Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,973,850 |
C→A |
P81P (CCC→CCA) |
rffH → |
dTDP‑glucose pyrophosphorylase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,973,850 | 0 | C | A | 100.0%
| 344.7
/ NA
| 99 | P81P (CCC→CCA) | rffH | dTDP‑glucose pyrophosphorylase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (47/52); total (47/52) |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCG > NC_000913/3973714‑3973984
|
aTCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagccaagc < 2:1477556/140‑1 (MQ=255)
aTCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagccaagc > 1:1320112/1‑140 (MQ=255)
tCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAAcagccaagcc > 1:2014736/1‑140 (MQ=255)
cTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGa > 1:1884093/1‑140 (MQ=255)
cTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGa < 2:1672654/140‑1 (MQ=255)
cTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGa > 2:1462487/1‑140 (MQ=255)
cTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGa < 1:1462487/140‑1 (MQ=255)
cTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGa < 1:431593/140‑1 (MQ=255)
tCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGCTGGTAGTGAGTTCGGAATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACgg > 2:47173/1‑140 (MQ=255)
tCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACgg > 2:1453649/1‑140 (MQ=255)
tCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACgg > 2:1170396/1‑140 (MQ=255)
tCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACgg > 2:828741/1‑140 (MQ=255)
ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTc < 1:1335530/140‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTc < 1:1865092/140‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTc < 1:470341/140‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTc < 1:802831/140‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAACCAAGCCCGGACGGTc < 1:1253283/140‑1 (MQ=255)
gTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCt > 2:193273/1‑140 (MQ=255)
gCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTgg > 2:666180/1‑140 (MQ=255)
tGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGgcg < 1:11722/140‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCa < 1:247705/140‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCa < 1:1104463/140‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCa < 1:1738031/140‑1 (MQ=255)
tGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAg > 1:962302/1‑140 (MQ=255)
tGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAg > 1:96101/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGc > 2:1141388/1‑140 (MQ=255)
tGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGcc < 2:962302/140‑1 (MQ=255)
ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCt > 2:881860/1‑140 (MQ=255)
ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCt > 1:618557/1‑140 (MQ=255)
tATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatca < 1:193273/140‑1 (MQ=255)
tATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatca > 1:1255136/1‑140 (MQ=255)
gcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGt > 1:1975765/1‑140 (MQ=255)
ttCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 2:1975765/140‑1 (MQ=255)
ttCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 2:1537219/140‑1 (MQ=255)
ttCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 2:1320112/140‑1 (MQ=255)
ttCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 1:47173/140‑1 (MQ=255)
atcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcct < 1:881860/140‑1 (MQ=255)
atcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcct < 1:1453649/140‑1 (MQ=255)
tcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcctt < 1:628376/140‑1 (MQ=255)
caCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATg > 1:499868/1‑140 (MQ=255)
caCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATg > 2:500290/1‑140 (MQ=255)
aCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATgg > 1:665173/1‑140 (MQ=255)
atACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGt < 2:162372/139‑1 (MQ=255)
cGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 1:114689/1‑140 (MQ=255)
cGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 1:1251944/1‑140 (MQ=255)
cGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 2:2016275/1‑140 (MQ=255)
cGCCGGAAGATAAAGGTTATCTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGaa > 1:1408783/1‑140 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCTAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 2:897441/140‑1 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACGTTCCTTAATGGTGAACcttc > 2:1449188/1‑140 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc > 1:374536/1‑140 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 2:456538/140‑1 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc > 1:340187/1‑140 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 2:618557/140‑1 (MQ=255)
gAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 1:666180/140‑1 (MQ=255)
aaaGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCt > 2:1542972/1‑140 (MQ=255)
gTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTg < 2:949467/140‑1 (MQ=255)
aTTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTg < 2:374536/140‑1 (MQ=255)
tttCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGTAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTgg > 1:2024043/1‑140 (MQ=255)
ttCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTggg < 2:1019986/140‑1 (MQ=255)
cAGCGGCTGCTGGGCGATGGTAGTTAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGa > 1:144826/1‑140 (MQ=255)
aGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGAt < 1:500290/140‑1 (MQ=255)
aGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGAt < 2:940712/140‑1 (MQ=255)
gcgcCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATa < 2:1255136/140‑1 (MQ=255)
gcgcCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGGATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATa > 1:1893717/1‑140 (MQ=255)
ccTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACa > 1:1440254/1‑140 (MQ=255)
ctgctgGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAt < 2:2014736/140‑1 (MQ=255)
ctgctgGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAt < 1:1170396/140‑1 (MQ=255)
ctgctgGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAt < 1:828741/140‑1 (MQ=255)
ctgctgGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAt < 2:1884093/140‑1 (MQ=255)
gctgGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtct > 1:2085575/1‑140 (MQ=255)
gctgGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtct > 2:1959066/1‑140 (MQ=255)
gggCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtcttct < 1:1141388/140‑1 (MQ=255)
gggCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtcttct < 1:1542972/140‑1 (MQ=255)
aTGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGt < 1:755173/140‑1 (MQ=255)
aTGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGt > 1:671657/1‑140 (MQ=255)
aTGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGt > 1:1918483/1‑140 (MQ=255)
aTGGTAATGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGt < 2:1165374/140‑1 (MQ=255)
tGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTc > 2:1619327/1‑140 (MQ=255)
gTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGc < 2:337714/140‑1 (MQ=255)
tGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCt > 1:1288871/1‑140 (MQ=255)
gAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCtt < 2:1918483/140‑1 (MQ=255)
ttCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAg > 2:1975695/1‑140 (MQ=255)
aTCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGaa > 2:2054255/1‑140 (MQ=255)
tCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAg < 2:1893717/140‑1 (MQ=255)
cAGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCt < 1:1449188/140‑1 (MQ=255)
aGCTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTg < 2:96101/140‑1 (MQ=255)
cTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGAGGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGACCCGTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCg < 2:1408783/140‑1 (MQ=255)
cTGGAATATGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCg < 2:340187/140‑1 (MQ=255)
atGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGtt < 1:2016275/140‑1 (MQ=255)
tGCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGttt > 2:1015283/1‑139 (MQ=255)
gCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgc > 1:280996/1‑140 (MQ=255)
gCCGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgc > 2:1568241/1‑140 (MQ=255)
ccGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcg < 2:665173/140‑1 (MQ=255)
ccGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcg < 2:1251944/140‑1 (MQ=255)
ccGAACAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcg > 2:1996936/1‑140 (MQ=255)
aaCAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcggcg < 2:2085575/140‑1 (MQ=255)
aaCAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcggcc > 1:996885/1‑139 (MQ=255)
aCAGCCAAGCCGGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgc > 1:1268699/1‑140 (MQ=255)
aCAGCCAAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgc > 2:306847/1‑140 (MQ=255)
cagccaagccCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgcg < 2:499868/140‑1 (MQ=255)
|
ATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCG > NC_000913/3973714‑3973984
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
