Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,541,735 |
G→T |
A443A (GCG→GCT) |
feoB → |
Fe(2(+)) transporter FeoB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,541,735 | 0 | G | T | 100.0%
| 540.6
/ NA
| 156 | A443A (GCG→GCT) | feoB | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (74/82); total (74/82) |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
ATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGA > NC_000913/3541598‑3541869
|
gtcgGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCtgctgc < 1:2056864/140‑1 (MQ=255)
gtcgGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCtgctgc < 1:2075563/140‑1 (MQ=255)
tcggttGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCttcttc > 1:1176213/1‑140 (MQ=255)
tAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGa > 2:1208441/1‑140 (MQ=255)
aaCGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGaa > 1:945774/1‑140 (MQ=255)
aaCGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGaa < 2:1370150/140‑1 (MQ=255)
gTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACgg < 2:2049216/140‑1 (MQ=255)
tACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGt > 2:256484/1‑140 (MQ=255)
tACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGt < 1:974850/140‑1 (MQ=255)
aCCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTg < 1:206463/140‑1 (MQ=255)
ccGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTgc > 1:1059944/1‑140 (MQ=255)
tCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCt > 1:1187277/1‑140 (MQ=255)
tCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCt > 1:1250841/1‑140 (MQ=255)
tCGGTAATGGGTGCACGCACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGCATTCGCTGCTGCCTTCTCCAGGCAGAACGGTgcgcg > 1:1728579/1‑139 (MQ=255)
gTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGc > 2:2001639/1‑140 (MQ=255)
gggTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCCGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGtct < 1:1006179/140‑1 (MQ=255)
tGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGtcttct > 1:1408709/1‑140 (MQ=255)
tGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGtcttct > 1:581726/1‑140 (MQ=255)
tGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGtcttct < 1:1961857/140‑1 (MQ=255)
gCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTtctc < 2:758978/140‑1 (MQ=255)
gCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTtctc < 2:671860/140‑1 (MQ=255)
gCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTtctc < 2:2070892/140‑1 (MQ=255)
gCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTtctc < 1:112726/140‑1 (MQ=255)
gCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTtctc < 2:1408709/140‑1 (MQ=255)
gCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGAGGTCTtctc < 2:102306/140‑1 (MQ=255)
cACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCg < 1:256484/140‑1 (MQ=255)
cACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCg < 1:2001639/140‑1 (MQ=255)
cACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCg < 1:661003/140‑1 (MQ=255)
cACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCg < 2:817151/140‑1 (MQ=255)
cACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCg < 1:1373440/140‑1 (MQ=255)
aCGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGc > 1:524263/1‑140 (MQ=255)
aCGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGc < 2:150191/140‑1 (MQ=255)
aCGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGc < 1:499348/140‑1 (MQ=255)
aCGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGc > 2:603232/1‑140 (MQ=255)
aCGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGc < 1:2129865/140‑1 (MQ=255)
gTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTg > 2:1369884/1‑140 (MQ=255)
tACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTTCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGt < 1:1215002/140‑1 (MQ=255)
tACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGt < 1:1224488/140‑1 (MQ=255)
cGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGtat > 1:1378005/1‑140 (MQ=255)
cGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGtat > 2:809120/1‑140 (MQ=255)
cTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTatat > 1:202575/1‑140 (MQ=255)
tGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGc < 2:1992964/140‑1 (MQ=255)
tGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGc < 2:1114411/140‑1 (MQ=255)
gATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCt < 1:1553364/140‑1 (MQ=255)
cACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGt > 1:73855/1‑140 (MQ=255)
aCCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTa > 1:437645/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTAt > 1:378969/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTAt > 1:1952339/1‑140 (MQ=255)
cgcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTAtt > 2:1216336/1‑140 (MQ=255)
gcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTAttt > 2:1770883/1‑139 (MQ=255)
gcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATtg > 1:502557/1‑140 (MQ=255)
gcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATtg > 1:724485/1‑140 (MQ=255)
cgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTTTTTGCTGGGATTtgt > 2:139091/1‑140 (MQ=255)
cgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATtgt > 2:415302/1‑140 (MQ=255)
cgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATtgt < 2:1059944/140‑1 (MQ=255)
tGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGa < 2:1267707/140‑1 (MQ=255)
aCGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATgg < 2:867723/140‑1 (MQ=255)
cTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGt < 1:64151/140‑1 (MQ=255)
tgatgaCCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTg < 1:1770883/140‑1 (MQ=255)
atgaCCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCt < 1:1987376/140‑1 (MQ=255)
aatcatGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTg < 2:1176213/139‑1 (MQ=255)
tcatGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGc > 1:253323/1‑140 (MQ=255)
tcatGATGCCACCGGTTGTTTCCTGCGGCGCTCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGTTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGAGGGCCTGCGTTCTTCTCGCTGTATATGCTGTGTATTGTGATGGCGGTGTTGAGTgtc > 2:1292916/1‑138 (MQ=255)
catGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGTGGTGCTGACTGGcc < 1:1101857/140‑1 (MQ=255)
catGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGcc < 2:1898244/140‑1 (MQ=255)
catGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGcc < 2:1094922/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTg < 1:960499/140‑1 (MQ=255)
gatgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGa < 2:253323/140‑1 (MQ=255)
gatgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGa < 1:809120/140‑1 (MQ=255)
gatgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGa < 2:1250841/140‑1 (MQ=255)
tgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATg > 2:1664967/1‑140 (MQ=255)
tgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATg < 1:1664967/140‑1 (MQ=255)
tgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATg > 2:1533151/1‑140 (MQ=255)
tgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATg < 2:524263/140‑1 (MQ=255)
tgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATg > 2:118625/1‑140 (MQ=255)
tgGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATg < 2:650719/140‑1 (MQ=255)
ggCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGc < 2:581726/140‑1 (MQ=255)
cACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTc < 1:1277025/140‑1 (MQ=255)
tATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTaca < 1:1369884/140‑1 (MQ=255)
tGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAATGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACAcc > 1:354956/1‑140 (MQ=255)
ccTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACcatc < 2:1201001/140‑1 (MQ=255)
tGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACcatcat > 1:233745/1‑140 (MQ=255)
gcggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATg > 1:638577/1‑140 (MQ=255)
gcggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATg > 1:1203735/1‑140 (MQ=255)
gcggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATg > 1:844711/1‑140 (MQ=255)
cggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgc > 2:895032/1‑140 (MQ=255)
cggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgc > 2:1147443/1‑140 (MQ=255)
cggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgc > 1:1628660/1‑140 (MQ=255)
cggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGGCTTCTCGCTGTATATGCTGGGCATTCTGATGGCGGCGCTGACTGGCCTGATGCCCAAGTACACcatcattc > 2:1476/1‑138 (MQ=255)
ggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgcg < 2:445424/140‑1 (MQ=255)
ggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgcg < 1:603232/140‑1 (MQ=255)
cgcgcgTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGcgcg > 1:327747/1‑140 (MQ=255)
cgcgTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGt > 1:1018780/1‑140 (MQ=255)
tGGCTATCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCg < 1:139091/140‑1 (MQ=255)
aTCTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGcc < 1:415302/140‑1 (MQ=255)
cTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGt < 1:1204018/140‑1 (MQ=255)
cTTCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGGAAACCATCATGCGCGGTGAAGCCACGCCGt > 2:2141884/1‑140 (MQ=255)
tCGCAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGttt > 2:652337/1‑140 (MQ=255)
cAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTc < 1:148970/140‑1 (MQ=255)
cAGTATTCGCTGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTc > 1:1286729/1‑140 (MQ=255)
|
ATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTGATGCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGA > NC_000913/3541598‑3541869
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
