Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,499,372 |
C→A |
intergenic (+171/‑76) |
cysG → / → yhfL |
siroheme synthase/DUF4223 domain‑containing lipoprotein YhfL |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,499,372 | 0 | C | A | 100.0%
| 576.8
/ NA
| 164 | intergenic (+171/‑76) | cysG/yhfL | siroheme synthase/DUF4223 domain‑containing lipoprotein YhfL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (59/105); total (59/105) |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
ATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTA > NC_000913/3499235‑3499508
|
aTGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTTTATAGt < 2:1612381/140‑1 (MQ=255)
ctctTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCtt > 2:95450/1‑140 (MQ=255)
tttttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAAc > 1:1830839/1‑140 (MQ=255)
ttttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACg < 1:1438607/140‑1 (MQ=255)
ttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAg < 1:1195107/140‑1 (MQ=255)
ttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAg < 2:388914/140‑1 (MQ=255)
ttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAg < 1:1630556/140‑1 (MQ=255)
ttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAg < 1:1793007/140‑1 (MQ=255)
ttATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTGAACGAg < 1:1826661/140‑1 (MQ=255)
atatatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCa < 1:195299/140‑1 (MQ=255)
tatatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAg < 2:2089615/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 2:1830839/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 2:1683819/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 2:1965837/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 1:1808127/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 2:906473/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 1:1578525/140‑1 (MQ=255)
tatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAg < 1:934879/135‑1 (MQ=255)
tatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTc < 1:1749150/140‑1 (MQ=255)
tatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTc < 2:1298124/140‑1 (MQ=255)
tatTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTc > 2:1923360/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGt < 1:349048/137‑1 (MQ=255)
ttCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTg > 1:703583/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTg > 2:479992/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTgt > 2:1727373/1‑139 (MQ=255)
tCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGc > 2:640442/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGc > 1:1959736/1‑140 (MQ=255)
cAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTtat > 1:193545/1‑140 (MQ=255)
cAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTtat < 1:952044/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTtata < 2:1553196/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTtata < 2:703583/140‑1 (MQ=255)
aTAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATAtt > 1:1367886/1‑140 (MQ=255)
aTAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATAtt > 2:1173346/1‑140 (MQ=255)
aaaaCATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCa < 1:1727373/140‑1 (MQ=255)
aaCATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGTGCAGTCTGCTTATATTCata < 1:779318/140‑1 (MQ=255)
ccccTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCaa > 2:851902/1‑140 (MQ=255)
cccTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAAt < 2:1926600/140‑1 (MQ=255)
cccTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAAt < 1:479992/140‑1 (MQ=255)
cccTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCACTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAAt > 1:236307/1‑140 (MQ=255)
cTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGa > 2:2120100/1‑140 (MQ=255)
cTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGa > 2:1879583/1‑140 (MQ=255)
aataaataTTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAata < 1:1701715/140‑1 (MQ=255)
taaataTTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATatt < 1:216056/140‑1 (MQ=255)
taaataTTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATatt < 1:1173346/140‑1 (MQ=255)
atatTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaat < 1:2120100/140‑1 (MQ=255)
atatTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaat < 1:2030466/140‑1 (MQ=255)
attatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 2:1441975/140‑1 (MQ=255)
attatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 1:851902/140‑1 (MQ=255)
attatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 1:641743/140‑1 (MQ=255)
attatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 2:38675/140‑1 (MQ=255)
attatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 1:160869/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGTTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATtaattaat < 2:1762380/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATtaattaat < 1:1876957/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATtaattaat < 2:754667/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATtaattaat < 1:420388/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATtaattaat < 2:186492/140‑1 (MQ=255)
tatCTGCTAATGGGTTATATTCACCATTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATtaattaat < 1:1908937/140‑1 (MQ=255)
tCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAatat > 2:345772/1‑140 (MQ=255)
tCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAatat > 2:452631/1‑140 (MQ=255)
tCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAatat > 1:1987982/1‑140 (MQ=255)
tGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAatatat < 1:92964/140‑1 (MQ=255)
tGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAatatat < 2:785554/140‑1 (MQ=255)
cTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataa > 2:1095832/1‑140 (MQ=255)
cTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataa > 2:1413687/1‑140 (MQ=255)
cTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataa > 2:1995476/1‑140 (MQ=255)
cTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataa > 2:322345/1‑140 (MQ=255)
tAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataat > 1:1368303/1‑140 (MQ=255)
tAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataat > 2:60123/1‑140 (MQ=255)
aTGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATAc < 1:989119/140‑1 (MQ=255)
ggTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATa < 2:487363/140‑1 (MQ=255)
ttATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAgg < 2:1673889/140‑1 (MQ=255)
atatTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAg > 1:233973/1‑86 (MQ=255)
atatTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGa > 1:671687/1‑140 (MQ=255)
aCCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTaa > 2:155712/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAAt > 2:1165100/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAAt > 1:632939/1‑140 (MQ=255)
cGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGGCATTCGCGCACTGACCCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTAAATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAAt > 2:1101056/1‑140 (MQ=255)
tACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGaa > 2:195855/1‑140 (MQ=255)
aCTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAAttt > 1:1672557/1‑140 (MQ=255)
aCTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAAttt > 1:1804140/1‑140 (MQ=255)
ttACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAAtttgt > 1:1296913/1‑138 (MQ=255)
aaaTTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAg < 1:155712/140‑1 (MQ=255)
aTTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGtt < 2:1804140/140‑1 (MQ=255)
aaGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCa < 1:345772/140‑1 (MQ=255)
aaGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCa < 1:188446/140‑1 (MQ=255)
aaGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCa < 2:1084636/140‑1 (MQ=255)
aTTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGt < 2:632939/140‑1 (MQ=255)
aTTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGt < 1:1095832/140‑1 (MQ=255)
aTTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGt > 2:1402134/1‑140 (MQ=255)
tCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGATCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAg < 2:1768474/140‑1 (MQ=255)
gCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTACTAAAGTTGCACTGGTAGGt < 1:322345/140‑1 (MQ=255)
cTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTg < 2:219180/140‑1 (MQ=255)
aTTAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTAc > 1:567085/1‑140 (MQ=255)
tAAATATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGt < 1:741964/140‑1 (MQ=255)
aaaTATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGtt < 2:1959736/140‑1 (MQ=255)
aaTATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTa < 2:236307/140‑1 (MQ=255)
aaTATTCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTa < 1:1059140/140‑1 (MQ=255)
tCCTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGc < 2:914262/140‑1 (MQ=255)
ccTGTATAGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGCAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGct > 2:1053364/1‑139 (MQ=255)
tataGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTa > 1:1454863/1‑140 (MQ=255)
|
ATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTA > NC_000913/3499235‑3499508
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
