Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A15 F48 I1 R1
|
115 |
87.5 |
3003888 |
99.1% |
2976853 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,546,487 |
C→T |
intergenic (+288/‑72) |
nfuA → / → gntT |
iron‑sulfur cluster carrier protein NfuA/high‑affinity gluconate transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,546,487 | 0 | C | T | 100.0%
| 348.9
/ NA
| 96 | intergenic (+288/‑72) | nfuA/gntT | iron‑sulfur cluster carrier protein NfuA/high‑affinity gluconate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (48/48); total (48/48) |
TTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATCCGCTT > NC_000913/3546352‑3546617
|
ttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGAt < 2:375657/140‑1 (MQ=255)
ttaCCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGAt < 1:291459/140‑1 (MQ=255)
taCCCCGCTTTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGAtt < 1:492880/140‑1 (MQ=255)
cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTggg < 1:1008326/140‑1 (MQ=255)
cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTggg < 1:314184/140‑1 (MQ=255)
cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTggg > 1:1326679/1‑140 (MQ=255)
cccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTggg < 2:160073/140‑1 (MQ=255)
ccGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGa < 1:429301/140‑1 (MQ=255)
gATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGt < 2:1200795/140‑1 (MQ=255)
tctcAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGtttt > 2:827692/1‑139 (MQ=255)
cAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcg > 2:1234421/1‑140 (MQ=255)
aaCGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcgtc > 2:949054/1‑140 (MQ=255)
aaCGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTgtcgtc < 2:1245852/140‑1 (MQ=255)
aCGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCa < 1:949054/140‑1 (MQ=255)
tGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTg < 1:5472/140‑1 (MQ=255)
tACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAAAATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACg < 2:660525/140‑1 (MQ=255)
aCCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGt > 2:885722/1‑140 (MQ=255)
gTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTAcc < 1:720998/140‑1 (MQ=255)
aTCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGCGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCa > 2:1331420/1‑140 (MQ=255)
tCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCAt > 1:352960/1‑140 (MQ=255)
tCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCAt < 1:691622/140‑1 (MQ=255)
tCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCAt < 1:1355401/140‑1 (MQ=255)
ttCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAAc < 1:1102111/140‑1 (MQ=255)
aTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATg > 2:1147708/1‑140 (MQ=255)
aTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATg < 2:168243/140‑1 (MQ=255)
aTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATg < 1:1234421/140‑1 (MQ=255)
aTGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATg > 1:82499/1‑140 (MQ=255)
tGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGa < 2:1326679/140‑1 (MQ=255)
tGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGa < 1:1147708/140‑1 (MQ=255)
ggTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGaaa > 2:1147401/1‑140 (MQ=255)
ggTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGaaa > 2:781330/1‑140 (MQ=255)
ggTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGaaa > 1:1065230/1‑140 (MQ=255)
gTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAg > 1:763859/1‑140 (MQ=255)
gTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTCAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAg < 2:771631/140‑1 (MQ=255)
tACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAgg < 2:277119/140‑1 (MQ=255)
aCCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGc < 2:82499/140‑1 (MQ=255)
cAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCa > 1:864602/1‑140 (MQ=255)
aaCATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAgg > 1:1370231/1‑140 (MQ=255)
aCATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGt < 1:852684/140‑1 (MQ=255)
cATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTa > 2:505928/1‑140 (MQ=255)
aTACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTaa < 1:1249418/140‑1 (MQ=255)
aCTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAAt > 2:721358/1‑140 (MQ=255)
tCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCa < 2:352960/140‑1 (MQ=255)
ccTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCAt > 2:1494245/1‑140 (MQ=255)
ccTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCAt > 2:821009/1‑140 (MQ=255)
gACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGcc > 2:1338144/1‑140 (MQ=255)
aCATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCa < 2:864602/140‑1 (MQ=255)
aCATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCa > 1:1222778/1‑140 (MQ=255)
aCATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCa < 2:436804/140‑1 (MQ=255)
aCATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCa > 2:599730/1‑140 (MQ=255)
cATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCAt > 1:129026/1‑140 (MQ=255)
cATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCAt > 1:1199411/1‑140 (MQ=255)
cTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAg > 1:397038/1‑140 (MQ=255)
tGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAG‑TTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTc > 1:488395/1‑140 (MQ=255)
gACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTc < 1:821009/140‑1 (MQ=255)
aCTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCa < 1:885722/140‑1 (MQ=255)
aCTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTACCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCa > 2:1270424/1‑140 (MQ=255)
aCAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAttt > 2:25321/1‑139 (MQ=255)
aCAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAttg < 1:1269386/140‑1 (MQ=255)
aataatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAttgtt > 1:195786/1‑140 (MQ=255)
aataatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAttgtt > 2:1397600/1‑140 (MQ=255)
aataatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCAttgtt > 2:158381/1‑140 (MQ=255)
taatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGc > 1:759781/1‑140 (MQ=255)
taatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGc > 1:844062/1‑140 (MQ=255)
aatTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCt > 2:792614/1‑140 (MQ=255)
atTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTa < 2:1065230/140‑1 (MQ=255)
ttAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTAt < 2:704725/140‑1 (MQ=255)
ttAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTAt > 2:1376216/1‑140 (MQ=255)
ttAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTAt < 1:1242954/140‑1 (MQ=255)
ttAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTAGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTAt > 2:1486788/1‑140 (MQ=255)
atAGTTATAGTGGGTATCAATAGTAGTGCCGCAAAATCCGTGTACGCGAGTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTGAGCATAACAAATGGAAGGCCATGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTaa < 2:377449/139‑2 (MQ=255)
gTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCgg < 2:763859/140‑1 (MQ=255)
ttttAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGgt > 2:68379/1‑140 (MQ=255)
tttAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGgtg > 2:1407380/1‑140 (MQ=255)
aGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTaa > 2:672472/1‑140 (MQ=255)
aGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTaa > 2:1311862/1‑140 (MQ=255)
aGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTaa > 1:1231088/1‑140 (MQ=255)
aGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTaa < 2:1055788/140‑1 (MQ=255)
gTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAAt > 1:671461/1‑140 (MQ=255)
tGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATc < 1:827692/140‑1 (MQ=255)
gggTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCt < 2:1222778/140‑1 (MQ=255)
gggTATCAGTCGTGGTACCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCt < 1:1270424/140‑1 (MQ=255)
ggTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCtt < 2:112470/140‑1 (MQ=255)
cAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgttgt < 1:1464903/140‑1 (MQ=255)
cAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgttgt < 1:82294/140‑1 (MQ=255)
aGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgttgtt < 1:1147401/140‑1 (MQ=255)
gTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCttgttgttg < 2:671461/140‑1 (MQ=255)
tCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGc < 2:1231088/140‑1 (MQ=255)
gtggtgCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTc > 2:59932/1‑140 (MQ=255)
tggtgCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTcc > 2:1273684/1‑140 (MQ=255)
tggtgCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTcc > 1:539145/1‑140 (MQ=255)
gtgCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCtg > 1:605109/1‑140 (MQ=255)
tgCCGCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCtgt > 2:593186/1‑139 (MQ=255)
gCAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTgatgat < 1:68379/140‑1 (MQ=255)
cAATATCTCTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATc < 1:1376216/140‑1 (MQ=255)
tctcTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATCCGCtt < 1:1331420/140‑1 (MQ=255)
tctcTGTTCTCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATCCGCtt > 1:201108/1‑140 (MQ=255)
|
TTACCCCGCTCTGGTGATTCTCAAACGCCAGATGTTACCCGTATCATTCACATGGGTACCAAACATACTCCTGACATCTGACTACAATAATTAGTTTTAGTGGGTATCAGTCGTGGTGCCGCAATATCTCTGTTCCCGATTGGGATAATTAGAGTTTGTCGTCAGAAAATTGACGTTACCCATAACAAATGAAAGGCCAGGTAAATCATGCCATTAGTCATTGTTGCTATCGGTGTAATCTTGTTGTTGCTCCTGATGATCCGCTT > NC_000913/3546352‑3546617
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
