‑140 (MQ=255)
tAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGa < 1:1058248/140‑1 (MQ=255)
tAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGa < 1:227807/140‑1 (MQ=255)
tAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGa < 1:980297/140‑1 (MQ=255)
agaagaACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAATGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAAt < 1:1315585/140‑1 (MQ=255)
aagaaCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATaa < 1:1704534/140‑1 (MQ=255)
gaaCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAAcc < 1:965257/140‑1 (MQ=255)
aCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTTGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTg > 1:1685078/1‑140 (MQ=255)
aCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTg < 1:921165/140‑1 (MQ=255)
aCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTg < 2:42686/140‑1 (MQ=255)
aCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTg > 1:718079/1‑140 (MQ=255)
aCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTg > 1:9748/1‑140 (MQ=255)
aCATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTg > 2:103446/1‑140 (MQ=255)
cATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTgg > 1:309899/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaTGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATTACCTGGCCa < 2:1217291/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaTGTCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTGGCCa < 2:266231/140‑1 (MQ=255)
aTGTCACTATTCTCTAAAATATTAATCTTTTATGTGATTGGTGTGAACATAT‑CTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCCCATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTGGCCAATGAGt < 2:1777960/140‑1 (MQ=255)
|
GTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGAATAACCTGGCCAATGAGT > NC_000913/4352774‑4353048
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
