Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,408,306 |
C→A |
L234M (CTG→ATG) |
panF → |
pantothenate:Na(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,408,306 | 0 | C | A | 100.0%
| 517.0
/ NA
| 149 | L234M (CTG→ATG) | panF | pantothenate:Na(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (81/68); total (81/68) |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GGGCTTGTGATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTCTGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGT > NC_000913/3408171‑3408442
|
gCTTGTGATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCgc < 1:942241/140‑1 (MQ=255)
cTTGTGATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATg > 1:1715673/1‑135 (MQ=255)
cTTGTGATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCgcc > 1:218772/1‑140 (MQ=255)
tgtgATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCgcctg > 1:651858/1‑140 (MQ=255)
tgtgATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCgcctg > 2:627648/1‑140 (MQ=255)
cTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTAt > 2:891744/1‑140 (MQ=255)
cTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTAt > 1:320782/1‑140 (MQ=255)
gCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGAcgtcg > 1:308240/1‑140 (MQ=255)
gCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGAcgtcg < 1:651586/140‑1 (MQ=255)
cGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCt > 1:1324993/1‑140 (MQ=255)
ttGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTgg > 2:1892081/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTggg < 1:627648/140‑1 (MQ=255)
gtgCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGt > 1:686416/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTa < 1:1665643/140‑1 (MQ=255)
gctgctTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTAc > 2:1629780/1‑140 (MQ=255)
gctgctTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTAc < 2:1995757/140‑1 (MQ=255)
ctgctTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTCCt > 1:1119814/1‑140 (MQ=255)
ctTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGgt < 2:1959522/140‑1 (MQ=255)
tATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGgtgt > 1:344745/1‑140 (MQ=255)
tATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGgtgt > 2:1777492/1‑140 (MQ=255)
gtagtaCATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTgg < 2:686416/140‑1 (MQ=255)
gtaCATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGt > 1:198611/1‑140 (MQ=255)
gCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTgg > 2:1979411/1‑140 (MQ=255)
gCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTgg > 2:1445162/1‑140 (MQ=255)
gCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTgg > 1:152384/1‑140 (MQ=255)
gCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTgg > 1:301389/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGc < 1:1665608/140‑1 (MQ=255)
gCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCt < 1:1069182/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGCCCTg > 2:1153502/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGc > 1:2118661/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGc > 2:642522/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGc > 2:213169/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGc > 1:2065032/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGc > 1:148638/1‑140 (MQ=255)
tGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGc > 1:1711656/1‑140 (MQ=255)
ggcTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCa < 1:633548/140‑1 (MQ=255)
gTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCg < 2:1607565/140‑1 (MQ=255)
gTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCg < 2:7585/140‑1 (MQ=255)
aaCGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGt < 2:1711656/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTg < 2:2089253/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTg < 1:317520/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTg < 1:213169/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTg < 2:1324993/140‑1 (MQ=255)
cGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTgc < 1:1445162/140‑1 (MQ=255)
gCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTgcg < 2:678400/140‑1 (MQ=255)
gCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTgcg < 2:2065032/140‑1 (MQ=255)
gCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTgcg < 2:1200062/140‑1 (MQ=255)
cAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTgcgc < 2:1094061/140‑1 (MQ=255)
tACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGt > 1:261016/1‑140 (MQ=255)
aCAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTa > 1:2092418/1‑140 (MQ=255)
aCAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTa > 1:1893802/1‑140 (MQ=255)
cAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGTGGTGCGCTGTAt < 1:1035600/140‑1 (MQ=255)
cAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAt < 1:267323/140‑1 (MQ=255)
cAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAt < 1:1629780/140‑1 (MQ=255)
aaGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAt < 2:883605/139‑1 (MQ=255)
aaGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAt < 2:148638/139‑1 (MQ=255)
aaGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAt < 2:132767/139‑1 (MQ=255)
gACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATCGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAtct < 2:344745/140‑1 (MQ=255)
aCCTTGCAAACCATCGATCTGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAtctc > 1:1191141/1‑140 (MQ=255)
aCCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTAtctc > 2:1934342/1‑140 (MQ=255)
ttGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTta > 2:1297938/1‑140 (MQ=255)
tGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtat < 2:1207906/140‑1 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTg < 2:163909/124‑1 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 2:74505/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 1:1368370/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 2:2017168/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 1:1858494/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 1:429289/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 1:721464/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 2:167335/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 2:555944/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 1:1598157/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 1:1885092/1‑140 (MQ=255)
gCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTtata > 2:747738/1‑140 (MQ=255)
aaaCCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATaaa < 2:320782/140‑1 (MQ=255)
aCCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGa > 2:850644/1‑140 (MQ=255)
cATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACa > 2:1253967/1‑140 (MQ=255)
aTCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAg > 1:1896123/1‑140 (MQ=255)
tCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGc > 1:174467/1‑140 (MQ=255)
cGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCa < 1:560128/140‑1 (MQ=255)
cGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCa < 1:880462/140‑1 (MQ=255)
cGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCa < 1:751496/140‑1 (MQ=255)
aTCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCa < 2:1801646/138‑1 (MQ=255)
aTCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGGCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCa > 1:1801646/1‑138 (MQ=255)
cagCAACTGGTTACGCCAAAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCTTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGc < 2:2092418/138‑1 (MQ=255)
gCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCg < 2:1896123/140‑1 (MQ=255)
gCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCg < 1:555944/140‑1 (MQ=255)
gCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCg < 1:1297938/140‑1 (MQ=255)
aaCTGGTTACGCCACAAGACGCTGACGATATTATATCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGAACTGGTGTGTTTTGGCGTGCTTGGCCTGCCGCCTACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGCCAGCAAAGCCGTa > 2:1423465/1‑140 (MQ=255)
ggTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATc < 2:301389/140‑1 (MQ=255)
ggTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATc < 2:298952/140‑1 (MQ=255)
gTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCg > 2:1652537/1‑140 (MQ=255)
gTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCg > 1:1103822/1‑140 (MQ=255)
tACGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCggg < 1:747738/140‑1 (MQ=255)
aCGCCACAAGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCgggg < 2:1120495/140‑1 (MQ=255)
aaGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGatcatc > 2:478073/1‑140 (MQ=255)
aaGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGatcatc < 2:1891625/140‑1 (MQ=255)
aaGGCGCTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGatcatc > 2:1077705/1‑140 (MQ=255)
gcTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCgg > 1:114628/1‑140 (MQ=255)
gcTGACGATATTATGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCgg > 2:1468005/1‑140 (MQ=255)
|
GGGCTTGTGATGCTGATTGGCACCGTTGTGCTGCTTATTGGCGTAGTACATGCCGCTGGCGGCTTAAGTAACGCAGTACAGACCTTGCAAACCATCGATCCGCAACTGGTTACGCCACAAGGCGCTGACGATATTCTGTCGCCTGCCTTTATGACGTCGTTCTGGGTACTGGTGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGT > NC_000913/3408171‑3408442
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
