Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,476,042 |
G→T |
Q202H (CAG→CAT) |
yjgL → |
protein YjgL |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,476,042 | 0 | G | T | 99.4%
| 550.1
/ ‑3.0
| 159 | Q202H (CAG→CAT) | yjgL | protein YjgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (74/84); total (74/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.55e-01 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GAAAAGATGAGAGTTCATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAT > NC_000913/4475906‑4476177
|
gaaaagaTGAGAGTTCATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAg < 1:888040/140‑1 (MQ=255)
agaTGAGAGTTCATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTaa < 2:2058688/140‑1 (MQ=255)
gaTGAGAGTTCATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTaaa < 1:1890735/140‑1 (MQ=255)
tGAGAGTTCATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAaata < 1:1912704/140‑1 (MQ=255)
cATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTg < 1:1373873/140‑1 (MQ=255)
aTTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGa > 1:863056/1‑140 (MQ=255)
tACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTATATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAg < 1:924160/140‑1 (MQ=255)
tACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAg < 2:2035892/140‑1 (MQ=255)
tACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAg < 1:1622939/140‑1 (MQ=255)
cacCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGtt < 1:1826527/140‑1 (MQ=255)
cacCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGtt < 2:2080204/140‑1 (MQ=255)
cacCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGtt < 2:1191854/140‑1 (MQ=255)
cacCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGtt < 2:1442375/140‑1 (MQ=255)
aacCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGtt < 2:918376/139‑1 (MQ=255)
ccTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTaa < 2:1985454/140‑1 (MQ=255)
cTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTaaa > 2:2082140/1‑140 (MQ=255)
cTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTaaa < 2:1624897/140‑1 (MQ=255)
cTGAATACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTaaa > 1:578891/1‑140 (MQ=255)
gATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAaata > 2:748484/1‑140 (MQ=255)
gATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAaata < 1:1765210/140‑1 (MQ=255)
gATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAaata > 2:784366/1‑140 (MQ=255)
gATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAaata < 2:390607/140‑1 (MQ=255)
gATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAaata > 2:1389386/1‑140 (MQ=255)
tACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAataata > 1:848379/1‑140 (MQ=255)
cTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAAtata > 2:964108/1‑140 (MQ=255)
cTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAAtata < 1:1273557/140‑1 (MQ=255)
aaCAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACa < 2:1980860/140‑1 (MQ=255)
aCAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAg > 2:1032520/1‑140 (MQ=255)
aCAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAg < 2:1157313/140‑1 (MQ=255)
aCAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAg > 1:1235259/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAatat < 1:358088/128‑1 (MQ=255)
cTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTaaa < 2:160904/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTaaa > 1:68978/1‑140 (MQ=255)
ttACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTc > 2:2151036/1‑140 (MQ=255)
ttACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTc > 1:1059986/1‑140 (MQ=255)
ttACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTc > 2:1282094/1‑140 (MQ=255)
aCCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAg < 2:1226205/140‑1 (MQ=255)
aaaGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAg > 1:71478/1‑140 (MQ=255)
aaGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAaat > 2:1302811/1‑140 (MQ=255)
aaGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAaat > 2:872243/1‑140 (MQ=255)
gCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAaataa > 1:757490/1‑140 (MQ=255)
aCAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCg < 1:207007/140‑1 (MQ=255)
aaaaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGaa > 1:1883367/1‑140 (MQ=255)
aaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAAtt > 2:951016/1‑140 (MQ=255)
aGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTaa > 1:1643040/1‑140 (MQ=255)
aGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTaa > 1:1352983/1‑140 (MQ=255)
gcgcGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTaaa < 2:1235259/140‑1 (MQ=255)
gcgcGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTaaa < 1:1272005/140‑1 (MQ=255)
cgcgTCTATTAAATAAAAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAAt > 1:363659/1‑140 (MQ=255)
gcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATg < 2:931876/140‑1 (MQ=255)
cgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGa < 1:954202/140‑1 (MQ=255)
cgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGa > 1:788174/1‑140 (MQ=255)
tCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGAtt < 2:848379/140‑1 (MQ=255)
tATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATtct < 2:1552082/140‑1 (MQ=255)
aTTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATtctc < 1:1032520/140‑1 (MQ=255)
aTTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATtctc < 1:399481/140‑1 (MQ=255)
aataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGa < 2:1643040/140‑1 (MQ=255)
taataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGt > 2:1080496/1‑140 (MQ=255)
taatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaa > 1:293706/1‑140 (MQ=255)
aatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaaa > 1:2042008/1‑140 (MQ=255)
atCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAAt > 2:365821/1‑140 (MQ=255)
atCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAAt > 2:1141451/1‑140 (MQ=255)
aGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCg > 2:26321/1‑140 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 2:1154920/140‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 1:1139137/140‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 1:1389386/140‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 1:1498244/140‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 1:219636/140‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 2:68978/140‑1 (MQ=255)
gTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGATAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCGCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATACTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 2:865851/140‑1 (MQ=255)
ttAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa > 2:1902623/1‑140 (MQ=255)
ttAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa > 2:611688/1‑140 (MQ=255)
ttAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa > 1:103772/1‑140 (MQ=255)
tAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAg > 2:802315/1‑140 (MQ=255)
aaaTAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAgg > 2:1439858/1‑140 (MQ=255)
aataatCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGa > 1:383126/1‑140 (MQ=255)
atCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTa > 1:1486194/1‑140 (MQ=255)
atCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTa > 1:1199489/1‑140 (MQ=255)
tCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaa > 1:1926595/1‑140 (MQ=255)
tCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaa > 2:1941490/1‑140 (MQ=255)
cTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa < 2:970322/140‑1 (MQ=255)
cTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa < 2:293706/140‑1 (MQ=255)
cTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa < 1:1080496/140‑1 (MQ=255)
tACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 2:393992/1‑140 (MQ=255)
tACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 1:613061/1‑140 (MQ=255)
aCAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATATTATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATa > 2:2133443/1‑140 (MQ=255)
aGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGt > 2:57766/1‑140 (MQ=255)
aaTTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCca < 2:960832/140‑1 (MQ=255)
aaTTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCca < 1:464816/140‑1 (MQ=255)
aTTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCACGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcac < 2:2019747/140‑1 (MQ=255)
ttAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcaca < 2:1926595/140‑1 (MQ=255)
ttAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcaca > 2:1100650/1‑140 (MQ=255)
tAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg < 1:1633321/140‑1 (MQ=255)
tAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg < 1:2151036/140‑1 (MQ=255)
tAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg < 1:2082140/140‑1 (MQ=255)
tAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg < 1:1902623/140‑1 (MQ=255)
tAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAAACCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg < 2:321484/140‑1 (MQ=255)
ataatCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 1:964108/140‑1 (MQ=255)
cTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaaa > 1:789646/1‑140 (MQ=255)
tACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAt > 2:1723532/1‑140 (MQ=255)
|
GAAAAGATGAGAGTTCATTACACCTGATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAT > NC_000913/4475906‑4476177
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
