Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A14 F48 I1 R1
|
75 |
141.5 |
4784044 |
99.1% |
4740987 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,895,005 |
G→T |
M118I (ATG→ATT) |
yieF → |
chromate reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,895,005 | 0 | G | T | 99.2%
| 465.0
/ ‑4.4
| 132 | M118I (ATG→ATT) | yieF | chromate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (70/61); minor base C (1/0); total (71/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGTGA > NC_000913/3894872‑3895141
|
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tgtgGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTg < 2:2297449/140‑1 (MQ=255)
tggtgATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTggc > 2:1352925/1‑140 (MQ=255)
gATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGgcggcg < 2:84266/140‑1 (MQ=255)
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cGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGgcgcgc > 1:2150325/1‑140 (MQ=255)
gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGTCGgcgcgcg > 1:550258/1‑140 (MQ=255)
gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGgcgcgcg < 2:1036412/140‑1 (MQ=255)
gTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGgcgcgcg > 2:2150973/1‑140 (MQ=255)
tCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGgcgcgcgc < 1:1607209/140‑1 (MQ=255)
cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt > 1:1312612/1‑140 (MQ=255)
cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt > 2:1823109/1‑140 (MQ=255)
cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCt > 2:751397/1‑140 (MQ=255)
aCGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTg < 2:2377316/140‑1 (MQ=255)
cGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGG‑‑GGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCa < 2:70984/140‑1 (MQ=255)
ggAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGt < 1:10778/140‑1 (MQ=255)
atatAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATc > 2:1179385/1‑140 (MQ=255)
atatAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATc > 2:1608550/1‑140 (MQ=255)
aaCTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCt < 1:1179385/140‑1 (MQ=255)
aaCTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCt < 1:1608550/140‑1 (MQ=255)
aaCTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCt > 2:1176925/1‑140 (MQ=255)
ctactCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTgc > 2:2365975/1‑140 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:658845/1‑140 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:2371968/1‑140 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:682902/1‑140 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc < 1:1176925/140‑1 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:1357957/1‑140 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc < 1:1252771/140‑1 (MQ=255)
ctCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTATCAGTATCACCTGCGcc > 1:146739/1‑140 (MQ=255)
ctCGGTAACGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGcc > 1:1564602/1‑140 (MQ=255)
cGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAg > 1:106353/1‑140 (MQ=255)
cGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGACTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAg > 1:1786268/1‑140 (MQ=255)
gTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAt > 1:52869/1‑140 (MQ=255)
gTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAt < 2:783638/140‑1 (MQ=255)
tACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAtt > 1:2275132/1‑140 (MQ=255)
tACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAtt > 1:167839/1‑140 (MQ=255)
cGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAtt > 1:1246273/1‑137 (MQ=255)
cGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAtt < 2:1246273/137‑1 (MQ=255)
cGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTg > 1:1011026/1‑140 (MQ=255)
cGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTg > 2:1432802/1‑140 (MQ=255)
ggTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGTCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGt > 2:1664937/1‑140 (MQ=255)
gTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGtt > 1:187949/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:2235437/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 1:1192289/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 1:59170/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:2051088/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:1508923/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:536850/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 1:2171942/1‑140 (MQ=255)
gCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTcc > 2:2171689/1‑140 (MQ=255)
cTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCt < 1:436294/140‑1 (MQ=255)
cTGAAAAATGCAATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCt < 1:581359/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGa < 1:1678316/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTTCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATg > 2:298578/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATg < 1:1993632/140‑1 (MQ=255)
aaaTGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATg < 2:1222186/140‑1 (MQ=255)
tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa < 2:167839/140‑1 (MQ=255)
tGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCaa < 1:244927/140‑1 (MQ=255)
ccATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATg < 2:52869/140‑1 (MQ=255)
tCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGtg > 2:1018872/1‑140 (MQ=255)
tCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGAGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGtg > 1:625577/1‑140 (MQ=255)
tGGCTTTCCAGGCTGCCGGATCAACAGCTGGCCGGTAAACAGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGaa < 1:2250439/140‑1 (MQ=255)
ttCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGc < 2:550258/140‑1 (MQ=255)
tCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGcc > 2:374419/1‑140 (MQ=255)
cccGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCg > 1:857145/1‑140 (MQ=255)
ctgCCTGCCGGATCACCCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCgg < 2:1714295/138‑1 (MQ=255)
gATCAACCGCTGGGCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCGCCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATggg < 1:1360064/140‑1 (MQ=255)
gATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTTCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATggg < 1:2150973/140‑1 (MQ=255)
gATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATggg < 2:87539/140‑1 (MQ=255)
gATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATggg < 1:2235437/140‑1 (MQ=255)
tCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGggcg < 2:2243849/140‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGtt > 2:593977/1‑139 (MQ=255)
gCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTgt > 2:1965979/1‑139 (MQ=255)
tGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 1:2365975/140‑1 (MQ=255)
tGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:187949/140‑1 (MQ=255)
tGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 2:1357957/140‑1 (MQ=255)
tGGCCGGTAAACCGGTATTGATCCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCCCCGGCGCCAGATTCTGGTTTGCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCGGGAATTTATGGGCGGCGTGAtt < 1:489230/140‑1 (MQ=255)
ggCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCAGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTc > 2:1426789/1‑140 (MQ=255)
ggTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGaa < 1:1823109/140‑1 (MQ=255)
tGATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCg < 2:401781/140‑1 (MQ=255)
gATTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGc > 1:2153278/1‑140 (MQ=255)
aTTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCa < 1:822158/140‑1 (MQ=255)
aTTCAGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCa < 1:374419/140‑1 (MQ=255)
aGACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAAcc > 2:2101627/1‑140 (MQ=255)
gACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCg > 2:593849/1‑140 (MQ=255)
gACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCg < 1:1818233/140‑1 (MQ=255)
gACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCg > 1:792543/1‑140 (MQ=255)
gACCAGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTAACACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCg > 1:1917309/1‑140 (MQ=255)
aGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGgaga < 2:2274359/140‑1 (MQ=255)
aGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGgaga < 2:1908383/140‑1 (MQ=255)
aGCTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGgaga < 2:596523/140‑1 (MQ=255)
cTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAg > 2:1148575/1‑140 (MQ=255)
cTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAg > 1:1698322/1‑140 (MQ=255)
cTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAg > 2:1350278/1‑140 (MQ=255)
cTCAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAg > 2:1687941/1‑140 (MQ=255)
cAATTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGtg < 2:857145/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGtga < 1:1029224/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGtga < 2:1244741/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGtga < 2:2010299/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGtga < 2:1564602/140‑1 (MQ=255)
|
ACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTTCCTCGATGCAATGGTGATGAACAAGCCGGAATTTATGGGCGGCGTGATTCAGAACAAAGTTGATCCGCAAACCGGAGAAGTGA > NC_000913/3894872‑3895141
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
