Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,456,746 |
C→A |
A321E (GCG→GAG) |
mpl → |
UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanyl‑gamma‑D‑glutamyl‑ meso‑2,6‑diaminoheptanedioate ligase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,456,746 | 0 | C | A | 100.0%
| 360.4
/ NA
| 104 | A321E (GCG→GAG) | mpl | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanyl‑gamma‑D‑glutamyl‑ meso‑2,6‑diaminoheptanedioate ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (57/47); total (57/47) |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GGCGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGCGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATACCATGA > NC_000913/4456613‑4456880
|
ggCGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATgg < 2:827225/140‑1 (MQ=255)
ggCGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATgg < 1:1788783/140‑1 (MQ=255)
gCGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGc < 1:101858/140‑1 (MQ=255)
cGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCGGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCg < 2:2009441/140‑1 (MQ=255)
cGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCg < 2:1416877/140‑1 (MQ=255)
gAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGt < 2:148572/140‑1 (MQ=255)
aCATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCa < 2:642842/140‑1 (MQ=255)
cATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCAc < 2:1412731/140‑1 (MQ=255)
atatGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGta < 2:1545530/140‑1 (MQ=255)
tatGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGGTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGCGAAGAGAATGGCGTCACGGtat > 1:1981667/1‑140 (MQ=255)
gCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATg > 2:1288777/1‑140 (MQ=255)
cacaATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTTGCGCCGGCAGATCCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGa > 1:1163077/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGGTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGa > 2:1999337/1‑140 (MQ=255)
aTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAt > 2:691783/1‑140 (MQ=255)
aTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAt > 2:1022723/1‑140 (MQ=255)
aTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAt > 1:1619103/1‑140 (MQ=255)
aTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAt > 2:364193/1‑140 (MQ=255)
aTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAt > 2:361539/1‑140 (MQ=255)
aTGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCCTACGCGCTGGGTTCGGTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGACAATGGCGTCACGGTATATGACGAt > 2:1747871/1‑140 (MQ=255)
tGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAtt > 1:824891/1‑140 (MQ=255)
tGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAtt > 1:1048883/1‑140 (MQ=255)
ggCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAttt < 1:729743/140‑1 (MQ=255)
ggCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAttt < 2:2025833/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAttttt > 2:1364592/1‑139 (MQ=255)
ccTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAttttt > 2:1243327/1‑139 (MQ=255)
ccTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGGTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGAttttt > 2:667313/1‑139 (MQ=255)
tGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGcc < 1:316055/140‑1 (MQ=255)
gATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGccc > 1:655240/1‑140 (MQ=255)
tGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCAt > 1:719414/1‑140 (MQ=255)
aGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACgg < 1:1878013/140‑1 (MQ=255)
cGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCg > 1:358020/1‑140 (MQ=255)
cGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCg > 2:1938732/1‑140 (MQ=255)
gCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGAt > 1:1175266/1‑140 (MQ=255)
tCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGAttt > 2:747191/1‑139 (MQ=255)
cGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCt > 1:1039523/1‑140 (MQ=255)
ccATGTTGGTGGAGCGCCGGCAGATGCCCCCAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAATTGCGTGGTTCAGAGAATGGCGGCACGGTATATGACGATTTTGCCCCTCACCCGACGGCGATTCTgg > 2:1339283/1‑140 (MQ=255)
cATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGc > 2:1817092/1‑140 (MQ=255)
cATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGc < 2:655240/140‑1 (MQ=255)
ggTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCt > 1:882547/1‑140 (MQ=255)
tgtAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTTTTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTgg > 1:649466/1‑140 (MQ=255)
tgtAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTgg > 1:1782105/1‑140 (MQ=255)
gcgcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTggcggc > 1:1511765/1‑140 (MQ=255)
cgcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGgcggcg < 1:1938732/140‑1 (MQ=255)
cgcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGgcggcg > 1:661375/1‑140 (MQ=255)
cgcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGgcggcg > 2:1168406/1‑140 (MQ=255)
cgcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGgcggcg > 2:753361/1‑140 (MQ=255)
gcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGgcgc > 1:931129/1‑140 (MQ=255)
gcCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGgcgc > 1:1695464/1‑140 (MQ=255)
ggCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGc > 2:1642859/1‑140 (MQ=255)
gCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCg > 2:341034/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTAATAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCAACACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGc < 2:649466/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCa > 2:1049295/1‑140 (MQ=255)
gCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCaa > 2:302058/1‑140 (MQ=255)
gCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGt < 1:224925/140‑1 (MQ=255)
gCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGt < 1:1138207/140‑1 (MQ=255)
gcTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTa < 1:1312797/140‑1 (MQ=255)
tGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACg < 1:1022723/140‑1 (MQ=255)
tGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACg < 1:364193/140‑1 (MQ=255)
ggTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgc > 1:1587128/1‑140 (MQ=255)
ggTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgc < 2:1619103/140‑1 (MQ=255)
gTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgcg < 1:753361/140‑1 (MQ=255)
gTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgcg < 1:1168406/140‑1 (MQ=255)
gTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgcg < 2:1511765/140‑1 (MQ=255)
tCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgcgcg < 2:1038731/140‑1 (MQ=255)
tCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGgcgcg < 2:882547/140‑1 (MQ=255)
tttATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCat > 2:570421/1‑140 (MQ=255)
tttATTAATGCCCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCGCCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCat < 1:1340170/140‑1 (MQ=255)
taATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtg < 1:1584666/140‑1 (MQ=255)
taATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtg < 1:1804253/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgc < 1:463540/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgc < 2:1587128/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgc < 1:361539/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgc < 1:1454915/140‑1 (MQ=255)
aaTGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgc < 1:341034/140‑1 (MQ=255)
gCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgt > 1:1392934/1‑140 (MQ=255)
gCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgt > 2:484185/1‑140 (MQ=255)
cTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtg > 2:1966643/1‑140 (MQ=255)
cTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtg > 1:1772248/1‑140 (MQ=255)
tcgtcgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtgc > 2:357477/1‑140 (MQ=255)
tcgtcgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtgc > 1:707033/1‑140 (MQ=255)
cgtcgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtgct > 2:2110215/1‑140 (MQ=255)
cgtcgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtgct < 2:1392934/140‑1 (MQ=255)
gtcgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATtgctgtgctg > 2:1980329/1‑140 (MQ=255)
tcgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTgg > 2:354136/1‑140 (MQ=255)
cgCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGa > 1:2078516/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCcg < 1:570421/140‑1 (MQ=255)
gTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCcg < 1:1049295/140‑1 (MQ=255)
tCTGGAGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCcgc > 2:442194/1‑140 (MQ=255)
aGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCg < 1:354136/140‑1 (MQ=255)
aGTTGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCg < 2:1443743/140‑1 (MQ=255)
ttGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGaa < 2:1163077/140‑1 (MQ=255)
ttGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGaa < 1:1243327/140‑1 (MQ=255)
ttGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGaa < 2:707033/140‑1 (MQ=255)
ttGCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGaa < 1:747191/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATa < 2:358020/140‑1 (MQ=255)
cGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATAc > 1:1261592/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATAc > 1:2096701/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTGAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATAc > 2:812543/1‑140 (MQ=255)
tgAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATACCATGa > 1:1418290/1‑140 (MQ=255)
tgAAGAGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATACCATGa > 1:1946617/1‑140 (MQ=255)
|
GGCGAACATAATATGCACAATGGCCTGATGGCGATTGCAGCGGCTCGCCATGTTGGTGTAGCGCCGGCAGATGCCGCTAACGCGCTGGGTTCGTTTATTAATGCTCGTCGCCGTCTGGAGTTGCGTGGTGAAGCGAATGGCGTCACGGTATATGACGATTTTGCCCATCACCCGACGGCGATTCTGGCAACGCTGGCGGCGCTGCGTGGCAAAGTTGGTGGTACGGCGCGCATTATTGCTGTGCTGGAGCCGCGCTCGAATACCATGA > NC_000913/4456613‑4456880
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
