Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,118,935 |
G→C |
P60A (CCT→GCT) |
yghJ ← |
putative lipoprotein YghJ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,118,935 | 0 | G | C | 100.0%
| 408.8
/ NA
| 104 | P60A (CCT→GCT) | yghJ | putative lipoprotein YghJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (53/51); total (53/51) |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGTTGCGCTCA > NC_000913/3118798‑3119066
|
aGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCg > 1:1376579/1‑140 (MQ=255)
gCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGt < 2:1442112/140‑1 (MQ=255)
gCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGt < 1:590811/140‑1 (MQ=255)
cACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTc > 1:1111733/1‑140 (MQ=255)
cACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTc > 1:825371/1‑140 (MQ=255)
cAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGc > 1:213938/1‑140 (MQ=255)
aGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCGGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCt < 2:517047/140‑1 (MQ=255)
gTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTc > 1:2071732/1‑140 (MQ=255)
ttACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTcc > 2:697220/1‑140 (MQ=255)
ttACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTcc > 2:1486591/1‑140 (MQ=255)
ttACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTcc < 1:1733427/140‑1 (MQ=255)
ctACCCCCTGGCTTCCGGCCCGGGTCAGATAACTCGGTTTCGTAGGAACATGTTCTCACGCCTATTCTGGTGTAGGGTCAGGATCAAGAATCGGTTCTGACGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTcc > 2:2021127/2‑140 (MQ=255)
aCCCGCGGGCTTCCGCCCAGTGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCACCCGTCGGCTCCgg > 2:944372/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGt > 1:1539032/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGt < 1:1452047/140‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGtt < 2:1539032/140‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGtt < 2:100519/140‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGtt < 1:2010113/140‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGttt < 1:989568/140‑1 (MQ=255)
gCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGCAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCATAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGttt < 2:1905828/140‑1 (MQ=255)
tGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTgg > 1:378942/1‑140 (MQ=255)
tGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTgg > 1:1260738/1‑140 (MQ=255)
ggCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGgt < 2:213938/140‑1 (MQ=255)
ggCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGgt < 2:2071732/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGgtg < 1:697220/140‑1 (MQ=255)
ccGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTgg > 2:1260467/1‑140 (MQ=255)
cGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGa < 1:1785910/140‑1 (MQ=255)
gCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGAt < 1:178133/140‑1 (MQ=255)
cccAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATc < 1:784347/140‑1 (MQ=255)
gTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGttt > 1:453442/1‑140 (MQ=255)
cAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCa < 2:1111733/140‑1 (MQ=255)
cccGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCgg > 2:2033880/1‑140 (MQ=255)
cccGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCgg > 1:1528575/1‑140 (MQ=255)
cccGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCGCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGTCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGAATCAGGTTTCACTTCCgg > 2:1591437/1‑140 (MQ=255)
ttttCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCaaa < 2:453442/140‑1 (MQ=255)
ttttCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCaaa > 2:390375/1‑140 (MQ=255)
ttttCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCaaa > 2:2149244/1‑140 (MQ=255)
tttCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCaaga > 1:1841530/1‑138 (MQ=255)
ttCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGa > 1:434586/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGAACATGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGAcc < 2:1238190/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGAcc < 1:531556/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGAcc < 1:197046/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGAcc < 1:1760562/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGAcc < 1:784176/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGAcc < 2:825371/140‑1 (MQ=255)
tAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCt > 2:1084059/1‑140 (MQ=255)
gAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGtt < 1:465247/140‑1 (MQ=255)
gAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGtt < 1:2033880/140‑1 (MQ=255)
cAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCa < 1:1631210/140‑1 (MQ=255)
ggTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGa < 1:1486591/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAAtt > 2:728103/1‑139 (MQ=255)
tGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTa > 1:18343/1‑140 (MQ=255)
ggCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTAc > 2:1088863/1‑140 (MQ=255)
cGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcg < 2:783750/140‑1 (MQ=255)
cGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcg > 1:806744/1‑140 (MQ=255)
ggTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcgg > 1:710105/1‑140 (MQ=255)
ggTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcgg > 2:1900228/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcggc < 1:1059286/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTAt < 2:378942/140‑1 (MQ=255)
ggTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATc < 2:58720/140‑1 (MQ=255)
ggTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATc < 1:135552/140‑1 (MQ=255)
ttGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggag > 1:164150/1‑140 (MQ=255)
ggTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggagga < 2:1376579/140‑1 (MQ=255)
ggTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggagga > 2:348224/1‑140 (MQ=255)
ggTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCggagga < 1:390375/140‑1 (MQ=255)
gTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGaa < 1:1088863/140‑1 (MQ=255)
aGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcggc > 2:216794/1‑124 (MQ=255)
aGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAggcggc < 1:216794/124‑1 (MQ=255)
ggTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAacc > 2:400428/1‑140 (MQ=255)
ggTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAacc < 2:1260738/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAaccacc < 2:434586/140‑1 (MQ=255)
tCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAaccaccc > 1:823402/1‑139 (MQ=255)
gTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCa > 2:700200/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCa > 1:349959/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCa < 1:1260467/140‑1 (MQ=255)
gTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGC‑AAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCAt < 2:1841530/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATc > 1:541797/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATcac > 1:851830/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATcac < 1:944372/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATcac > 2:1097440/1‑140 (MQ=255)
gCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACaa < 1:348224/140‑1 (MQ=255)
cGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAAc < 1:1900228/140‑1 (MQ=255)
tAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCg < 1:870671/140‑1 (MQ=255)
aGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACaa < 1:1036799/136‑1 (MQ=255)
aGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACaa > 2:1036799/1‑136 (MQ=255)
ggCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCTGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGGTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCg > 1:951630/1‑138 (MQ=255)
ggCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGc > 2:444828/1‑140 (MQ=255)
ggCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGc > 2:335305/1‑140 (MQ=255)
ggCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGc > 2:54062/1‑140 (MQ=255)
ggCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGc > 2:757361/1‑140 (MQ=255)
tctGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTaa < 1:335305/140‑1 (MQ=255)
tGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACa > 2:540460/1‑140 (MQ=255)
tGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACa > 2:1903973/1‑140 (MQ=255)
tGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACa > 1:1141859/1‑140 (MQ=255)
tGGGTCCGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACa > 2:839411/1‑140 (MQ=255)
ccGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGtt < 1:369373/140‑1 (MQ=255)
cGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGttt > 2:550618/1‑139 (MQ=255)
cGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGTTg > 1:1802883/1‑140 (MQ=255)
cGGCGTTGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGTTg > 2:1756627/1‑140 (MQ=255)
tGGCTCAGCCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGCATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGTTGCGCTCa > 2:747100/1‑140 (MQ=255)
|
AGCACCAGTTACCCGCTGGCTTCCGCCCAGGGTCAGATAACCCGTTTTCGTAGGAACAGGTTCTGGCTCCGGTTCTGGTGTTGGTTCAGGATCAGGTATCGGTTCTGGCGTAGGCTCTGGGTCCGGCGTTGGCTCAGGCGTCGGCTCCGGGTTTGGTGTTGGATCAGGTTTCACTTCCGGCAAAGACCCTGTTCCAGAATCTACAGGCGGCGTATCGGAGGAAGATCCGGAACCACCGCCATCACAACCGGCTAACAGGGTTGCGCTCA > NC_000913/3118798‑3119066
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
