Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,329,074 |
C→A |
L38M (CTG→ATG) |
dacB → |
peptidoglycan DD‑endopeptidase DacB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,329,074 | 0 | C | A | 100.0%
| 391.4
/ NA
| 112 | L38M (CTG→ATG) | dacB | peptidoglycan DD‑endopeptidase DacB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (62/50); total (62/50) |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CGATTCCAGGTTGTTAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCCTGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCGTTTTA > NC_000913/3328937‑3329209
|
cGATTCCAGGTTGTTAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATg > 1:1838923/1‑140 (MQ=255)
ggTTGTTAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCa > 2:870309/1‑140 (MQ=255)
tgttAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCaaaa > 1:1467526/1‑140 (MQ=255)
ttAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCaaaaat > 2:1116216/1‑139 (MQ=255)
ttAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAg > 1:2141503/1‑140 (MQ=255)
ttAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAg > 1:1220649/1‑140 (MQ=255)
ttAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCC‑ACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGt > 2:1818663/1‑140 (MQ=255)
cgAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCAgcg > 2:752410/1‑140 (MQ=255)
gaTTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGt < 2:1731562/140‑1 (MQ=255)
gaTTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGt < 2:1894457/140‑1 (MQ=255)
aTGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGc < 1:1022748/140‑1 (MQ=255)
aTGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGc < 1:1330333/140‑1 (MQ=255)
gCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGccc < 1:1157491/140‑1 (MQ=255)
aTTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCg < 2:830573/140‑1 (MQ=255)
ttttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGc < 2:1415789/140‑1 (MQ=255)
ttttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGc < 2:1169403/140‑1 (MQ=255)
ttttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGc > 1:1169403/1‑140 (MQ=255)
ttttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGc < 1:81991/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 1:1216435/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 2:1487481/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 2:1220649/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 1:870309/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 1:1773224/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 1:662848/140‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTa < 1:2055526/140‑1 (MQ=255)
ccAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTAtt < 2:893851/140‑1 (MQ=255)
tttATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTa < 2:393671/140‑1 (MQ=255)
ttATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTAtt > 2:325601/1‑134 (MQ=255)
ttATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTAtt < 1:325601/134‑1 (MQ=255)
tATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTAcc < 1:1467194/140‑1 (MQ=255)
tATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTAcc < 2:1838923/140‑1 (MQ=255)
atcatcGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACca > 1:404061/1‑140 (MQ=255)
tcatcGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACcac > 1:2080275/1‑140 (MQ=255)
tcatcGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACcac < 1:1175064/140‑1 (MQ=255)
catcGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACcaca > 2:1965483/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCGAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGAt > 2:86181/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTAcc < 1:2132824/127‑1 (MQ=255)
aCCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTAcc > 2:2132824/1‑127 (MQ=255)
gCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGgcg < 2:51618/140‑1 (MQ=255)
cTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGgcgc > 2:666037/1‑140 (MQ=255)
tGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGct > 1:1845529/1‑140 (MQ=255)
gTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGctg < 2:1882246/140‑1 (MQ=255)
ataGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGctgcc < 2:1780860/140‑1 (MQ=255)
taGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGctgcct > 2:464779/1‑140 (MQ=255)
taGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGctgcct > 2:2142348/1‑140 (MQ=255)
gCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCGAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGctgcctgc < 1:86181/140‑1 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAg > 2:1060706/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAg > 1:1631173/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAg < 1:1116216/140‑1 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAg > 1:1607029/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAg > 1:1541626/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGACGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTACCTGCCAg > 2:2041007/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTGTTCAGGCCGCAAATGGTCATGAGAACATTAGTCAACTCCTCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGTACGAGCAAAACGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGctgcctgctat > 2:837904/1‑137 (MQ=255)
aGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAc < 1:937400/140‑1 (MQ=255)
aGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAc > 2:534128/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAc > 1:1256361/1‑140 (MQ=255)
aGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCC‑ACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAcc < 1:1818663/140‑1 (MQ=255)
aGTGTTCAGGCCGAAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGGGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAc < 2:1129900/140‑1 (MQ=255)
gtgtTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAcc < 2:2141503/140‑1 (MQ=255)
tgtTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACGCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCACCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTAccc < 1:390598/140‑1 (MQ=255)
ttCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAg < 1:1656642/140‑1 (MQ=255)
ttCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAg < 2:775560/140‑1 (MQ=255)
tCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGa < 2:2029773/140‑1 (MQ=255)
tCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCAGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGa < 1:752410/140‑1 (MQ=255)
aGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGaaa > 2:1349496/1‑140 (MQ=255)
ccGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGtt > 2:1733157/1‑139 (MQ=255)
ccGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTg > 1:627433/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTa > 2:1527980/1‑140 (MQ=255)
atgaGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTg > 2:567826/1‑140 (MQ=255)
tgaGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTgg < 2:627433/140‑1 (MQ=255)
tACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTggcggc < 1:1401475/140‑1 (MQ=255)
tACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTggcggc > 2:1229149/1‑140 (MQ=255)
aCATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGgcggcg < 2:364582/140‑1 (MQ=255)
aaTTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGt < 2:81033/139‑1 (MQ=255)
cTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGAtt > 1:1595282/1‑140 (MQ=255)
tCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTc > 1:1480268/1‑140 (MQ=255)
tCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTc > 2:1611151/1‑140 (MQ=255)
tCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTc > 1:1929624/1‑140 (MQ=255)
aaCTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGgcggcg < 2:1665393/131‑1 (MQ=255)
aaCTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCaa > 1:644044/1‑140 (MQ=255)
aaCTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAG‑ACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTg > 1:1998280/1‑124 (MQ=255)
aaCTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAG‑ACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTg < 2:1998280/124‑1 (MQ=255)
cTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACt > 2:2047660/1‑140 (MQ=255)
cTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACt > 2:1754737/1‑140 (MQ=255)
cTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACt < 1:1733157/140‑1 (MQ=255)
cTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACt > 1:1489248/1‑140 (MQ=255)
cTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACGGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACt > 1:742399/1‑140 (MQ=255)
tCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTc > 1:1850392/1‑140 (MQ=255)
cccGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCgt > 2:214741/1‑139 (MQ=255)
cccGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCgg > 2:1569689/1‑140 (MQ=255)
cccGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCgg > 2:1543388/1‑140 (MQ=255)
cccGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCgg > 1:478938/1‑140 (MQ=255)
cGCTGGTGCCAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGcc > 2:80278/1‑140 (MQ=255)
tGCTAACCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGAtt > 1:1301706/1‑140 (MQ=255)
aaCCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCg < 2:754041/140‑1 (MQ=255)
aaCCTTGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCg < 1:2047660/140‑1 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCGTTTTa > 2:1162770/1‑140 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCGTTTTa > 2:248300/1‑140 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCGTTTTa > 2:731069/1‑140 (MQ=255)
tGCCATGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCGTTTTa > 2:496221/1‑140 (MQ=255)
|
CGATTCCAGGTTGTTAGCGCGAGATTATGCGATTTTCCAGATTTATCATCGGATTGACCAGCTGTATAGCGTTCAGTGTTCAGGCCGCAAATGTTGATGAGTACATTACTCAACTCCCCGCTGGTGCCAACCTTGCCCTGATGGTGCAAAAAGTCGGCGCGTCGGCCCCCGCTATTGATTACCACAGTCAGCAGATGGCGCTGCCTGCCAGTACCCAGAAAGTGATTACTGCGCTGGCGGCGTTGATTCAACTCGGCCCCGATTTTCGTTTTA > NC_000913/3328937‑3329209
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
