Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F48 I1 R1
|
55 |
131.7 |
4456318 |
99.2% |
4420667 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,121,435 |
G→T |
intergenic (‑156/+199) |
glcA ← / ← glcB |
glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA/malate synthase G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,121,435 | 0 | G | T | 100.0%
| 775.8
/ NA
| 215 | intergenic (‑156/+199) | glcA/glcB | glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA/malate synthase G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (107/108); total (107/108) |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TCTTTATATGCTTGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAAT > NC_000913/3121299‑3121571
|
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tatGCTTGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGt < 1:1195938/140‑1 (MQ=255)
cTTGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTccc > 2:1710098/1‑139 (MQ=255)
cTTGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCg > 1:101979/1‑140 (MQ=255)
cTTGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCg > 1:1562576/1‑140 (MQ=255)
tGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGca > 2:1626353/1‑140 (MQ=255)
tGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGca > 2:195466/1‑140 (MQ=255)
atatACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGcaca > 2:1554131/1‑140 (MQ=255)
atatACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGcaca > 1:226872/1‑140 (MQ=255)
atatACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGcaca < 2:1826920/140‑1 (MQ=255)
ataCTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAGCGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacg < 2:903193/140‑1 (MQ=255)
aCTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgca > 2:53916/1‑140 (MQ=255)
tAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagac > 1:2011156/1‑140 (MQ=255)
aaGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacg < 1:555986/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCCACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacg < 1:1811631/140‑1 (MQ=255)
aGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTAAACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacgc > 2:279501/1‑140 (MQ=255)
ggTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacgca < 1:1447819/140‑1 (MQ=255)
ggTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacgca < 1:1626353/140‑1 (MQ=255)
ggTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacgca < 2:892359/140‑1 (MQ=255)
ttGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACAcgcagacgcaga < 2:618288/140‑1 (MQ=255)
tGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCagag < 2:681683/140‑1 (MQ=255)
gTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGt > 1:1137558/1‑140 (MQ=255)
gTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGt > 2:1855119/1‑140 (MQ=255)
gTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGt > 1:2180543/1‑140 (MQ=255)
gTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACAGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagacg > 1:1975859/1‑134 (MQ=255)
taataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACacgcagac < 2:222813/132‑1 (MQ=255)
taataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTa > 1:2047722/1‑140 (MQ=255)
taataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTa > 2:755684/1‑140 (MQ=255)
taataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTa > 1:2137182/1‑140 (MQ=255)
taataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTa > 1:2104134/1‑140 (MQ=255)
taataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTa < 2:588629/140‑1 (MQ=255)
aataaGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTAt > 2:258880/1‑140 (MQ=255)
aGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTAt < 2:1346920/136‑1 (MQ=255)
aGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGtt < 2:2137182/140‑1 (MQ=255)
gCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTa > 2:730734/1‑140 (MQ=255)
cAAAGGAGGCCTTAATTTTAAAA‑ATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTCCGCCGCTAGCGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAg < 2:1421646/140‑1 (MQ=255)
aaaaGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTAAACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAg < 1:279501/140‑1 (MQ=255)
aaaGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGa < 1:1590206/140‑1 (MQ=255)
gagGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGt < 1:844937/140‑1 (MQ=255)
aCTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCat < 2:92803/140‑1 (MQ=255)
cTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCata > 2:142529/1‑140 (MQ=255)
aCTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATAttgt < 2:2047722/140‑1 (MQ=255)
tGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATAttgttg < 2:1768755/140‑1 (MQ=255)
tAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTgttgtt < 1:657046/140‑1 (MQ=255)
tAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTgttgtt > 1:1102897/1‑140 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg > 2:792638/1‑140 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg < 2:2077775/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg < 2:2180543/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg < 1:1855119/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg < 1:755684/140‑1 (MQ=255)
tataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg < 2:1636410/140‑1 (MQ=255)
aataGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAgg < 2:1781418/139‑1 (MQ=255)
ggCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCg < 1:1245444/140‑1 (MQ=255)
gCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGc > 1:2124344/1‑140 (MQ=255)
tataCTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGt > 1:1165334/1‑140 (MQ=255)
ataCTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTa > 1:871666/1‑140 (MQ=255)
ataCTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTa > 2:2200503/1‑140 (MQ=255)
taCTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTaa < 1:53916/140‑1 (MQ=255)
tACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATgctc < 1:1006784/140‑3 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc < 2:1165334/140‑1 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc < 2:871666/140‑1 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc < 1:792638/140‑1 (MQ=255)
aGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTAc < 1:2201518/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg > 1:1778574/1‑140 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 1:1332934/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 1:49934/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 1:37174/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 1:438288/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg < 2:1019540/140‑1 (MQ=255)
cAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACgg > 1:315999/1‑140 (MQ=255)
gTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTAtt < 2:2124344/140‑1 (MQ=255)
ggccgaTAACGCAATTGCTAACTATGGAATAACAAGTATTTCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAAACGCAAAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTAGTTTTAGGCCCGCTAGTACTGCGCTACGGGTATTTaa < 2:1655716/139‑1 (MQ=255)
cgccgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTaa > 2:1566186/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTaa > 2:2007578/1‑140 (MQ=255)
ccgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAata < 2:1807379/140‑1 (MQ=255)
ccgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATAGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAata < 1:895198/140‑1 (MQ=255)
cgcTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAatat < 2:844079/140‑1 (MQ=255)
cTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTg > 2:1495077/1‑140 (MQ=255)
tAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGt > 2:2013228/1‑140 (MQ=255)
aCGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTa < 1:1726493/140‑1 (MQ=255)
cGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTaa < 2:1074852/140‑1 (MQ=255)
aaTTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAAcc < 2:1229122/140‑1 (MQ=255)
ttGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCt < 1:1618136/140‑1 (MQ=255)
aCCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGCTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATaa > 2:291395/1‑140 (MQ=255)
tGGCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCt > 1:1539034/1‑140 (MQ=255)
gCATAACAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTcc > 1:1312543/1‑140 (MQ=255)
aaCAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGtt > 2:1263319/1‑140 (MQ=255)
aaCAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGtt > 1:1911788/1‑140 (MQ=255)
aCAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTa > 2:1597884/1‑140 (MQ=255)
cAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTAt > 1:351186/1‑140 (MQ=255)
cAAGTATATCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTAt > 2:1044214/1‑140 (MQ=255)
tataTCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTcc < 2:1911788/140‑1 (MQ=255)
tatCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCgg < 1:839805/140‑1 (MQ=255)
atCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCggg < 1:1425242/140‑1 (MQ=255)
atCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCggg < 1:107281/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGa > 1:1802347/1‑140 (MQ=255)
cGGGTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGAt < 1:691939/140‑1 (MQ=255)
ggTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATaa < 1:1710098/140‑1 (MQ=255)
ggTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATaa < 1:1872461/140‑1 (MQ=255)
gTAATGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATaaa > 2:1748548/1‑140 (MQ=255)
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TCTTTATATGCTTGATATACTTAAGGTTGTAATAAGCAAAAGAGGACTGAACTGTAAAATATAGGCGTTATACTTTACAGCAACAGTACGCCGCTAACGCAATTGCTACCTCTGGCATAACAAGTATATCGGGTAAGGGTTTCTGTTCCGCACACGCAGACGCAGAGTATCGTTAAGATGTCCATATTGTTGTTTTAGGCCCGCTAGTAATGCGCTACGGGTATTTAATATTGTTAAACCCTGATAATCGCTCCGGTTATTTCCGGGATAAAT > NC_000913/3121299‑3121571
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
