Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F48 I1 R1
|
62 |
147.6 |
5031800 |
99.1% |
4986513 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,169,742 |
G→A |
intergenic (‑66/‑86) |
ygiW ← / → qseB |
BOF family protein YgiW/DNA‑binding transcriptional activator QseB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,169,742 | 0 | G | A | 100.0%
| 395.2
/ NA
| 109 | intergenic (‑66/‑86) | ygiW/qseB | BOF family protein YgiW/DNA‑binding transcriptional activator QseB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (60/49); total (60/49) |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAGGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCATCA > NC_000913/3169607‑3169876
|
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ccTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGaa < 2:2392823/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAaaaata < 1:622686/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAaaaata < 1:849874/140‑1 (MQ=255)
ctgcCATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGGTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAaaaataaa > 1:1735629/1‑140 (MQ=255)
ccATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAAtt < 1:1088353/140‑1 (MQ=255)
ccATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAAtt < 1:1834675/140‑1 (MQ=255)
ccATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAAtt > 1:2107972/1‑140 (MQ=255)
ccATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAAtt < 1:1312845/140‑1 (MQ=255)
ccATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAAtt < 1:1193393/140‑1 (MQ=255)
ccATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAAtt < 1:757746/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 1:797223/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 2:1480957/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 2:538080/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 2:1556776/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 1:2476720/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa > 2:219221/1‑140 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGGCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 2:160533/140‑1 (MQ=255)
aTCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTCTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTa < 1:1999723/140‑1 (MQ=255)
aCCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTg < 1:411701/140‑1 (MQ=255)
ccGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGc < 1:2451965/140‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCt < 2:172210/140‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCt < 2:1562227/140‑1 (MQ=255)
tGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACagag < 1:1825799/140‑1 (MQ=255)
cacaGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAgcg > 1:1976641/1‑140 (MQ=255)
cacaGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAgcg < 1:2157746/140‑1 (MQ=255)
cacaGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAgcg > 1:1300444/1‑140 (MQ=255)
ggCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTa > 1:1754735/1‑140 (MQ=255)
ggCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTa < 1:2482579/140‑1 (MQ=255)
ggCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTa > 2:441674/1‑140 (MQ=255)
cATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGGTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTacaa > 2:655181/1‑140 (MQ=255)
aTTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTacaac < 1:219839/140‑1 (MQ=255)
ttACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTacaaca > 2:2333807/1‑140 (MQ=255)
ttACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTacaaca > 1:1147195/1‑140 (MQ=255)
ttACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTacaaca > 1:1314762/1‑140 (MQ=255)
ttACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTATCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTacaaca > 2:1762427/1‑140 (MQ=255)
gCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGtt > 1:2143259/1‑140 (MQ=255)
gCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGtt > 2:2226570/1‑140 (MQ=255)
gCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGtt > 1:352507/1‑140 (MQ=255)
cGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGttt > 2:2488313/1‑140 (MQ=255)
aTTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTAc > 1:97043/1‑140 (MQ=255)
ttACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACt < 1:1819885/140‑1 (MQ=255)
aCTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTgg > 2:2294103/1‑140 (MQ=255)
tgctgcGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGgca < 1:596214/140‑1 (MQ=255)
gctgcGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGgcag > 1:1308571/1‑140 (MQ=255)
gctgcGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGgcag < 2:2230379/140‑1 (MQ=255)
cGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCaaa < 2:1314762/140‑1 (MQ=255)
cGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCaaa > 2:2228252/1‑140 (MQ=255)
gAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAAt < 2:1662802/140‑1 (MQ=255)
gAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAAt < 2:1880674/140‑1 (MQ=255)
tttttCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACgg < 1:2488313/140‑1 (MQ=255)
aTGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCg < 2:1300444/140‑1 (MQ=255)
aTGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCg < 2:1247283/140‑1 (MQ=255)
tCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaa > 1:1584885/1‑140 (MQ=255)
cccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaa > 2:1935825/1‑140 (MQ=255)
cccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaa > 2:1139193/1‑140 (MQ=255)
cccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaa > 2:186894/1‑140 (MQ=255)
ccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaaa > 2:22848/1‑140 (MQ=255)
ccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaaa > 1:2475612/1‑140 (MQ=255)
ccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaaa > 1:1546892/1‑140 (MQ=255)
ccTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGaaaaa > 1:2102693/1‑140 (MQ=255)
tttAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAAt > 2:162946/1‑140 (MQ=255)
tttAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAAt > 2:2151281/1‑140 (MQ=255)
gTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAAt > 1:2373213/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCTCAGGGATGAAAAAATGCGAAttt > 2:1498434/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAAttt > 1:1814360/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAAttt > 2:1163147/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAAttt > 2:2483916/1‑140 (MQ=255)
tGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAAtttt > 2:1066971/1‑140 (MQ=255)
tGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAAtttt > 2:2078397/1‑140 (MQ=255)
gTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTa > 2:1304420/1‑140 (MQ=255)
gTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTa < 2:1831696/140‑1 (MQ=255)
ccGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGa < 1:2125423/140‑1 (MQ=255)
ccGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGa < 2:2475612/140‑1 (MQ=255)
gCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATaga < 2:1735629/140‑1 (MQ=255)
gCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATaga < 1:1066971/140‑1 (MQ=255)
ttAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGAt < 1:2294103/140‑1 (MQ=255)
tAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATg < 2:1875004/140‑1 (MQ=255)
tAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATg < 1:2483916/140‑1 (MQ=255)
aCAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGAc < 1:162946/140‑1 (MQ=255)
aCAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGAc < 1:553728/140‑1 (MQ=255)
aTAGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTAGAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCt > 2:79543/1‑140 (MQ=255)
aGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATa < 2:1955903/124‑1 (MQ=255)
aGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATa > 1:1955903/1‑124 (MQ=255)
aGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTgt > 2:2302116/1‑139 (MQ=255)
aGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGa > 1:1871992/1‑140 (MQ=255)
aGTCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGa > 2:2473701/1‑140 (MQ=255)
tCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGAtt > 2:1043773/1‑140 (MQ=255)
tCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGAtt > 2:579485/1‑140 (MQ=255)
tCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGAtt > 1:564590/1‑140 (MQ=255)
tCCTTAACAACTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGAtt > 1:2298875/1‑140 (MQ=255)
aacaacTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGa > 1:1557712/1‑140 (MQ=255)
aacaacTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGa > 1:55858/1‑140 (MQ=255)
aacaacTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGa < 2:1814360/140‑1 (MQ=255)
aacaacTTCTTAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGa > 1:1157538/1‑140 (MQ=255)
cttcttAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCa > 1:1437221/1‑140 (MQ=255)
cttcttAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCa > 1:54047/1‑140 (MQ=255)
tcttAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCATc > 2:1032554/1‑140 (MQ=255)
cttAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCATCa > 2:2029199/1‑140 (MQ=255)
cttAAAGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCATCa > 2:451813/1‑140 (MQ=255)
|
CCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAGGGCCATTACTGCGATTACTGCTGCGAATTTTTTCATGTTTATTACTCCCTTTAATGTCTGTTTCCGAGCATTTAACAAGATAGTCCTTAACAACTTCTTAAGGGAAAAAAATAAAATTTAGTGCTGTACAGAGCGCGTTACAACACGGTTTACTGGCAGCAAATACGGTTATCGCAGGGATGAAAAAATGCGAATTTTACTGATAGAAGATGACATGCTGATTGGCGACGGCATCA > NC_000913/3169607‑3169876
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
