Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F48 I1 R1
|
62 |
147.6 |
5031800 |
99.1% |
4986513 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,185,169 |
C→A |
intergenic (+39/‑245) |
ubiK → / → ygiL |
ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiK/putative fimbrial protein YgiL |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,185,169 | 0 | C | A | 100.0%
| 487.5
/ NA
| 134 | intergenic (+39/‑245) | ubiK/ygiL | ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiK/putative fimbrial protein YgiL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (73/61); total (73/61) |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCCTCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATAAACTA > NC_000913/3185035‑3185305
|
cTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTaa > 1:776297/1‑140 (MQ=255)
ggCGCTGCTTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAAtt > 2:832934/1‑140 (MQ=255)
ggCGCTGCTTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAAtt > 1:1283081/1‑140 (MQ=255)
gctgctTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTtat < 1:320276/140‑1 (MQ=255)
ctgctTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTtata < 1:1375590/140‑1 (MQ=255)
tgctTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAg < 2:1604607/140‑1 (MQ=255)
ctTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTg < 1:1225483/140‑1 (MQ=255)
ctTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTg < 1:927255/140‑1 (MQ=255)
ttGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGc < 1:2001906/140‑1 (MQ=255)
ttGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGc < 2:2116255/140‑1 (MQ=255)
ttGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGc < 2:2065753/140‑1 (MQ=255)
ttGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGc < 2:776297/140‑1 (MQ=255)
ttGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACACTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGc < 2:710706/140‑1 (MQ=255)
ttGAACAAAGAATCAGCGAAATGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGc < 2:1846600/140‑1 (MQ=255)
tGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCt < 2:1642777/140‑1 (MQ=255)
tGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCt < 1:1147127/140‑1 (MQ=255)
tGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCt < 1:200458/140‑1 (MQ=255)
aaaaGAATCAACGAACTGGAAAATCGCAATACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCt < 1:118125/139‑1 (MQ=255)
aaaGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTa < 2:193402/140‑1 (MQ=255)
aTCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTAcc < 2:1189005/140‑1 (MQ=255)
cAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCtt > 2:281381/1‑140 (MQ=255)
aGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTa < 1:452377/140‑1 (MQ=255)
aGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTa < 1:2157855/140‑1 (MQ=255)
aaCTGGAAAATCGCAGTACTGAGATC‑AAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTGAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATcgcg < 1:1386045/140‑1 (MQ=255)
aCTGGAAAATCGCAGTACTGAAATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCGCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATAAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATcgcg < 2:1108445/140‑1 (MQ=255)
aTCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCa < 2:1305833/140‑1 (MQ=255)
gTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGa > 2:744366/1‑140 (MQ=255)
tGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAAc < 2:2241649/140‑1 (MQ=255)
agaTCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCa > 2:1567743/1‑140 (MQ=255)
agaTCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCa > 1:1402761/1‑140 (MQ=255)
agaTCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCa > 2:1726143/1‑140 (MQ=255)
aTCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATc > 2:1085775/1‑140 (MQ=255)
tCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATGCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATca > 1:2102424/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATcaca > 1:1446090/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATcaca > 1:1972706/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATcaca > 2:2473239/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATcaca > 1:1898938/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATcac < 2:280983/139‑1 (MQ=255)
aaaaaGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATcac > 1:280983/1‑139 (MQ=255)
caaGCAGACAGAGGCAGAGACTCTCCACCCAACGCTGTGAACATACGGCTTTATTGGCCGGTAAATTATGATTTAAGCATCTAATTTGTAGGACTTTCTCTTAACTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACaaa > 2:2365520/2‑140 (MQ=255)
agcagcCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACaaaaa > 2:1710210/1‑140 (MQ=255)
agcCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAaatga > 1:80660/1‑140 (MQ=255)
agcCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAaatga > 2:535427/1‑140 (MQ=255)
ccAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAaacgaat > 1:2126454/1‑140 (MQ=255)
gATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAg < 2:531006/140‑1 (MQ=255)
tCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTa < 2:1496864/140‑1 (MQ=255)
agaCTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAAtt < 1:1900016/140‑1 (MQ=255)
agaCTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAAtt < 1:1297834/140‑1 (MQ=255)
agaCTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAAtt < 2:767678/140‑1 (MQ=255)
agaCTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAAtt < 1:1710210/140‑1 (MQ=255)
gaCTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTg < 1:1178750/140‑1 (MQ=255)
aCTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGa < 1:1085775/140‑1 (MQ=255)
ctctCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGaa < 1:2473239/140‑1 (MQ=255)
tctcCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGaaa > 2:1782797/1‑140 (MQ=255)
tctcCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGaaa > 1:86808/1‑140 (MQ=255)
ctcCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAg < 2:2294707/140‑1 (MQ=255)
tcCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGt > 2:62145/1‑140 (MQ=255)
tcCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGt > 2:642244/1‑140 (MQ=255)
tcCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGt > 2:1572168/1‑140 (MQ=255)
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cAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAAtt > 1:1316299/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGc > 2:1590179/1‑140 (MQ=255)
tGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAAtt > 2:1136008/1‑139 (MQ=255)
tGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATg > 2:1719265/1‑140 (MQ=255)
tGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATg < 1:1726143/140‑1 (MQ=255)
gTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGt < 2:2058332/140‑1 (MQ=255)
tAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTa > 1:2148156/1‑140 (MQ=255)
tAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTa > 1:293554/1‑140 (MQ=255)
aTTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTAttttt > 1:106200/1‑140 (MQ=255)
tCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTa > 1:441961/1‑140 (MQ=255)
cGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTaa > 1:1496387/1‑140 (MQ=255)
gTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAg < 1:1436003/140‑1 (MQ=255)
gTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAg < 1:1123124/140‑1 (MQ=255)
tCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGt < 2:140041/140‑1 (MQ=255)
aTGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACt < 1:1774347/140‑1 (MQ=255)
tGCACTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACtt > 2:849262/1‑140 (MQ=255)
aCTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAAt < 1:2091705/140‑1 (MQ=255)
cTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATc < 2:441961/140‑1 (MQ=255)
cTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATc < 2:1283081/140‑1 (MQ=255)
cTGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATc < 2:1837101/140‑1 (MQ=255)
atGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATc < 2:1485635/139‑1 (MQ=255)
tGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAA‑GAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATc > 2:905284/1‑138 (MQ=255)
tGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAA‑GAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATc < 1:905284/138‑1 (MQ=255)
tGTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATACAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCg > 2:95260/1‑140 (MQ=255)
gTAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGa > 1:2439756/1‑140 (MQ=255)
tAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGat > 1:1260952/1‑140 (MQ=255)
tAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGat > 2:971060/1‑140 (MQ=255)
tAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGat > 1:71420/1‑140 (MQ=255)
tAAATTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGat > 2:1471666/1‑140 (MQ=255)
aaaTTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGata < 1:1590179/140‑1 (MQ=255)
aTTATGAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATAtt < 2:293554/140‑1 (MQ=255)
gAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGAt > 1:1653800/1‑140 (MQ=255)
gAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGAt > 1:3888/1‑140 (MQ=255)
gAATTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGAt > 2:2098705/1‑140 (MQ=255)
aTTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGTGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATaa > 2:2423297/1‑140 (MQ=255)
aTTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATaa > 2:40775/1‑140 (MQ=255)
aTTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATaa > 1:2147921/1‑140 (MQ=255)
aTTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATaa > 1:1191311/1‑140 (MQ=255)
aTTAATCATCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATaa > 2:1412890/1‑140 (MQ=255)
atcatcTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATAAACTa > 2:250733/1‑140 (MQ=255)
|
CTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATCAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATCAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCTCCCCCCAACGCTGTAAACATTCGTCTTTAATGCACTGTAAATTATGAATTAATCCTCTAATTTATAGTGCTTTCTATTACCTTATCGCGTAATCCCATTCAGAAAACCATCACAAAAATGAATGAGTACAATTGAAAGTATAATTGCAATGTATTTTTTAAGTTTTACTTAATCGATATTTAGATAAACTA > NC_000913/3185035‑3185305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
