Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,905,665 |
G→T |
D37Y (GAT→TAT) |
yqcG → |
cell envelope stress response protein YqcG |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,905,665 | 0 | G | T | 98.8%
| 569.7
/ ‑0.9
| 168 | D37Y (GAT→TAT) | yqcG | cell envelope stress response protein YqcG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (72/94); total (72/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.76e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCGATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGG > NC_000913/2905532‑2905801
|
taataaTTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATgccg > 2:675478/1‑140 (MQ=255)
aataatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATgccgc < 2:903515/140‑1 (MQ=255)
ataatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATgccgcc > 1:1967165/1‑140 (MQ=255)
ataatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATgccgcc < 1:1233098/140‑1 (MQ=255)
ataatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATgccgcc < 1:1284561/140‑1 (MQ=255)
ataatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATgccgcc > 2:1419079/1‑140 (MQ=255)
taatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGccgccg > 1:1869112/1‑140 (MQ=255)
aatTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGt < 1:258104/140‑1 (MQ=255)
atTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTc < 1:1276703/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCa < 2:1714879/140‑1 (MQ=255)
tAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCaa < 2:1676757/140‑1 (MQ=255)
tAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCaa > 1:22237/1‑140 (MQ=255)
aaGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAatt > 2:57735/1‑140 (MQ=255)
ggAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAatttat < 1:2084493/140‑1 (MQ=255)
aGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCGatttattt > 2:611032/1‑140 (MQ=255)
aGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAatttattt > 2:378843/1‑140 (MQ=255)
aGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAatttattt > 2:853319/1‑140 (MQ=255)
aGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAatttattt > 2:1380563/1‑140 (MQ=255)
aGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGAAAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAatttattt > 2:790297/1‑140 (MQ=255)
gTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAAtttattta > 2:470649/1‑140 (MQ=255)
tAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATttatttat > 1:1041590/1‑140 (MQ=255)
tAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATttatttat > 1:2067235/1‑140 (MQ=255)
tAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATttatttat > 1:950542/1‑140 (MQ=255)
tAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATttatttat < 2:156424/140‑1 (MQ=255)
aaCGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATc < 2:547939/140‑1 (MQ=255)
ttatGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGAtt > 2:1200860/1‑140 (MQ=255)
tatGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGAttt > 1:487719/1‑140 (MQ=255)
tatGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGAttt > 2:11238/1‑140 (MQ=255)
tatGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGAttt > 1:1625847/1‑140 (MQ=255)
tatGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGAttt > 1:342145/1‑140 (MQ=255)
tatGTCAGAAGAAAATAAAGAAAACGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGAttt > 2:858209/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTaa > 2:1308677/1‑140 (MQ=255)
cAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATga < 2:1459462/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGAAAATAAAGAAAACGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATga < 1:858209/140‑1 (MQ=255)
agaagaAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATgag > 2:1434906/1‑140 (MQ=255)
aagaaAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGaa > 2:1425635/1‑140 (MQ=255)
aagaaAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGaa > 1:1835321/1‑140 (MQ=255)
agaaAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGaaa > 2:1505664/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTta < 1:154988/140‑1 (MQ=255)
tAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTtata < 1:1419079/140‑1 (MQ=255)
aaaGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTTCCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATaa < 2:1004645/140‑1 (MQ=255)
aGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATg < 1:1925804/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 1:1582143/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 2:22575/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 1:1425635/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 1:675478/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 1:755777/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 2:1608061/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 1:1371543/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCAACAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATgcg < 2:754032/140‑1 (MQ=255)
aTGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTa < 1:1818574/140‑1 (MQ=255)
ggATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTAtt < 1:1434906/140‑1 (MQ=255)
ggATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTAtt < 1:1957212/140‑1 (MQ=255)
ggATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTAtt < 2:1134462/140‑1 (MQ=255)
tCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTa < 2:418544/140‑1 (MQ=255)
acATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTa < 1:789898/139‑1 (MQ=255)
gTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGt > 1:1480668/1‑140 (MQ=255)
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aaCATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCa < 1:470012/138‑1 (MQ=255)
aaCATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACt < 2:342145/140‑1 (MQ=255)
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aCATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACtt < 2:22237/140‑1 (MQ=255)
aTTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTTATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTc < 1:378843/140‑1 (MQ=255)
cACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTa < 1:594854/140‑1 (MQ=255)
cACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTa < 2:108666/140‑1 (MQ=255)
atataTTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCtt < 2:599534/139‑1 (MQ=255)
tatttattTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTttgt > 1:1630335/1‑140 (MQ=255)
tttatttTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTttgttg > 2:1901202/1‑140 (MQ=255)
tttatttTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTttgttg > 2:1301493/1‑140 (MQ=255)
atttTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAg < 1:468698/140‑1 (MQ=255)
atttTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAg > 2:2035472/1‑140 (MQ=255)
atttTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAg < 1:1637999/140‑1 (MQ=255)
atttTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAg < 2:657699/140‑1 (MQ=255)
tttttCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGcc < 1:1509654/140‑1 (MQ=255)
tttttCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGcc < 1:647770/140‑1 (MQ=255)
tttCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCcca < 2:1259335/140‑1 (MQ=255)
cTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCccaacc < 2:1351646/140‑1 (MQ=255)
tATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCcaaccaac < 2:1664746/140‑1 (MQ=255)
tATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCcaaccaac < 2:2081698/140‑1 (MQ=255)
tAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTAt < 1:611032/140‑1 (MQ=255)
gTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTg > 1:102692/1‑140 (MQ=255)
tttAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGTGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTcc < 2:1279350/140‑1 (MQ=255)
tttAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTcc > 2:52725/1‑140 (MQ=255)
tttAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTcc < 2:1835321/140‑1 (MQ=255)
tAATGATAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCca > 2:314382/1‑140 (MQ=255)
aTAACGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAAtt < 2:1891588/140‑1 (MQ=255)
aaCGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTAc < 1:1077869/140‑1 (MQ=255)
cGAATATAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAg > 2:1472890/1‑140 (MQ=255)
aaTATAAAATTCCCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGGGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCATTTGTTGCAGCCGAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGca < 1:2024541/140‑1 (MQ=255)
atatAAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGcaa < 1:314382/140‑1 (MQ=255)
aataAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGcaac < 2:950542/139‑1 (MQ=255)
aataAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGcaac < 2:1869112/139‑1 (MQ=255)
taAAATTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGcaacaa > 1:258951/1‑140 (MQ=255)
aaaTTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGt < 1:1134640/140‑1 (MQ=255)
aTTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTa < 2:746809/140‑1 (MQ=255)
aTTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTa < 1:11238/140‑1 (MQ=255)
aTTACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTa < 1:590870/140‑1 (MQ=255)
tACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTTCAGCAACAAGTTACg < 1:389212/140‑1 (MQ=255)
tACCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACg < 1:1669623/140‑1 (MQ=255)
aCCTATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACgg > 1:558083/1‑140 (MQ=255)
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TAATAATTAAAGGGAGTAACGTATTATGTCAGAAGAAAATAAAGAAAATGGATTTAATCATGTCAAAACATTCACCAAAATTATATTTATTTTTTCTGTATTAGTTTTTAATGATAACGAATATAAAATTACCGATGCCGCCGTCAATTTATTTATCCAGATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGG > NC_000913/2905532‑2905801
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
